RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491495.2

CEP350-210, Transcript of centrosomal protein 350, humanhuman

TSL 5

Gene CEP350, Length 1,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350-210ENST00000491495 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.7■■■■■ 5.55
CEP350-210ENST00000491495 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.61■■■■■ 4.73
CEP350-210ENST00000491495 ABCC9O60706 1549 aa44.55■■■■■ 4.72
CEP350-210ENST00000491495 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.42■■■■■ 4.38
CEP350-210ENST00000491495 NACADO15069 1562 aa42.11■■■■■ 4.33
CEP350-210ENST00000491495 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.03■■■■■ 4.32
CEP350-210ENST00000491495 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.61■■■■■ 4.25
CEP350-210ENST00000491495 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.55■■■■■ 4.24
CEP350-210ENST00000491495 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.48■■■■■ 4.23
CEP350-210ENST00000491495 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.47■■■■■ 4.23
CEP350-210ENST00000491495 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
CEP350-210ENST00000491495 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.16■■■■■ 4.18
CEP350-210ENST00000491495 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41■■■■■ 4.15
CEP350-210ENST00000491495 SCRIBQ14160 1630 aa40.74■■■■■ 4.11
CEP350-210ENST00000491495 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.53■■■■■ 4.08
CEP350-210ENST00000491495 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.24■■■■■ 4.03
CEP350-210ENST00000491495 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
CEP350-210ENST00000491495 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.08■■■■■ 4.01
CEP350-210ENST00000491495 NCAPD3P42695 1498 aa38.82■■■■□ 3.81
CEP350-210ENST00000491495 SMARCA4P51532 1647 aa38.81■■■■□ 3.8
CEP350-210ENST00000491495 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.76■■■■□ 3.8
CEP350-210ENST00000491495 SMARCA2P51531 1590 aa38.69■■■■□ 3.78
CEP350-210ENST00000491495 HMGXB3Q12766 1538 aa38.6■■■■□ 3.77
CEP350-210ENST00000491495 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.6■■■■□ 3.77
CEP350-210ENST00000491495 ERCC6Q03468 1493 aa38.47■■■■□ 3.75
CEP350-210ENST00000491495 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.45■■■■□ 3.75
CEP350-210ENST00000491495 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.35■■■■□ 3.73
CEP350-210ENST00000491495 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.34■■■■□ 3.73
CEP350-210ENST00000491495 NESP48681 1621 aa38.29■■■■□ 3.72
CEP350-210ENST00000491495 CUX2O14529 1486 aa38.28■■■■□ 3.72
CEP350-210ENST00000491495 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.12■■■■□ 3.69
CEP350-210ENST00000491495 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.01■■■■□ 3.67
CEP350-210ENST00000491495 WIZO95785 1651 aa37.94■■■■□ 3.66
CEP350-210ENST00000491495 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.88■■■■□ 3.65
CEP350-210ENST00000491495 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.86■■■■□ 3.65
CEP350-210ENST00000491495 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.76■■■■□ 3.63
CEP350-210ENST00000491495 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.68■■■■□ 3.62
CEP350-210ENST00000491495 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.53■■■■□ 3.6
CEP350-210ENST00000491495 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.46■■■■□ 3.59
CEP350-210ENST00000491495 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
CEP350-210ENST00000491495 WDR62O43379 1518 aa37.36■■■■□ 3.57
CEP350-210ENST00000491495 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.34■■■■□ 3.57
CEP350-210ENST00000491495 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.3■■■■□ 3.56
CEP350-210ENST00000491495 CFTRP13569 1480 aa37.26■■■■□ 3.56
CEP350-210ENST00000491495 PRDM2Q13029 1718 aa37.05■■■■□ 3.52
CEP350-210ENST00000491495 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
CEP350-210ENST00000491495 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.97■■■■□ 3.51
CEP350-210ENST00000491495 TRIM41Q8WV44 630 aa36.64■■■■□ 3.46
CEP350-210ENST00000491495 TOPBP1Q92547 1522 aa36.6■■■■□ 3.45
CEP350-210ENST00000491495 OSCARQ8IYS5 282 aa36.56■■■■□ 3.44
CEP350-210ENST00000491495 IFT140Q96RY7 1462 aa36.56■■■■□ 3.44
CEP350-210ENST00000491495 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
CEP350-210ENST00000491495 ABCC8Q09428 1581 aa36.49■■■■□ 3.43
CEP350-210ENST00000491495 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.49■■■■□ 3.43
CEP350-210ENST00000491495 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
CEP350-210ENST00000491495 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
CEP350-210ENST00000491495 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
CEP350-210ENST00000491495 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.2■■■■□ 3.398e-7■■■□□ 16.1
CEP350-210ENST00000491495 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.15■■■■□ 3.38
CEP350-210ENST00000491495 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.15■■■■□ 3.38
CEP350-210ENST00000491495 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.15■■■■□ 3.38
CEP350-210ENST00000491495 CHD1O14646 1710 aa36.14■■■■□ 3.38
CEP350-210ENST00000491495 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.12■■■■□ 3.37
CEP350-210ENST00000491495 SOGA1O94964 1423 aa36.06■■■■□ 3.36
CEP350-210ENST00000491495 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
CEP350-210ENST00000491495 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.05■■■■□ 3.36
CEP350-210ENST00000491495 CUX1P39880 1505 aa36.02■■■■□ 3.36
CEP350-210ENST00000491495 FBLN2P98095 1184 aa36.01■■■■□ 3.36
CEP350-210ENST00000491495 ARHGEF11O15085 1522 aa36.01■■■■□ 3.36
CEP350-210ENST00000491495 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
CEP350-210ENST00000491495 WDR97A6NE52 1622 aa35.87■■■■□ 3.33
CEP350-210ENST00000491495 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.86■■■■□ 3.33
CEP350-210ENST00000491495 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.74■■■■□ 3.31
CEP350-210ENST00000491495 GRIN2BQ13224 1484 aa35.73■■■■□ 3.31
CEP350-210ENST00000491495 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
CEP350-210ENST00000491495 PBRM1Q86U86 1689 aa35.72■■■■□ 3.31
CEP350-210ENST00000491495 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
CEP350-210ENST00000491495 ARAP1Q96P48 1450 aa35.65■■■■□ 3.3
CEP350-210ENST00000491495 SYNJ1O43426 1573 aa35.64■■■■□ 3.3
CEP350-210ENST00000491495 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.64■■■■□ 3.3
CEP350-210ENST00000491495 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.62■■■■□ 3.29
CEP350-210ENST00000491495 SYNJ2O15056 1496 aa35.6■■■■□ 3.29
CEP350-210ENST00000491495 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.59■■■■□ 3.29
CEP350-210ENST00000491495 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.57■■■■□ 3.29
CEP350-210ENST00000491495 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.49■■■■□ 3.27
CEP350-210ENST00000491495 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.48■■■■□ 3.27
CEP350-210ENST00000491495 TOP2BQ02880 1626 aa35.46■■■■□ 3.27
CEP350-210ENST00000491495 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
CEP350-210ENST00000491495 ADAMTS12P58397 1594 aa35.32■■■■□ 3.24
CEP350-210ENST00000491495 GRIN2AQ12879 1464 aa35.29■■■■□ 3.24
CEP350-210ENST00000491495 CEP170Q5SW79 1584 aa35.19■■■■□ 3.22
CEP350-210ENST00000491495 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.16■■■■□ 3.22
CEP350-210ENST00000491495 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.16■■■■□ 3.22
CEP350-210ENST00000491495 NUP160Q12769 1436 aa35.13■■■■□ 3.21
CEP350-210ENST00000491495 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.12■■■■□ 3.21
CEP350-210ENST00000491495 SHROOM2Q13796 1616 aa35■■■■□ 3.19
CEP350-210ENST00000491495 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
CEP350-210ENST00000491495 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.82■■■■□ 3.16
CEP350-210ENST00000491495 JPH4Q96JJ6 628 aa34.77■■■■□ 3.16
CEP350-210ENST00000491495 KIF27Q86VH2 1401 aa34.76■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms