Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 GLA-207ENST00000493905 1358 ntTSL 511.9□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 PABPC1L-213ENST00000481196 488 ntTSL 510.9□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 UNC119-205ENST00000484980 4189 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 GLA-201ENST00000218516 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 FKBP5-204ENST00000542713 7384 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.753e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 SRSF9-204ENST00000548792 1446 ntTSL 29.67□□□□□ -0.861e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 U2SURP-210ENST00000485374 470 ntTSL 48.31□□□□□ -1.081e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 U2SURP-206ENST00000470400 881 ntTSL 37.96□□□□□ -1.141e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 U2SURP-213ENST00000491827 824 ntTSL 37.63□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 U2SURP-201ENST00000461591 1580 ntTSL 27.6□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.223e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 GLA-202ENST00000466414 618 ntTSL 26.88□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 U2SURP-204ENST00000465175 571 ntTSL 45.92□□□□□ -1.461e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 U2SURP-217ENST00000600150 725 ntTSL 55.92□□□□□ -1.461e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.531e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 EIF2AK3-202ENST00000415570 2902 ntTSL 1 (best)5.42□□□□□ -1.541e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.257e-7■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 FLNA-206ENST00000420627 8225 ntTSL 515.88■□□□□ 0.137e-7■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.067e-7■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.057e-7■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.057e-7■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 RBM39-217ENST00000448303 1008 ntTSL 57.41□□□□□ -1.226e-7■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 PPP4R1-228ENST00000584074 625 ntTSL 322.86■■□□□ 1.254e-10■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 PPP4R1-221ENST00000582240 578 ntTSL 422.26■■□□□ 1.154e-10■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 PPP4R1-215ENST00000580182 582 ntTSL 319.99■□□□□ 0.794e-10■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 PPP4R1-219ENST00000581250 578 ntTSL 412.75□□□□□ -0.374e-10■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 PPP4R1-218ENST00000580745 535 ntTSL 411.88□□□□□ -0.514e-10■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 PPP4R1-208ENST00000578178 468 ntTSL 411.63□□□□□ -0.554e-10■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 PPP4R1-220ENST00000581835 379 ntTSL 210.94□□□□□ -0.664e-10■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 PPP4R1-212ENST00000579415 563 ntTSL 48.42□□□□□ -1.064e-10■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 PPP4R1-211ENST00000578875 580 ntTSL 48.34□□□□□ -1.074e-10■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 PPP4R1-214ENST00000579638 566 ntTSL 48.12□□□□□ -1.114e-10■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 PPP4R1-223ENST00000582933 579 ntTSL 47.42□□□□□ -1.224e-10■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 PPP4R1-226ENST00000583903 549 ntTSL 47.36□□□□□ -1.234e-10■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 PPP4R1-217ENST00000580583 743 ntTSL 56.79□□□□□ -1.324e-10■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 EIF4G1-224ENST00000444861 2384 ntTSL 1 (best)23.14■■□□□ 1.291e-6■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 GSTP1-203ENST00000467591 736 ntTSL 212.05□□□□□ -0.485e-7■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 DVL3-204ENST00000435708 559 ntTSL 524.3■■□□□ 1.483e-10■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 DVL3-205ENST00000462665 668 ntTSL 524.15■■□□□ 1.463e-10■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 13e-10■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 DVL3-202ENST00000423300 1099 ntTSL 519.76■□□□□ 0.753e-10■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 DVL3-207ENST00000478247 2272 ntTSL 519.67■□□□□ 0.743e-10■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 STXBP2-210ENST00000595950 552 ntTSL 523.97■■□□□ 1.431e-6■■■■■ 39.2
UTP3Q9NQZ2 DRAP1-204ENST00000525501 695 ntTSL 529.5■■■□□ 2.313e-6■■■■■ 39.1
UTP3Q9NQZ2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.493e-6■■■■■ 39.1
UTP3Q9NQZ2 DRAP1-207ENST00000531121 672 ntTSL 323.08■■□□□ 1.293e-6■■■■■ 39.1
UTP3Q9NQZ2 DRAP1-209ENST00000534333 453 ntTSL 220.73■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 39.1
