Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms