RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423300.1

DVL3-202, Transcript of dishevelled segment polarity protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene DVL3, Length 1,099 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DVL3-202ENST00000423300 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.86■■■■■ 5.25
DVL3-202ENST00000423300 ABCC9O60706 1549 aa43.59■■■■■ 4.57
DVL3-202ENST00000423300 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.24■■■■■ 4.51
DVL3-202ENST00000423300 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.34■■■■■ 4.21
DVL3-202ENST00000423300 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.31■■■■■ 4.2
DVL3-202ENST00000423300 NACADO15069 1562 aa40.95■■■■■ 4.15
DVL3-202ENST00000423300 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.45■■■■■ 4.07
DVL3-202ENST00000423300 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.44■■■■■ 4.063e-9■■□□□ 13.3
DVL3-202ENST00000423300 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.4■■■■■ 4.06
DVL3-202ENST00000423300 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.28■■■■■ 4.04
DVL3-202ENST00000423300 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.18■■■■■ 4.02
DVL3-202ENST00000423300 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.64■■■■□ 3.94
DVL3-202ENST00000423300 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.6■■■■□ 3.93
DVL3-202ENST00000423300 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.57■■■■□ 3.93
DVL3-202ENST00000423300 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.41■■■■□ 3.9
DVL3-202ENST00000423300 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.35■■■■□ 3.89
DVL3-202ENST00000423300 SCRIBQ14160 1630 aa39.28■■■■□ 3.88
DVL3-202ENST00000423300 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.22■■■■□ 3.87
DVL3-202ENST00000423300 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.31■■■■□ 3.72
DVL3-202ENST00000423300 CUX2O14529 1486 aa37.84■■■■□ 3.65
DVL3-202ENST00000423300 NCAPD3P42695 1498 aa37.8■■■■□ 3.64
DVL3-202ENST00000423300 ERCC6Q03468 1493 aa37.67■■■■□ 3.62
DVL3-202ENST00000423300 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.6■■■■□ 3.61
DVL3-202ENST00000423300 HMGXB3Q12766 1538 aa37.51■■■■□ 3.6
DVL3-202ENST00000423300 SMARCA2P51531 1590 aa37.48■■■■□ 3.59
DVL3-202ENST00000423300 SMARCA4P51532 1647 aa37.47■■■■□ 3.59
DVL3-202ENST00000423300 NESP48681 1621 aa37.32■■■■□ 3.57
DVL3-202ENST00000423300 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.55
DVL3-202ENST00000423300 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.54
DVL3-202ENST00000423300 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.16■■■■□ 3.54
DVL3-202ENST00000423300 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
DVL3-202ENST00000423300 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.04■■■■□ 3.52
DVL3-202ENST00000423300 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.87■■■■□ 3.49
DVL3-202ENST00000423300 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.86■■■■□ 3.49
DVL3-202ENST00000423300 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.79■■■■□ 3.48
DVL3-202ENST00000423300 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.59■■■■□ 3.45
DVL3-202ENST00000423300 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.53■■■■□ 3.44
DVL3-202ENST00000423300 WDR62O43379 1518 aa36.5■■■■□ 3.43
DVL3-202ENST00000423300 WIZO95785 1651 aa36.39■■■■□ 3.42
DVL3-202ENST00000423300 TRIM41Q8WV44 630 aa36.34■■■■□ 3.41
DVL3-202ENST00000423300 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.27■■■■□ 3.4
DVL3-202ENST00000423300 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.18■■■■□ 3.38
DVL3-202ENST00000423300 CFTRP13569 1480 aa36.11■■■■□ 3.37
DVL3-202ENST00000423300 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
DVL3-202ENST00000423300 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
DVL3-202ENST00000423300 OSCARQ8IYS5 282 aa35.93■■■■□ 3.34
DVL3-202ENST00000423300 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
DVL3-202ENST00000423300 PRDM2Q13029 1718 aa35.76■■■■□ 3.31
