Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms