Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.341e-11■■■■■ 43.7
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PRPF8Q6P2Q9 EARS2-207ENST00000563459 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 43.4
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PRPF8Q6P2Q9 RFC2-212ENST00000497430 753 ntTSL 39.49□□□□□ -0.895e-9■■■■■ 43.3
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PRPF8Q6P2Q9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.399e-7■■■■■ 43.3
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PRPF8Q6P2Q9 NCAPD2-207ENST00000539084 4290 ntTSL 29.13□□□□□ -0.959e-7■■■■■ 43.3
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PRPF8Q6P2Q9 DIP2A-211ENST00000481883 3119 ntTSL 1 (best)8.87□□□□□ -0.991e-10■■■■■ 43.3
PRPF8Q6P2Q9 BECN1-215ENST00000590764 854 ntTSL 26.03□□□□□ -1.449e-9■■■■■ 43.3
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