Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 MBD6-206ENST00000548550 563 ntTSL 414.82□□□□□ -0.042e-10■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CNOT1-206ENST00000564557 582 ntTSL 313.01□□□□□ -0.331e-11■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CNOT1-217ENST00000569263 304 ntTSL 212.76□□□□□ -0.371e-11■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CNOT1-215ENST00000569020 535 ntTSL 412.7□□□□□ -0.381e-11■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CNOT1-213ENST00000568158 496 ntTSL 312.55□□□□□ -0.41e-11■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CNOT1-220ENST00000569916 599 ntTSL 312.41□□□□□ -0.421e-11■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 NSD3-208ENST00000528627 1524 ntTSL 24.61□□□□□ -1.672e-10■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 SMCHD1-206ENST00000581631 729 ntTSL 32.69□□□□□ -1.982e-10■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CTSA-206ENST00000480961 513 ntTSL 219.79■□□□□ 0.762e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 KANSL1-233ENST00000640519 1970 ntTSL 318.13■□□□□ 0.491e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 KANSL1-207ENST00000573682 358 ntTSL 315.19■□□□□ 0.021e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 KANSL1-219ENST00000638291 745 ntTSL 514.18□□□□□ -0.141e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 KANSL1-227ENST00000639467 677 ntTSL 513.15□□□□□ -0.31e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 KANSL1-235ENST00000640751 464 ntTSL 513.15□□□□□ -0.31e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 KANSL1-220ENST00000638551 899 ntTSL 510.97□□□□□ -0.651e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 KANSL1-232ENST00000640092 1529 ntTSL 57.57□□□□□ -1.21e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 DHX38-212ENST00000569935 907 ntTSL 214.53□□□□□ -0.085e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 SNRPG-209ENST00000488400 393 ntTSL 27.13□□□□□ -1.275e-9■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 TRIM25-203ENST00000570473 498 ntTSL 39.33□□□□□ -0.929e-8■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.019e-7■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 ZNF652-203ENST00000508237 4543 ntTSL 213.75□□□□□ -0.219e-7■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.259e-7■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 BAIAP2-227ENST00000576470 593 ntTSL 219.61■□□□□ 0.732e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-207ENST00000578134 831 ntTSL 316.84■□□□□ 0.297e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-215ENST00000579780 611 ntTSL 316.69■□□□□ 0.267e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-230ENST00000584042 638 ntTSL 316.69■□□□□ 0.267e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-228ENST00000583363 558 ntTSL 416.24■□□□□ 0.197e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-206ENST00000578018 567 ntTSL 215.47■□□□□ 0.077e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-236ENST00000584991 1862 ntTSL 515.33■□□□□ 0.047e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-218ENST00000580391 1957 ntTSL 515.2■□□□□ 0.027e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.027e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-237ENST00000585163 2519 ntTSL 1 (best)14.9□□□□□ -0.027e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-219ENST00000580670 1768 ntTSL 513.91□□□□□ -0.187e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-226ENST00000583182 709 ntTSL 313.62□□□□□ -0.237e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-202ENST00000536708 1975 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.297e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 AC018521.1-202ENST00000641877 2655 ntBASIC13.17□□□□□ -0.37e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-217ENST00000580287 2609 ntTSL 1 (best)12.99□□□□□ -0.337e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-234ENST00000584525 530 ntTSL 412.49□□□□□ -0.417e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-232ENST00000584168 2684 ntTSL 512.31□□□□□ -0.447e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-203ENST00000577442 617 ntTSL 412.28□□□□□ -0.447e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-231ENST00000584063 2759 ntTSL 1 (best)12.09□□□□□ -0.477e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-213ENST00000579605 560 ntTSL 411.97□□□□□ -0.497e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-222ENST00000581708 543 ntTSL 411.82□□□□□ -0.527e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-212ENST00000579175 867 ntTSL 311.66□□□□□ -0.547e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-216ENST00000579853 714 ntTSL 411.27□□□□□ -0.617e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-204ENST00000577664 568 ntTSL 410.96□□□□□ -0.657e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-235ENST00000584592 372 ntTSL 510.96□□□□□ -0.657e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-214ENST00000579632 738 ntTSL 410.46□□□□□ -0.737e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-208ENST00000578525 564 ntTSL 49.74□□□□□ -0.857e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-227ENST00000583352 901 ntTSL 39.44□□□□□ -0.97e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-220ENST00000581160 490 ntTSL 39.07□□□□□ -0.967e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-224ENST00000582275 442 ntTSL 58.01□□□□□ -1.137e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDK5RAP3-221ENST00000581662 557 ntTSL 26.76□□□□□ -1.337e-16■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 SNRPA1-215ENST00000561187 509 ntTSL 225.11■■□□□ 1.612e-8■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.72e-8■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.52e-8■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 STXBP2-216ENST00000599648 472 ntTSL 218.15■□□□□ 0.52e-8■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 POR-213ENST00000448410 1104 ntTSL 315.79■□□□□ 0.121e-7■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 ATG9A-211ENST00000434939 568 ntTSL 414.34□□□□□ -0.112e-8■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 SNRPA1-204ENST00000558020 466 ntTSL 312.72□□□□□ -0.372e-8■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 PUM2-209ENST00000440577 4352 ntTSL 1 (best)6.18□□□□□ -1.422e-11■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 VWDE-202ENST00000326715 1394 ntTSL 513.87□□□□□ -0.195e-7■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 MED15-224ENST00000476767 590 ntTSL 415.76■□□□□ 0.113e-15■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 AC016723.1-202ENST00000436982 643 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.062e-11■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 KATNBL1-214ENST00000560671 924 ntTSL 214.15□□□□□ -0.142e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 KATNBL1-213ENST00000560310 597 ntTSL 46.16□□□□□ -1.422e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 KATNBL1-212ENST00000560308 725 ntTSL 34.95□□□□□ -1.622e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 KATNBL1-204ENST00000558473 575 ntTSL 43.04□□□□□ -1.922e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 RBM39-227ENST00000470563 384 ntTSL 34.72□□□□□ -1.653e-10■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 RBM39-228ENST00000471635 549 ntTSL 23.05□□□□□ -1.923e-10■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 SMARCD2-204ENST00000450364 993 ntTSL 512.94□□□□□ -0.343e-9■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 ATAD2-208ENST00000550993 438 ntTSL 36.75□□□□□ -1.332e-8■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.117e-7■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.327e-7■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 ANLN-210ENST00000457743 757 ntTSL 54.92□□□□□ -1.627e-7■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 ANLN-205ENST00000428612 707 ntTSL 54.85□□□□□ -1.637e-7■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 BAIAP2-224ENST00000575989 565 ntTSL 417.81■□□□□ 0.441e-6■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 BAIAP2-217ENST00000574688 575 ntTSL 517.57■□□□□ 0.41e-6■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 BAIAP2-221ENST00000575750 584 ntTSL 414.36□□□□□ -0.111e-6■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 BAIAP2-207ENST00000571530 581 ntTSL 413.43□□□□□ -0.261e-6■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 BAIAP2-215ENST00000573894 657 ntTSL 311.5□□□□□ -0.571e-6■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 BAIAP2-223ENST00000575958 567 ntTSL 411.31□□□□□ -0.61e-6■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 BAIAP2-226ENST00000576364 542 ntTSL 510.47□□□□□ -0.731e-6■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 BAIAP2-213ENST00000573659 578 ntTSL 48.56□□□□□ -1.041e-6■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 BAIAP2-212ENST00000573017 574 ntTSL 48.34□□□□□ -1.071e-6■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 BAIAP2-211ENST00000572918 626 ntTSL 46.73□□□□□ -1.331e-6■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 PLXNB1-205ENST00000461261 851 ntTSL 511.29□□□□□ -0.66e-13■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 CYTH1-205ENST00000586175 874 ntTSL 211.24□□□□□ -0.614e-8■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 CYTH1-207ENST00000586430 573 ntTSL 38.95□□□□□ -0.984e-8■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 SEPT9-222ENST00000589070 582 ntTSL 317.24■□□□□ 0.355e-8■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 SEPT9-240ENST00000591833 576 ntTSL 413.31□□□□□ -0.285e-8■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.575e-9■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.035e-9■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 MGRN1-209ENST00000588015 651 ntTSL 512.21□□□□□ -0.452e-6■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 SAP30BP-226ENST00000584861 579 ntTSL 216.49■□□□□ 0.235e-10■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 DDX23-208ENST00000551098 1083 ntTSL 216.32■□□□□ 0.25e-10■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 SAP30BP-204ENST00000577292 1097 ntTSL 215.74■□□□□ 0.115e-10■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 SAP30BP-219ENST00000583170 553 ntTSL 415.74■□□□□ 0.115e-10■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 SAP30BP-205ENST00000578288 870 ntTSL 1 (best)14.11□□□□□ -0.155e-10■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 SAP30BP-222ENST00000583737 525 ntTSL 413.88□□□□□ -0.195e-10■□□□□ 9.9
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