DVL3-202ENST00000423300 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.61■■■■□ 3.29
DVL3-202ENST00000423300 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.61■■■■□ 3.29
DVL3-202ENST00000423300 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.61■■■■□ 3.29
DVL3-202ENST00000423300 IFT140Q96RY7 1462 aa35.58■■■■□ 3.29
DVL3-202ENST00000423300 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
DVL3-202ENST00000423300 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.48■■■■□ 3.27
DVL3-202ENST00000423300 TOPBP1Q92547 1522 aa35.46■■■■□ 3.27
DVL3-202ENST00000423300 ARHGEF11O15085 1522 aa35.44■■■■□ 3.26
DVL3-202ENST00000423300 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
DVL3-202ENST00000423300 ABCC8Q09428 1581 aa35.35■■■■□ 3.25
DVL3-202ENST00000423300 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.3■■■■□ 3.24
DVL3-202ENST00000423300 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
DVL3-202ENST00000423300 CHD1O14646 1710 aa35.2■■■■□ 3.23
DVL3-202ENST00000423300 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.14■■■■□ 3.221e-6■■■□□ 18.2
DVL3-202ENST00000423300 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.09■■■■□ 3.21
DVL3-202ENST00000423300 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
DVL3-202ENST00000423300 ARAP1Q96P48 1450 aa35.06■■■■□ 3.2
DVL3-202ENST00000423300 FBLN2P98095 1184 aa34.91■■■■□ 3.18
DVL3-202ENST00000423300 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.9■■■■□ 3.18
DVL3-202ENST00000423300 WDR97A6NE52 1622 aa34.87■■■■□ 3.17
DVL3-202ENST00000423300 SOGA1O94964 1423 aa34.84■■■■□ 3.17
DVL3-202ENST00000423300 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
DVL3-202ENST00000423300 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
DVL3-202ENST00000423300 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.81■■■■□ 3.16
DVL3-202ENST00000423300 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.8■■■■□ 3.16
DVL3-202ENST00000423300 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.77■■■■□ 3.16
DVL3-202ENST00000423300 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
DVL3-202ENST00000423300 SYNJ1O43426 1573 aa34.71■■■■□ 3.15
DVL3-202ENST00000423300 CUX1P39880 1505 aa34.67■■■■□ 3.14
DVL3-202ENST00000423300 GRIN2BQ13224 1484 aa34.64■■■■□ 3.14
DVL3-202ENST00000423300 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
DVL3-202ENST00000423300 SYNJ2O15056 1496 aa34.6■■■■□ 3.13
DVL3-202ENST00000423300 PBRM1Q86U86 1689 aa34.51■■■■□ 3.12
DVL3-202ENST00000423300 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.44■■■■□ 3.1
DVL3-202ENST00000423300 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.4■■■■□ 3.1
DVL3-202ENST00000423300 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.37■■■■□ 3.09
DVL3-202ENST00000423300 GRIN2AQ12879 1464 aa34.2■■■■□ 3.07
DVL3-202ENST00000423300 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.19■■■■□ 3.06
DVL3-202ENST00000423300 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
DVL3-202ENST00000423300 ADAMTS12P58397 1594 aa34.16■■■■□ 3.06
DVL3-202ENST00000423300 NUP160Q12769 1436 aa34.13■■■■□ 3.05
DVL3-202ENST00000423300 CEP170Q5SW79 1584 aa34.12■■■■□ 3.05
DVL3-202ENST00000423300 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.08■■■■□ 3.05
DVL3-202ENST00000423300 SHROOM2Q13796 1616 aa34.07■■■■□ 3.04
DVL3-202ENST00000423300 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.03■■■■□ 3.04
DVL3-202ENST00000423300 TOP2BQ02880 1626 aa34.01■■■■□ 3.03
DVL3-202ENST00000423300 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34■■■■□ 3.03
DVL3-202ENST00000423300 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.94■■■■□ 3.02
DVL3-202ENST00000423300 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.87■■■■□ 3.01
DVL3-202ENST00000423300 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
DVL3-202ENST00000423300 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.78■■■■□ 3
DVL3-202ENST00000423300 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.7■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms