RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473900.1

NENF-203, Transcript of neudesin neurotrophic factor, humanhuman

TSL 2

Gene NENF, Length 875 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENF-203ENST00000473900 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.56■■■■■ 6.01
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NENF-203ENST00000473900 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.45■■■■■ 4.71
NENF-203ENST00000473900 NACADO15069 1562 aa44.26■■■■■ 4.68
NENF-203ENST00000473900 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.07■■■■■ 4.65
NENF-203ENST00000473900 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.82■■■■■ 4.61
NENF-203ENST00000473900 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.69■■■■■ 4.58
NENF-203ENST00000473900 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.56■■■■■ 4.56
NENF-203ENST00000473900 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.45■■■■■ 4.55
NENF-203ENST00000473900 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.27■■■■■ 4.52
NENF-203ENST00000473900 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.16■■■■■ 4.5
NENF-203ENST00000473900 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.05■■■■■ 4.48
NENF-203ENST00000473900 SCRIBQ14160 1630 aa42.86■■■■■ 4.45
NENF-203ENST00000473900 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.6■■■■■ 4.41
NENF-203ENST00000473900 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
NENF-203ENST00000473900 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.01■■■■■ 4.32
NENF-203ENST00000473900 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.77■■■■■ 4.28
NENF-203ENST00000473900 SMARCA4P51532 1647 aa40.93■■■■■ 4.14
NENF-203ENST00000473900 NCAPD3P42695 1498 aa40.83■■■■■ 4.13
NENF-203ENST00000473900 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.79■■■■■ 4.12
NENF-203ENST00000473900 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
NENF-203ENST00000473900 SMARCA2P51531 1590 aa40.73■■■■■ 4.11
NENF-203ENST00000473900 HMGXB3Q12766 1538 aa40.62■■■■■ 4.09
NENF-203ENST00000473900 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.52■■■■■ 4.08
NENF-203ENST00000473900 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.52■■■■■ 4.08
NENF-203ENST00000473900 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
NENF-203ENST00000473900 WIZO95785 1651 aa40.09■■■■■ 4.01
NENF-203ENST00000473900 NESP48681 1621 aa40.05■■■■■ 4
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NENF-203ENST00000473900 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.63■■■■□ 3.93
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NENF-203ENST00000473900 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.59■■■■□ 3.93
NENF-203ENST00000473900 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
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NENF-203ENST00000473900 CFTRP13569 1480 aa39.28■■■■□ 3.88
NENF-203ENST00000473900 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.23■■■■□ 3.87
NENF-203ENST00000473900 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.18■■■■□ 3.86
NENF-203ENST00000473900 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.17■■■■□ 3.86
NENF-203ENST00000473900 WDR62O43379 1518 aa39.14■■■■□ 3.86
NENF-203ENST00000473900 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.13■■■■□ 3.85
NENF-203ENST00000473900 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.11■■■■□ 3.85
NENF-203ENST00000473900 PRDM2Q13029 1718 aa39.07■■■■□ 3.85
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NENF-203ENST00000473900 TOPBP1Q92547 1522 aa38.51■■■■□ 3.76
NENF-203ENST00000473900 ABCC8Q09428 1581 aa38.44■■■■□ 3.74
NENF-203ENST00000473900 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.44■■■■□ 3.74
NENF-203ENST00000473900 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
NENF-203ENST00000473900 IFT140Q96RY7 1462 aa38.36■■■■□ 3.73
NENF-203ENST00000473900 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
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NENF-203ENST00000473900 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.98■■■■□ 3.67
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NENF-203ENST00000473900 WDR97A6NE52 1622 aa37.79■■■■□ 3.64
NENF-203ENST00000473900 CHD1O14646 1710 aa37.78■■■■□ 3.64
NENF-203ENST00000473900 TRIM41Q8WV44 630 aa37.65■■■■□ 3.62
NENF-203ENST00000473900 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.62■■■■□ 3.61
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NENF-203ENST00000473900 TOP2BQ02880 1626 aa37.59■■■■□ 3.61
NENF-203ENST00000473900 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.58■■■■□ 3.61
NENF-203ENST00000473900 FBLN2P98095 1184 aa37.58■■■■□ 3.61
NENF-203ENST00000473900 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.58■■■■□ 3.61
NENF-203ENST00000473900 GRIN2BQ13224 1484 aa37.58■■■■□ 3.61
NENF-203ENST00000473900 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.58■■■■□ 3.61
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NENF-203ENST00000473900 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.58■■■■□ 3.61
NENF-203ENST00000473900 SYNJ1O43426 1573 aa37.57■■■■□ 3.6
NENF-203ENST00000473900 PBRM1Q86U86 1689 aa37.56■■■■□ 3.6
NENF-203ENST00000473900 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.54■■■■□ 3.6
NENF-203ENST00000473900 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.52■■■■□ 3.6
NENF-203ENST00000473900 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.52■■■■□ 3.6
NENF-203ENST00000473900 ARHGEF11O15085 1522 aa37.47■■■■□ 3.59
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NENF-203ENST00000473900 ADAMTS12P58397 1594 aa37.2■■■■□ 3.55
NENF-203ENST00000473900 ARAP1Q96P48 1450 aa37.14■■■■□ 3.54
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NENF-203ENST00000473900 CEP170Q5SW79 1584 aa36.99■■■■□ 3.51
NENF-203ENST00000473900 NUP160Q12769 1436 aa36.95■■■■□ 3.51
NENF-203ENST00000473900 KIF27Q86VH2 1401 aa36.82■■■■□ 3.48
NENF-203ENST00000473900 SHROOM2Q13796 1616 aa36.78■■■■□ 3.48
NENF-203ENST00000473900 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.78■■■■□ 3.48
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NENF-203ENST00000473900 IGF1RP08069 1367 aa36.72■■■■□ 3.47
NENF-203ENST00000473900 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.67■■■■□ 3.46
NENF-203ENST00000473900 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
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