UTP3Q9NQZ2 DRAP1-206ENST00000530791 837 ntTSL 220.11■□□□□ 0.813e-6■■■■■ 39.1
UTP3Q9NQZ2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 39.1
UTP3Q9NQZ2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.553e-6■■■■■ 39.1
UTP3Q9NQZ2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 39.1
UTP3Q9NQZ2 AES-210ENST00000590067 1100 ntTSL 217.54■□□□□ 0.42e-12■■■■■ 39.1
UTP3Q9NQZ2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.237e-8■■■■■ 39.1
UTP3Q9NQZ2 AES-212ENST00000592414 3274 ntTSL 213.42□□□□□ -0.262e-12■■■■■ 39.1
UTP3Q9NQZ2 MED15-214ENST00000441501 840 ntTSL 317.95■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 39.1
UTP3Q9NQZ2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.482e-6■■■■■ 39.1
UTP3Q9NQZ2 SIAH1-207ENST00000568007 2683 ntTSL 1 (best)13.34□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 39.1
UTP3Q9NQZ2 SIAH1-204ENST00000563745 589 ntTSL 48.94□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 39.1
UTP3Q9NQZ2 AC011476.3-201ENST00000593060 786 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 39.1
UTP3Q9NQZ2 SET-208ENST00000477806 957 ntTSL 1 (best)12.14□□□□□ -0.472e-11■■■■■ 39.1
UTP3Q9NQZ2 PKP4-209ENST00000479398 550 ntTSL 522.09■■□□□ 1.139e-7■■■■■ 39.1
UTP3Q9NQZ2 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.237e-7■■■■■ 39
UTP3Q9NQZ2 COPG1-210ENST00000515725 3231 ntTSL 210.18□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 39
UTP3Q9NQZ2 COPG1-201ENST00000314797 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.972e-6■■■■■ 39
UTP3Q9NQZ2 TECR-205ENST00000594807 569 ntTSL 412.84□□□□□ -0.359e-7■■■■■ 39
UTP3Q9NQZ2 CHTF18-217ENST00000567620 701 ntTSL 515.98■□□□□ 0.156e-10■■■■■ 38.9
UTP3Q9NQZ2 SND1-216ENST00000492840 472 ntTSL 57.69□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 38.9
UTP3Q9NQZ2 ADAR-209ENST00000530954 558 ntTSL 29.87□□□□□ -0.832e-9■■■■■ 38.9
UTP3Q9NQZ2 ADAR-210ENST00000534279 849 ntTSL 26.07□□□□□ -1.442e-9■■■■■ 38.9
UTP3Q9NQZ2 ARFGAP1-209ENST00000518794 2727 ntTSL 1 (best)19.73■□□□□ 0.754e-6■■■■■ 38.9
UTP3Q9NQZ2 ARFGAP1-207ENST00000518618 1244 ntTSL 219■□□□□ 0.634e-6■■■■■ 38.9
UTP3Q9NQZ2 ARFGAP1-222ENST00000549076 913 ntTSL 217.92■□□□□ 0.464e-6■■■■■ 38.9
UTP3Q9NQZ2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.76e-9■■■■■ 38.9
UTP3Q9NQZ2 ACTB-207ENST00000462494 2245 ntTSL 518.37■□□□□ 0.536e-9■■■■■ 38.9
UTP3Q9NQZ2 ACTB-204ENST00000425660 1845 ntTSL 1 (best)16.36■□□□□ 0.216e-9■■■■■ 38.9
UTP3Q9NQZ2 MXD1-202ENST00000409442 982 ntTSL 223.24■■□□□ 1.312e-6■■■■■ 38.9
UTP3Q9NQZ2 MXD1-204ENST00000435990 860 ntTSL 313.31□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 38.9
UTP3Q9NQZ2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.96e-7■■■■■ 38.9
UTP3Q9NQZ2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.066e-7■■■■■ 38.9
UTP3Q9NQZ2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.966e-7■■■■■ 38.9
UTP3Q9NQZ2 SAE1-204ENST00000414294 2211 ntTSL 220.65■□□□□ 0.96e-7■■■■■ 38.9
UTP3Q9NQZ2 SAE1-207ENST00000596995 2106 ntTSL 220.63■□□□□ 0.896e-7■■■■■ 38.9
UTP3Q9NQZ2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.436e-7■■■■■ 38.9
UTP3Q9NQZ2 RTN4-210ENST00000427710 589 ntTSL 415.96■□□□□ 0.159e-8■■■■■ 38.9
UTP3Q9NQZ2 TAS2R14-201ENST00000381852 1662 ntTSL 213.4□□□□□ -0.263e-7■■■■■ 38.8
UTP3Q9NQZ2 NMT1-204ENST00000587014 773 ntTSL 1 (best)14.82□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 38.8
UTP3Q9NQZ2 LEMD2-207ENST00000508327 1306 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 38.8
UTP3Q9NQZ2 INTS7-209ENST00000475798 795 ntTSL 56.98□□□□□ -1.293e-6■■■■■ 38.8
UTP3Q9NQZ2 INTS7-206ENST00000461212 820 ntTSL 26.6□□□□□ -1.353e-6■■■■■ 38.8
UTP3Q9NQZ2 SMG7-204ENST00000419169 2483 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.77■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 38.8
UTP3Q9NQZ2 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 38.8
UTP3Q9NQZ2 SMG7-212ENST00000507469 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 38.8
UTP3Q9NQZ2 SMG7-201ENST00000347615 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 38.8
UTP3Q9NQZ2 SMG7-215ENST00000515829 5629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 38.8
UTP3Q9NQZ2 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 38.8
UTP3Q9NQZ2 ARFRP1-205ENST00000610414 1251 ntTSL 218.81■□□□□ 0.63e-11■■■■■ 38.8
UTP3Q9NQZ2 ARFRP1-203ENST00000609188 225 ntTSL 518.42■□□□□ 0.543e-11■■■■■ 38.8
UTP3Q9NQZ2 GORASP2-207ENST00000486498 2096 ntTSL 214.32□□□□□ -0.125e-7■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 SMARCC2-207ENST00000549757 1062 ntTSL 57.23□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 DYRK1A-207ENST00000462274 1189 ntTSL 1 (best)27.06■■□□□ 1.922e-6■■■■■ 38.7
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 4675.3 ms