Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 AEN-202ENST00000557787 1242 ntTSL 1 (best)14.68□□□□□ -0.065e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 RBM5-223ENST00000492472 902 ntTSL 27.87□□□□□ -1.155e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 E2F4-211ENST00000568693 596 ntTSL 27.35□□□□□ -1.235e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 RBM5-206ENST00000437500 582 ntTSL 45.73□□□□□ -1.495e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 PSMG1-205ENST00000481921 716 ntTSL 24.24□□□□□ -1.735e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 CEP152-210ENST00000561245 577 ntTSL 211.25□□□□□ -0.617e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 CEP152-202ENST00000380950 5635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -17e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.737e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 CNOT2-210ENST00000548230 649 ntTSL 54.39□□□□□ -1.712e-9■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 HNRNPD-206ENST00000508119 735 ntTSL 28.23□□□□□ -1.094e-12■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 AP2B1-218ENST00000619183 1595 ntTSL 510.03□□□□□ -0.86e-7■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 ZCCHC8-206ENST00000542892 1774 ntTSL 28.52□□□□□ -1.056e-7■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 AP2B1-203ENST00000588116 779 ntTSL 55.9□□□□□ -1.466e-7■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 AP2B1-207ENST00000591561 756 ntTSL 35.03□□□□□ -1.66e-7■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 USP22-208ENST00000578446 605 ntTSL 39.57□□□□□ -0.883e-7■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 PPIB-203ENST00000561048 1208 ntTSL 1 (best)12.05□□□□□ -0.481e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.232e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.242e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 PIH1D1-211ENST00000596895 438 ntTSL 215.24■□□□□ 0.033e-10■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.363e-9■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 SSR1-203ENST00000462112 1094 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.23e-9■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.263e-9■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 SSR1-210ENST00000489567 1893 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.283e-9■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 SSR1-206ENST00000479365 1118 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.363e-9■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.63e-9■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 CHRD-207ENST00000459711 503 ntTSL 218.26■□□□□ 0.517e-12■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 FUBP1-205ENST00000470287 726 ntTSL 32.65□□□□□ -1.993e-7■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 CDK5RAP3-205ENST00000577802 415 ntTSL 211.94□□□□□ -0.54e-31■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 CDK5RAP3-223ENST00000582114 647 ntTSL 210.58□□□□□ -0.724e-31■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 CDK5RAP3-229ENST00000583697 852 ntTSL 38□□□□□ -1.134e-31■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 DNAJB2-216ENST00000482988 523 ntTSL 226.26■■□□□ 1.795e-9■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 DNAJB2-215ENST00000481815 427 ntTSL 213.2□□□□□ -0.35e-9■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 HSPA9-210ENST00000508003 582 ntTSL 210.31□□□□□ -0.765e-9■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 TIMM23B-204ENST00000483296 1156 ntTSL 215.24■□□□□ 0.033e-10■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.643e-10■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 TIMM23B-203ENST00000478381 2623 ntTSL 210.95□□□□□ -0.663e-10■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 TIMM23B-202ENST00000451577 1152 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.663e-10■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC3.9□□□□□ -1.793e-10■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 FASTK-216ENST00000496663 818 ntTSL 219.86■□□□□ 0.772e-6■□□□□ 9.8
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SF3B4Q15427 EEF1D-208ENST00000524883 828 ntTSL 216.84■□□□□ 0.295e-22■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 EEF1D-209ENST00000524900 343 ntTSL 515.88■□□□□ 0.135e-22■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 EEF1D-237ENST00000531281 813 ntTSL 215.59■□□□□ 0.095e-22■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 EEF1D-222ENST00000528519 553 ntTSL 314.54□□□□□ -0.085e-22■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 EEF1D-231ENST00000530306 583 ntTSL 214.11□□□□□ -0.155e-22■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 EEF1D-239ENST00000531670 926 ntTSL 314.11□□□□□ -0.155e-22■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 EEF1D-211ENST00000525261 559 ntTSL 213.5□□□□□ -0.255e-22■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 EEF1D-245ENST00000532596 761 ntTSL 413.5□□□□□ -0.255e-22■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 EEF1D-233ENST00000530545 616 ntTSL 412.33□□□□□ -0.445e-22■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 EEF1D-220ENST00000528303 558 ntTSL 411.91□□□□□ -0.55e-22■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 EEF1D-214ENST00000526135 535 ntTSL 211.63□□□□□ -0.555e-22■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 EEF1D-254ENST00000534475 538 ntTSL 411.4□□□□□ -0.585e-22■□□□□ 9.8
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SF3B4Q15427 EEF1D-255ENST00000534804 555 ntTSL 47.71□□□□□ -1.185e-22■□□□□ 9.8
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SF3B4Q15427 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.591e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 CAPN15-202ENST00000562370 942 ntTSL 224.28■■□□□ 1.481e-6■□□□□ 9.8
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SF3B4Q15427 CAPN15-205ENST00000567216 3174 ntTSL 1 (best)19.2■□□□□ 0.661e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 LZTR1-206ENST00000443265 698 ntTSL 518.6■□□□□ 0.571e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 CEP350-210ENST00000491495 1059 ntTSL 518.19■□□□□ 0.51e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 CSNK1E-207ENST00000430335 996 ntTSL 518.14■□□□□ 0.491e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 MON2-208ENST00000549378 1689 ntTSL 1 (best)18.06■□□□□ 0.481e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 FTSJ1-206ENST00000473235 688 ntTSL 517.46■□□□□ 0.391e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 FTSJ1-211ENST00000490202 965 ntTSL 517.46■□□□□ 0.391e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 NISCH-209ENST00000485765 563 ntTSL 417.26■□□□□ 0.351e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 PRPF40A-209ENST00000486100 569 ntTSL 416.79■□□□□ 0.281e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 TBPL1-202ENST00000367869 623 ntTSL 316.55■□□□□ 0.241e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 C9orf16-203ENST00000489240 573 ntTSL 316.29■□□□□ 0.21e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.141e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 C9orf16-204ENST00000492588 1570 ntTSL 515.49■□□□□ 0.071e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 PRPF40A-204ENST00000450303 496 ntTSL 315.4■□□□□ 0.061e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 FTSJ1-212ENST00000492562 610 ntTSL 315.31■□□□□ 0.041e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.041e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.041e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 RACK1-232ENST00000514318 581 ntTSL 314.77□□□□□ -0.051e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.071e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 H2AFY-213ENST00000508785 966 ntTSL 214.41□□□□□ -0.11e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 PIGS-205ENST00000484580 919 ntTSL 313.93□□□□□ -0.181e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.221e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.261e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 TBPL1-204ENST00000416965 991 ntTSL 313.37□□□□□ -0.271e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 PLEKHB2-209ENST00000482225 644 ntTSL 212.74□□□□□ -0.371e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 TNXB-206ENST00000490077 2756 ntTSL 1 (best)12.67□□□□□ -0.381e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 FTSJ1-213ENST00000496365 1287 ntTSL 512.43□□□□□ -0.421e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.421e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 YIPF2-210ENST00000591872 430 ntTSL 211.64□□□□□ -0.551e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 NISCH-203ENST00000460759 565 ntTSL 211.44□□□□□ -0.581e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 C9orf16-202ENST00000486420 434 ntTSL 511.39□□□□□ -0.591e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 BCOR-210ENST00000442018 2189 ntTSL 211.18□□□□□ -0.621e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 BCOR-208ENST00000413905 1945 ntTSL 511.12□□□□□ -0.631e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 H2AFY-219ENST00000513210 775 ntTSL 211.12□□□□□ -0.631e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 H2AFY-206ENST00000504197 498 ntTSL 211.09□□□□□ -0.631e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 TNXB-203ENST00000451343 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.641e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 ARRB1-205ENST00000529280 684 ntTSL 210.54□□□□□ -0.721e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 TNXB-201ENST00000375244 13132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.81e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 TBCK-218ENST00000511011 560 ntTSL 410.01□□□□□ -0.811e-6■□□□□ 9.8
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