Protein–RNA interactions for Protein: O14656

TOR1A, Torsin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1AO14656 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOR1AO14656 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TOR1AO14656 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TOR1AO14656 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR1AO14656 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR1AO14656 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR1AO14656 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR1AO14656 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOR1AO14656 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms