Protein–RNA interactions for Protein: O14656

TOR1A, Torsin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1AO14656 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOR1AO14656 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOR1AO14656 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOR1AO14656 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOR1AO14656 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOR1AO14656 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TOR1AO14656 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOR1AO14656 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOR1AO14656 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOR1AO14656 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOR1AO14656 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOR1AO14656 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOR1AO14656 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOR1AO14656 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOR1AO14656 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOR1AO14656 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOR1AO14656 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOR1AO14656 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOR1AO14656 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOR1AO14656 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOR1AO14656 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOR1AO14656 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOR1AO14656 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOR1AO14656 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOR1AO14656 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOR1AO14656 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOR1AO14656 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOR1AO14656 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOR1AO14656 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOR1AO14656 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOR1AO14656 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOR1AO14656 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOR1AO14656 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOR1AO14656 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOR1AO14656 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOR1AO14656 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOR1AO14656 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOR1AO14656 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOR1AO14656 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOR1AO14656 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOR1AO14656 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOR1AO14656 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOR1AO14656 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOR1AO14656 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TOR1AO14656 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOR1AO14656 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOR1AO14656 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOR1AO14656 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOR1AO14656 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TOR1AO14656 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOR1AO14656 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOR1AO14656 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOR1AO14656 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOR1AO14656 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOR1AO14656 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOR1AO14656 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOR1AO14656 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOR1AO14656 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOR1AO14656 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOR1AO14656 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOR1AO14656 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOR1AO14656 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TOR1AO14656 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TOR1AO14656 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOR1AO14656 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOR1AO14656 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOR1AO14656 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOR1AO14656 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOR1AO14656 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOR1AO14656 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOR1AO14656 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOR1AO14656 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOR1AO14656 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOR1AO14656 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOR1AO14656 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOR1AO14656 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOR1AO14656 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOR1AO14656 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOR1AO14656 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOR1AO14656 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOR1AO14656 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TOR1AO14656 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOR1AO14656 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOR1AO14656 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOR1AO14656 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOR1AO14656 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOR1AO14656 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOR1AO14656 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOR1AO14656 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOR1AO14656 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOR1AO14656 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOR1AO14656 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOR1AO14656 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOR1AO14656 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOR1AO14656 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR1AO14656 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOR1AO14656 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOR1AO14656 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOR1AO14656 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOR1AO14656 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms