RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.56■■■□□ 2.32
NISCH-203ENST00000460759 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.99■■□□□ 1.75
NISCH-203ENST00000460759 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
NISCH-203ENST00000460759 ABCC9O60706 1549 aa24.67■■□□□ 1.54
NISCH-203ENST00000460759 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.58■■□□□ 1.53
NISCH-203ENST00000460759 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.37■■□□□ 1.49
NISCH-203ENST00000460759 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.2■■□□□ 1.46
NISCH-203ENST00000460759 NACADO15069 1562 aa24.2■■□□□ 1.46
NISCH-203ENST00000460759 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24■■□□□ 1.43
NISCH-203ENST00000460759 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.76■■□□□ 1.39
NISCH-203ENST00000460759 SCRIBQ14160 1630 aa23.68■■□□□ 1.38
NISCH-203ENST00000460759 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
NISCH-203ENST00000460759 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.43■■□□□ 1.34
NISCH-203ENST00000460759 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.18■■□□□ 1.3
NISCH-203ENST00000460759 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.15■■□□□ 1.3
NISCH-203ENST00000460759 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
NISCH-203ENST00000460759 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.99■■□□□ 1.27
NISCH-203ENST00000460759 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
NISCH-203ENST00000460759 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.85■■□□□ 1.25
NISCH-203ENST00000460759 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
NISCH-203ENST00000460759 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
NISCH-203ENST00000460759 SMARCA4P51532 1647 aa22.77■■□□□ 1.24
NISCH-203ENST00000460759 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.76■■□□□ 1.23
NISCH-203ENST00000460759 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-203ENST00000460759 WIZO95785 1651 aa22.56■■□□□ 1.2
NISCH-203ENST00000460759 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
NISCH-203ENST00000460759 SMARCA2P51531 1590 aa22.48■■□□□ 1.19
NISCH-203ENST00000460759 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
NISCH-203ENST00000460759 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.39■■□□□ 1.17
NISCH-203ENST00000460759 HMGXB3Q12766 1538 aa22.3■■□□□ 1.16
NISCH-203ENST00000460759 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NISCH-203ENST00000460759 NCAPD3P42695 1498 aa22.27■■□□□ 1.16
NISCH-203ENST00000460759 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-203ENST00000460759 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.1■■□□□ 1.13
NISCH-203ENST00000460759 PRDM2Q13029 1718 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-203ENST00000460759 CFTRP13569 1480 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-203ENST00000460759 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.64■■□□□ 1.06
NISCH-203ENST00000460759 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.59■■□□□ 1.05
NISCH-203ENST00000460759 TRIM41Q8WV44 630 aa21.57■■□□□ 1.04
NISCH-203ENST00000460759 ABCC8Q09428 1581 aa21.55■■□□□ 1.04
NISCH-203ENST00000460759 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
NISCH-203ENST00000460759 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.42■■□□□ 1.02
NISCH-203ENST00000460759 TOP2BQ02880 1626 aa21.41■■□□□ 1.02
NISCH-203ENST00000460759 SYNJ1O43426 1573 aa21.4■■□□□ 1.02
NISCH-203ENST00000460759 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.4■■□□□ 1.02
NISCH-203ENST00000460759 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.38■■□□□ 1.01
NISCH-203ENST00000460759 NESP48681 1621 aa21.38■■□□□ 1.01
NISCH-203ENST00000460759 ERCC6Q03468 1493 aa21.33■■□□□ 1.01
NISCH-203ENST00000460759 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-203ENST00000460759 CUX1P39880 1505 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-203ENST00000460759 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-203ENST00000460759 EEA1Q15075 1411 aa21.27■■□□□ 1
NISCH-203ENST00000460759 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.26■□□□□ 0.99
NISCH-203ENST00000460759 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.23■□□□□ 0.99
NISCH-203ENST00000460759 CUX2O14529 1486 aa21.21■□□□□ 0.99
NISCH-203ENST00000460759 TOPBP1Q92547 1522 aa21.16■□□□□ 0.98
NISCH-203ENST00000460759 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
NISCH-203ENST00000460759 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.11■□□□□ 0.97
NISCH-203ENST00000460759 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.11■□□□□ 0.97
NISCH-203ENST00000460759 SOGA1O94964 1423 aa21.1■□□□□ 0.97
NISCH-203ENST00000460759 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
NISCH-203ENST00000460759 KIF27Q86VH2 1401 aa21.03■□□□□ 0.96
NISCH-203ENST00000460759 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
NISCH-203ENST00000460759 WDR62O43379 1518 aa21.02■□□□□ 0.96
NISCH-203ENST00000460759 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.99■□□□□ 0.95
NISCH-203ENST00000460759 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.99■□□□□ 0.95
NISCH-203ENST00000460759 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.98■□□□□ 0.95
NISCH-203ENST00000460759 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
NISCH-203ENST00000460759 WDR97A6NE52 1622 aa20.96■□□□□ 0.95
NISCH-203ENST00000460759 KIF21BO75037 1637 aa20.95■□□□□ 0.94
NISCH-203ENST00000460759 GOLGA3Q08378 1498 aa20.88■□□□□ 0.93
NISCH-203ENST00000460759 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.88■□□□□ 0.93
NISCH-203ENST00000460759 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
NISCH-203ENST00000460759 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.87■□□□□ 0.93
NISCH-203ENST00000460759 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.86■□□□□ 0.93
NISCH-203ENST00000460759 IFT140Q96RY7 1462 aa20.84■□□□□ 0.93
NISCH-203ENST00000460759 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.83■□□□□ 0.93
NISCH-203ENST00000460759 PRXQ9BXM0 1461 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-203ENST00000460759 CUL7Q14999 1698 aa20.79■□□□□ 0.92
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NISCH-203ENST00000460759 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.76■□□□□ 0.91
NISCH-203ENST00000460759 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.75■□□□□ 0.91
NISCH-203ENST00000460759 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.72■□□□□ 0.91
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NISCH-203ENST00000460759 GRIN2BQ13224 1484 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-203ENST00000460759 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
NISCH-203ENST00000460759 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.62■□□□□ 0.89
NISCH-203ENST00000460759 CEP162Q5TB80 1403 aa20.61■□□□□ 0.89
NISCH-203ENST00000460759 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
NISCH-203ENST00000460759 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
NISCH-203ENST00000460759 ADAMTS12P58397 1594 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-203ENST00000460759 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.55■□□□□ 0.88
NISCH-203ENST00000460759 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
NISCH-203ENST00000460759 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-203ENST00000460759 CLIP1P30622 1438 aa20.49■□□□□ 0.87
NISCH-203ENST00000460759 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.47■□□□□ 0.87
NISCH-203ENST00000460759 SYNJ2O15056 1496 aa20.41■□□□□ 0.86
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