Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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IFT88Q13099 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFT88Q13099 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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