Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.461e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.491e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.238e-7■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.088e-7■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.138e-7■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.388e-7■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.438e-7■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.468e-7■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 SEPT9-205ENST00000427674 3937 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.488e-7■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 DPF2-208ENST00000531989 1573 ntTSL 318.86■□□□□ 0.612e-6■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.492e-6■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 DPF2-201ENST00000252268 2462 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 DPF2-209ENST00000532052 3165 ntTSL 29.31□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 DPF2-204ENST00000524666 4840 ntTSL 28.91□□□□□ -0.982e-6■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.11e-9■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 ZYX-208ENST00000468083 1146 ntTSL 524.25■■□□□ 1.473e-8■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 ZYX-209ENST00000477373 504 ntTSL 411.8□□□□□ -0.527e-9■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 MDC1-206ENST00000489540 1402 ntTSL 219.26■□□□□ 0.676e-6■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.271e-7■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.271e-7■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.491e-7■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.621e-7■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 TNS1-209ENST00000446688 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.794e-8■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.951e-7■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.118e-22■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.128e-22■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 C20orf96-201ENST00000360321 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.378e-22■■■■□ 23.6
PCBP1Q15365 EIF4G2-203ENST00000524932 1286 ntTSL 523.24■■□□□ 1.318e-15■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 EIF4G2-228ENST00000534246 523 ntTSL 217.67■□□□□ 0.428e-15■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 EIF4G2-210ENST00000527419 571 ntTSL 516.88■□□□□ 0.298e-15■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 EIF4G2-216ENST00000530702 563 ntTSL 214.79□□□□□ -0.048e-15■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 EIF4G2-214ENST00000530211 591 ntTSL 212.53□□□□□ -0.48e-15■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 EIF4G2-219ENST00000531507 591 ntTSL 511.56□□□□□ -0.568e-15■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 EIF4G2-226ENST00000532570 573 ntTSL 511.17□□□□□ -0.628e-15■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 EIF4G2-201ENST00000339995 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.868e-15■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 EIF4G2-212ENST00000528562 601 ntTSL 49.23□□□□□ -0.938e-15■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 EIF4G2-206ENST00000525972 584 ntTSL 26.88□□□□□ -1.318e-15■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.461e-8■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.021e-8■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.251e-8■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.286e-12■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.46e-12■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.26e-12■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.072e-8■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.072e-8■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.129e-7■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.719e-7■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 CIDEB-203ENST00000554411 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.739e-7■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.351e-6■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.051e-6■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.411e-6■■■■□ 23.5
PCBP1Q15365 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.078e-44■■■■□ 23.4
PCBP1Q15365 PA2G4-206ENST00000552766 1085 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.328e-44■■■■□ 23.4
PCBP1Q15365 MIER2-205ENST00000619835 1748 ntTSL 318.81■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 23.4
PCBP1Q15365 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.542e-6■■■■□ 23.4
PCBP1Q15365 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.543e-6■■■■□ 23.4
PCBP1Q15365 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.443e-6■■■■□ 23.4
PCBP1Q15365 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.222e-7■■■■□ 23.4
PCBP1Q15365 KDELR1-205ENST00000600980 815 ntTSL 39.78□□□□□ -0.844e-8■■■■□ 23.4
PCBP1Q15365 KDELR1-204ENST00000599084 582 ntTSL 29.3□□□□□ -0.924e-8■■■■□ 23.4
PCBP1Q15365 GABBR1-213ENST00000485508 825 ntTSL 524.58■■□□□ 1.535e-7■■■■□ 23.4
PCBP1Q15365 GABBR1-216ENST00000489385 871 ntTSL 523.17■■□□□ 1.35e-7■■■■□ 23.4
PCBP1Q15365 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.975e-7■■■■□ 23.4
PCBP1Q15365 GABBR1-220ENST00000494877 2364 ntTSL 518.12■□□□□ 0.495e-7■■■■□ 23.4
PCBP1Q15365 PRRC2A-206ENST00000464890 593 ntTSL 216.3■□□□□ 0.24e-16■■■■□ 23.4
PCBP1Q15365 PFKFB4-207ENST00000445633 1733 ntTSL 1 (best)25.56■■□□□ 1.683e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 PFKFB4-205ENST00000417753 1744 ntTSL 1 (best)25.56■■□□□ 1.683e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.653e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.593e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.583e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 MBD3-208ENST00000590830 1035 ntTSL 1 (best)24.75■■□□□ 1.553e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 AAMP-210ENST00000494720 1134 ntTSL 224.39■■□□□ 1.493e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 USF2-204ENST00000593708 474 ntTSL 323.98■■□□□ 1.433e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 MBD3-205ENST00000589064 1475 ntTSL 223■■□□□ 1.273e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.023e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 CTSH-214ENST00000534038 593 ntTSL 420.96■□□□□ 0.953e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 CTSH-216ENST00000534268 622 ntTSL 520.96■□□□□ 0.953e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 MBD3-209ENST00000592012 2379 ntTSL 520.71■□□□□ 0.913e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 CTSH-206ENST00000528436 268 ntTSL 320.27■□□□□ 0.843e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 PFKFB4-213ENST00000490115 1757 ntTSL 1 (best)20.16■□□□□ 0.823e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 PFKFB4-208ENST00000452531 1011 ntTSL 520.16■□□□□ 0.823e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 CTSH-211ENST00000530010 556 ntTSL 219.93■□□□□ 0.783e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 FAM189B-206ENST00000481822 2103 ntTSL 219.89■□□□□ 0.777e-7■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 CTSH-210ENST00000529861 857 ntTSL 319.74■□□□□ 0.753e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 TFR2-204ENST00000462090 1844 ntTSL 519.65■□□□□ 0.743e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 FLNA-215ENST00000474358 696 ntTSL 219.61■□□□□ 0.732e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.693e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.633e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.633e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 FLNA-209ENST00000444578 843 ntTSL 318.75■□□□□ 0.592e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 TFR2-212ENST00000476304 2421 ntTSL 518.22■□□□□ 0.513e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 TFR2-213ENST00000490084 2196 ntTSL 217.77■□□□□ 0.443e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 THEM6-202ENST00000518798 2279 ntTSL 217.12■□□□□ 0.333e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 PFKFB4-206ENST00000422701 636 ntTSL 317.1■□□□□ 0.333e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 TMEM214-206ENST00000435172 1480 ntTSL 517.1■□□□□ 0.338e-8■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 PFKFB4-215ENST00000496767 779 ntTSL 516.84■□□□□ 0.293e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.283e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 AAMP-209ENST00000489767 1833 ntTSL 516.81■□□□□ 0.283e-6■■■■□ 23.3
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