RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593708.1

USF2-204, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

TSL 3

Gene USF2, Length 474 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-204ENST00000593708 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.44■■■■■ 6.3
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USF2-204ENST00000593708 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.88■■■■■ 5.42
USF2-204ENST00000593708 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.49■■■■■ 5.03
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USF2-204ENST00000593708 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.82■■■■■ 4.93
USF2-204ENST00000593708 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.6■■■■■ 4.89
USF2-204ENST00000593708 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.52■■■■■ 4.88
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USF2-204ENST00000593708 SCRIBQ14160 1630 aa44.57■■■■■ 4.72
USF2-204ENST00000593708 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.51■■■■■ 4.72
USF2-204ENST00000593708 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.19■■■■■ 4.66
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USF2-204ENST00000593708 NCAPD3P42695 1498 aa42.62■■■■■ 4.41
USF2-204ENST00000593708 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.51■■■■■ 4.4
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USF2-204ENST00000593708 SMARCA2P51531 1590 aa42.36■■■■■ 4.37
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USF2-204ENST00000593708 NESP48681 1621 aa42.03■■■■■ 4.32
USF2-204ENST00000593708 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.98■■■■■ 4.31
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USF2-204ENST00000593708 WIZO95785 1651 aa41.49■■■■■ 4.23
USF2-204ENST00000593708 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.36■■■■■ 4.21
USF2-204ENST00000593708 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.3■■■■■ 4.2
USF2-204ENST00000593708 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.09■■■■■ 4.17
USF2-204ENST00000593708 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.16
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USF2-204ENST00000593708 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.87■■■■■ 4.13
USF2-204ENST00000593708 CFTRP13569 1480 aa40.86■■■■■ 4.13
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USF2-204ENST00000593708 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.45■■■■■ 4.07
USF2-204ENST00000593708 TRIM41Q8WV44 630 aa40.22■■■■■ 4.03
USF2-204ENST00000593708 TOPBP1Q92547 1522 aa40.11■■■■■ 4.01
USF2-204ENST00000593708 OSCARQ8IYS5 282 aa40.09■■■■■ 4.01
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USF2-204ENST00000593708 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.73■■■■□ 3.95
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USF2-204ENST00000593708 ARHGEF11O15085 1522 aa39.58■■■■□ 3.93
USF2-204ENST00000593708 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.57■■■■□ 3.93
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USF2-204ENST00000593708 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.45■■■■□ 3.91
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USF2-204ENST00000593708 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
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USF2-204ENST00000593708 WDR97A6NE52 1622 aa39.32■■■■□ 3.88
USF2-204ENST00000593708 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.29■■■■□ 3.88
USF2-204ENST00000593708 ARAP1Q96P48 1450 aa39.21■■■■□ 3.87
USF2-204ENST00000593708 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.19■■■■□ 3.86
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USF2-204ENST00000593708 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.01■■■■□ 3.84
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USF2-204ENST00000593708 IGF1RP08069 1367 aa37.97■■■■□ 3.67
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