Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.21e-11■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 NAE1-209ENST00000563185 401 ntTSL 522.05■■□□□ 1.121e-11■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 NAE1-221ENST00000569388 562 ntTSL 521.98■■□□□ 1.111e-11■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.051e-11■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 NAE1-213ENST00000564040 536 ntTSL 521.2■□□□□ 0.981e-11■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 NAE1-214ENST00000565535 580 ntTSL 520.59■□□□□ 0.891e-11■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 NAE1-220ENST00000569348 567 ntTSL 420.59■□□□□ 0.891e-11■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 NAE1-208ENST00000562757 585 ntTSL 220.59■□□□□ 0.891e-11■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 NAE1-222ENST00000569963 719 ntTSL 220.59■□□□□ 0.891e-11■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 NAE1-212ENST00000563419 649 ntTSL 419.86■□□□□ 0.771e-11■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 NAE1-218ENST00000567743 1460 ntTSL 1 (best)18.35■□□□□ 0.531e-11■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 NAE1-205ENST00000561579 728 ntTSL 58.89□□□□□ -0.991e-11■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 NAE1-211ENST00000563253 566 ntTSL 36.37□□□□□ -1.391e-11■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 NAE1-215ENST00000566336 686 ntTSL 54.81□□□□□ -1.641e-11■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.465e-9■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.455e-9■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 DGAT2-207ENST00000604935 618 ntTSL 413.09□□□□□ -0.315e-9■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 DGAT2-203ENST00000603276 747 ntTSL 510.82□□□□□ -0.685e-9■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 ZNF74-205ENST00000420626 591 ntTSL 424.28■■□□□ 1.482e-6■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 ZNF74-208ENST00000493734 3758 ntTSL 215.61■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 SPAG4-206ENST00000468248 1181 ntTSL 522.7■■□□□ 1.223e-7■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.045e-10■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.665e-10■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.623e-7■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.615e-10■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 SPAG4-205ENST00000463973 981 ntTSL 517.16■□□□□ 0.343e-7■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.235e-10■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 BMP1-211ENST00000520970 4333 ntTSL 1 (best)15.65■□□□□ 0.15e-10■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.035e-10■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 AD000671.1-201ENST00000591613 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.355e-10■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 SPAG4-204ENST00000462896 368 ntTSL 310.68□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 SPAG4-203ENST00000454819 827 ntTSL 310.68□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 PSENEN-201ENST00000222266 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.715e-10■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 KIF13A-213ENST00000636847 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.772e-34■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.872e-34■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 NENF-204ENST00000479589 845 ntTSL 224.2■■□□□ 1.462e-9■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 NENF-203ENST00000473900 875 ntTSL 221.64■■□□□ 1.056e-14■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.922e-9■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 BLVRA-204ENST00000453612 757 ntTSL 218.26■□□□□ 0.512e-11■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 BLVRA-203ENST00000424330 443 ntTSL 315.32■□□□□ 0.042e-11■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 RB1CC1-206ENST00000518710 711 ntTSL 326.99■■□□□ 1.916e-8■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 RB1CC1-208ENST00000521611 528 ntTSL 522.24■■□□□ 1.156e-8■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 RB1CC1-203ENST00000517963 551 ntTSL 418.08■□□□□ 0.486e-8■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 RB1CC1-204ENST00000518211 891 ntTSL 517.5■□□□□ 0.396e-8■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.216e-8■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.126e-8■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 RB1CC1-205ENST00000518468 507 ntTSL 34.99□□□□□ -1.616e-8■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 FAM217B-204ENST00000469084 880 ntTSL 215.91■□□□□ 0.141e-12■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 FAM217B-201ENST00000358293 5152 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.031e-12■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 FAM217B-202ENST00000360816 5036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.171e-12■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.291e-11■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 ST3GAL4-214ENST00000531217 1745 ntTSL 522.34■■□□□ 1.171e-11■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.091e-11■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 ST3GAL4-220ENST00000534733 545 ntTSL 518.6■□□□□ 0.571e-11■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 SLC25A39-205ENST00000585636 561 ntTSL 223.38■■□□□ 1.331e-22■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 SLC25A39-206ENST00000585695 1121 ntTSL 223.38■■□□□ 1.331e-22■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.331e-22■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.231e-22■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.051e-22■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 SLC25A39-210ENST00000588315 1409 ntTSL 221.31■■□□□ 11e-22■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.81e-22■■■■■ 37.2
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DDX3XO00571 SLC25A39-204ENST00000585523 574 ntTSL 419.98■□□□□ 0.791e-22■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 SLC25A39-208ENST00000586633 566 ntTSL 317.49■□□□□ 0.391e-22■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.051e-22■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 SLC25A39-214ENST00000591151 636 ntTSL 214.26□□□□□ -0.131e-22■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.771e-16■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 ALDOC-209ENST00000584086 686 ntTSL 314.47□□□□□ -0.091e-16■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 ALDOC-208ENST00000582381 571 ntTSL 213.49□□□□□ -0.251e-16■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 ALDOC-202ENST00000395319 1519 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.341e-16■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 ALDOC-203ENST00000395321 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.371e-16■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 ALDOC-207ENST00000581807 580 ntTSL 311.82□□□□□ -0.521e-16■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 KATNB1-206ENST00000566611 3854 ntTSL 216.48■□□□□ 0.232e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 KATNB1-208ENST00000566785 619 ntTSL 215.86■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 KATNB1-210ENST00000569627 622 ntTSL 312.53□□□□□ -0.41e-8■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.25e-12■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.015e-12■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.915e-12■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.835e-12■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 CD55-209ENST00000488171 1389 ntTSL 319.58■□□□□ 0.735e-12■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.415e-12■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.922e-8■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.712e-8■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.532e-8■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 02e-8■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.332e-8■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 TRAPPC3-206ENST00000469757 221 ntTSL 28.62□□□□□ -1.032e-8■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 ACAA2-205ENST00000587994 1657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.288e-9■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 ACAA2-203ENST00000586100 639 ntTSL 412.71□□□□□ -0.378e-9■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 ACAA2-201ENST00000285093 3350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.488e-9■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.28e-9■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 ACAA2-204ENST00000586485 727 ntTSL 25.41□□□□□ -1.548e-9■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 ZBED1-204ENST00000461691 947 ntTSL 214.11□□□□□ -0.158e-8■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 C1orf198-205ENST00000521263 996 ntTSL 329.87■■■□□ 2.374e-9■■■■■ 37.2
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