RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468248.5

SPAG4-206, Transcript of sperm associated antigen 4, humanhuman

TSL 5

Gene SPAG4, Length 1,181 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4-206ENST00000468248 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.3■■■■■ 6.12
SPAG4-206ENST00000468248 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.49■■■■■ 5.19
SPAG4-206ENST00000468248 ABCC9O60706 1549 aa46.54■■■■■ 5.04
SPAG4-206ENST00000468248 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.73■■■■■ 4.75
SPAG4-206ENST00000468248 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.71■■■■■ 4.75
SPAG4-206ENST00000468248 NACADO15069 1562 aa44.6■■■■■ 4.73
SPAG4-206ENST00000468248 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.42■■■■■ 4.7
SPAG4-206ENST00000468248 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.2■■■■■ 4.67
SPAG4-206ENST00000468248 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.04■■■■■ 4.64
SPAG4-206ENST00000468248 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.73■■■■■ 4.59
SPAG4-206ENST00000468248 SCRIBQ14160 1630 aa43.44■■■■■ 4.54
SPAG4-206ENST00000468248 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.43■■■■■ 4.54
SPAG4-206ENST00000468248 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.27■■■■■ 4.52
SPAG4-206ENST00000468248 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.81■■■■■ 4.44
SPAG4-206ENST00000468248 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.53■■■■■ 4.4
SPAG4-206ENST00000468248 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
SPAG4-206ENST00000468248 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.07■■■■■ 4.33
SPAG4-206ENST00000468248 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.78■■■■■ 4.28
SPAG4-206ENST00000468248 SMARCA4P51532 1647 aa41.45■■■■■ 4.23
SPAG4-206ENST00000468248 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.22
SPAG4-206ENST00000468248 SMARCA2P51531 1590 aa41.16■■■■■ 4.18
SPAG4-206ENST00000468248 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.15■■■■■ 4.18
SPAG4-206ENST00000468248 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.1■■■■■ 4.17
SPAG4-206ENST00000468248 NCAPD3P42695 1498 aa41.07■■■■■ 4.16
SPAG4-206ENST00000468248 HMGXB3Q12766 1538 aa40.97■■■■■ 4.15
SPAG4-206ENST00000468248 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.93■■■■■ 4.14
SPAG4-206ENST00000468248 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
SPAG4-206ENST00000468248 WIZO95785 1651 aa40.73■■■■■ 4.11
SPAG4-206ENST00000468248 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.08
SPAG4-206ENST00000468248 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
SPAG4-206ENST00000468248 NESP48681 1621 aa40.22■■■■■ 4.03
SPAG4-206ENST00000468248 ERCC6Q03468 1493 aa40.19■■■■■ 4.02
SPAG4-206ENST00000468248 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.11■■■■■ 4.01
SPAG4-206ENST00000468248 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.91■■■■□ 3.98
SPAG4-206ENST00000468248 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.83■■■■□ 3.97
SPAG4-206ENST00000468248 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.82■■■■□ 3.97
SPAG4-206ENST00000468248 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.74■■■■□ 3.95
SPAG4-206ENST00000468248 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
SPAG4-206ENST00000468248 CFTRP13569 1480 aa39.66■■■■□ 3.94
SPAG4-206ENST00000468248 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
SPAG4-206ENST00000468248 CUX2O14529 1486 aa39.64■■■■□ 3.94
SPAG4-206ENST00000468248 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.55■■■■□ 3.92
SPAG4-206ENST00000468248 PRDM2Q13029 1718 aa39.54■■■■□ 3.92
SPAG4-206ENST00000468248 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.54■■■■□ 3.92
SPAG4-206ENST00000468248 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.46■■■■□ 3.91
SPAG4-206ENST00000468248 WDR62O43379 1518 aa39.3■■■■□ 3.88
SPAG4-206ENST00000468248 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
SPAG4-206ENST00000468248 TOPBP1Q92547 1522 aa38.89■■■■□ 3.82
SPAG4-206ENST00000468248 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.87■■■■□ 3.81
SPAG4-206ENST00000468248 ABCC8Q09428 1581 aa38.85■■■■□ 3.81
SPAG4-206ENST00000468248 IFT140Q96RY7 1462 aa38.66■■■■□ 3.78
SPAG4-206ENST00000468248 CUX1P39880 1505 aa38.58■■■■□ 3.77
SPAG4-206ENST00000468248 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.55■■■■□ 3.76
SPAG4-206ENST00000468248 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.5■■■■□ 3.75
SPAG4-206ENST00000468248 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
SPAG4-206ENST00000468248 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.45■■■■□ 3.75
SPAG4-206ENST00000468248 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
SPAG4-206ENST00000468248 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.41■■■■□ 3.74
SPAG4-206ENST00000468248 SOGA1O94964 1423 aa38.38■■■■□ 3.74
SPAG4-206ENST00000468248 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.34■■■■□ 3.73
SPAG4-206ENST00000468248 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.34■■■■□ 3.73
SPAG4-206ENST00000468248 SYNJ1O43426 1573 aa38.28■■■■□ 3.72
SPAG4-206ENST00000468248 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.27■■■■□ 3.72
SPAG4-206ENST00000468248 TOP2BQ02880 1626 aa38.26■■■■□ 3.71
SPAG4-206ENST00000468248 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.25■■■■□ 3.714e-8■■■■■ 30.6
SPAG4-206ENST00000468248 WDR97A6NE52 1622 aa38.19■■■■□ 3.7
SPAG4-206ENST00000468248 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.19■■■■□ 3.7
SPAG4-206ENST00000468248 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.05■■■■□ 3.68
SPAG4-206ENST00000468248 PBRM1Q86U86 1689 aa38.01■■■■□ 3.67
SPAG4-206ENST00000468248 CHD1O14646 1710 aa37.98■■■■□ 3.67
SPAG4-206ENST00000468248 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.97■■■■□ 3.67
SPAG4-206ENST00000468248 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.97■■■■□ 3.67
SPAG4-206ENST00000468248 GRIN2BQ13224 1484 aa37.96■■■■□ 3.67
SPAG4-206ENST00000468248 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.96■■■■□ 3.67
SPAG4-206ENST00000468248 OSCARQ8IYS5 282 aa37.95■■■■□ 3.67
SPAG4-206ENST00000468248 FBLN2P98095 1184 aa37.91■■■■□ 3.66
SPAG4-206ENST00000468248 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
SPAG4-206ENST00000468248 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
SPAG4-206ENST00000468248 SYNJ2O15056 1496 aa37.72■■■■□ 3.63
SPAG4-206ENST00000468248 ADAMTS12P58397 1594 aa37.65■■■■□ 3.62
SPAG4-206ENST00000468248 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.62■■■■□ 3.61
SPAG4-206ENST00000468248 KIF27Q86VH2 1401 aa37.55■■■■□ 3.6
SPAG4-206ENST00000468248 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.51■■■■□ 3.59
SPAG4-206ENST00000468248 GRIN2AQ12879 1464 aa37.49■■■■□ 3.59
SPAG4-206ENST00000468248 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.45■■■■□ 3.59
SPAG4-206ENST00000468248 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.45■■■■□ 3.59
SPAG4-206ENST00000468248 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.45■■■■□ 3.59
SPAG4-206ENST00000468248 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.44■■■■□ 3.58
SPAG4-206ENST00000468248 TRIM41Q8WV44 630 aa37.43■■■■□ 3.58
SPAG4-206ENST00000468248 ARHGEF11O15085 1522 aa37.41■■■■□ 3.58
SPAG4-206ENST00000468248 CUL7Q14999 1698 aa37.37■■■■□ 3.57
SPAG4-206ENST00000468248 CEP170Q5SW79 1584 aa37.32■■■■□ 3.56
SPAG4-206ENST00000468248 IGF1RP08069 1367 aa37.27■■■■□ 3.56
SPAG4-206ENST00000468248 NUP160Q12769 1436 aa37.25■■■■□ 3.55
SPAG4-206ENST00000468248 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.15■■■■□ 3.54
SPAG4-206ENST00000468248 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.14■■■■□ 3.54
SPAG4-206ENST00000468248 ARAP1Q96P48 1450 aa37.1■■■■□ 3.53
SPAG4-206ENST00000468248 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.05■■■■□ 3.52
SPAG4-206ENST00000468248 SHROOM2Q13796 1616 aa37.01■■■■□ 3.52
SPAG4-206ENST00000468248 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.95■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms