RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520348.5

SNHG6-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG6, Length 648 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG6-201ENST00000520348 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.93■■■■□ 3.5
SNHG6-201ENST00000520348 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.35■■■□□ 2.77
SNHG6-201ENST00000520348 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
SNHG6-201ENST00000520348 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.68■■■□□ 2.5
SNHG6-201ENST00000520348 ABCC9O60706 1549 aa30.38■■■□□ 2.45
SNHG6-201ENST00000520348 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.38■■■□□ 2.45
SNHG6-201ENST00000520348 NACADO15069 1562 aa30.09■■■□□ 2.41
SNHG6-201ENST00000520348 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.06■■■□□ 2.4
SNHG6-201ENST00000520348 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.8■■■□□ 2.36
SNHG6-201ENST00000520348 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.74■■■□□ 2.35
SNHG6-201ENST00000520348 SCRIBQ14160 1630 aa29.53■■■□□ 2.32
SNHG6-201ENST00000520348 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.19■■■□□ 2.26
SNHG6-201ENST00000520348 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.95■■■□□ 2.22
SNHG6-201ENST00000520348 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.61■■■□□ 2.17
SNHG6-201ENST00000520348 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
SNHG6-201ENST00000520348 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
SNHG6-201ENST00000520348 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.53■■■□□ 2.16
SNHG6-201ENST00000520348 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
SNHG6-201ENST00000520348 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.48■■■□□ 2.15
SNHG6-201ENST00000520348 SMARCA4P51532 1647 aa28.41■■■□□ 2.14
SNHG6-201ENST00000520348 WIZO95785 1651 aa28.2■■■□□ 2.11
SNHG6-201ENST00000520348 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.18■■■□□ 2.1
SNHG6-201ENST00000520348 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
SNHG6-201ENST00000520348 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
SNHG6-201ENST00000520348 SMARCA2P51531 1590 aa27.95■■■□□ 2.07
SNHG6-201ENST00000520348 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.94■■■□□ 2.06
SNHG6-201ENST00000520348 NCAPD3P42695 1498 aa27.76■■■□□ 2.04
SNHG6-201ENST00000520348 HMGXB3Q12766 1538 aa27.76■■■□□ 2.03
SNHG6-201ENST00000520348 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
SNHG6-201ENST00000520348 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.64■■■□□ 2.01
SNHG6-201ENST00000520348 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.59■■■□□ 2.01
SNHG6-201ENST00000520348 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.44■■□□□ 1.98
SNHG6-201ENST00000520348 CFTRP13569 1480 aa27.11■■□□□ 1.93
SNHG6-201ENST00000520348 PRDM2Q13029 1718 aa27.01■■□□□ 1.91
SNHG6-201ENST00000520348 ABCC8Q09428 1581 aa26.97■■□□□ 1.91
SNHG6-201ENST00000520348 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.97■■□□□ 1.91
SNHG6-201ENST00000520348 TRIM41Q8WV44 630 aa26.91■■□□□ 1.9
SNHG6-201ENST00000520348 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.898e-6■■■■■ 29.7
SNHG6-201ENST00000520348 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.82■■□□□ 1.88
SNHG6-201ENST00000520348 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.82■■□□□ 1.88
SNHG6-201ENST00000520348 SYNJ1O43426 1573 aa26.8■■□□□ 1.88
SNHG6-201ENST00000520348 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.75■■□□□ 1.87
SNHG6-201ENST00000520348 TOP2BQ02880 1626 aa26.74■■□□□ 1.87
SNHG6-201ENST00000520348 NESP48681 1621 aa26.68■■□□□ 1.86
SNHG6-201ENST00000520348 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.65■■□□□ 1.86
SNHG6-201ENST00000520348 CUX1P39880 1505 aa26.65■■□□□ 1.86
SNHG6-201ENST00000520348 EEA1Q15075 1411 aa26.53■■□□□ 1.84
SNHG6-201ENST00000520348 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.53■■□□□ 1.84
SNHG6-201ENST00000520348 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.5■■□□□ 1.83
SNHG6-201ENST00000520348 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.47■■□□□ 1.83
SNHG6-201ENST00000520348 SOGA1O94964 1423 aa26.45■■□□□ 1.82
SNHG6-201ENST00000520348 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.42■■□□□ 1.82
SNHG6-201ENST00000520348 TOPBP1Q92547 1522 aa26.39■■□□□ 1.81
SNHG6-201ENST00000520348 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
SNHG6-201ENST00000520348 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.35■■□□□ 1.81
SNHG6-201ENST00000520348 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.34■■□□□ 1.81
SNHG6-201ENST00000520348 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
SNHG6-201ENST00000520348 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
SNHG6-201ENST00000520348 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.24■■□□□ 1.79
SNHG6-201ENST00000520348 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.24■■□□□ 1.79
SNHG6-201ENST00000520348 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.22■■□□□ 1.79
SNHG6-201ENST00000520348 KIF21BO75037 1637 aa26.2■■□□□ 1.78
SNHG6-201ENST00000520348 KIF27Q86VH2 1401 aa26.2■■□□□ 1.78
SNHG6-201ENST00000520348 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.18■■□□□ 1.78
SNHG6-201ENST00000520348 WDR62O43379 1518 aa26.17■■□□□ 1.78
SNHG6-201ENST00000520348 WDR97A6NE52 1622 aa26.16■■□□□ 1.78
SNHG6-201ENST00000520348 CUX2O14529 1486 aa26.11■■□□□ 1.77
SNHG6-201ENST00000520348 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SNHG6-201ENST00000520348 GOLGA3Q08378 1498 aa26.09■■□□□ 1.77
SNHG6-201ENST00000520348 PRXQ9BXM0 1461 aa26.08■■□□□ 1.77
SNHG6-201ENST00000520348 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.08■■□□□ 1.77
SNHG6-201ENST00000520348 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.05■■□□□ 1.76
SNHG6-201ENST00000520348 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
SNHG6-201ENST00000520348 ERCC6Q03468 1493 aa26.04■■□□□ 1.76
SNHG6-201ENST00000520348 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26■■□□□ 1.75
SNHG6-201ENST00000520348 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.99■■□□□ 1.75
SNHG6-201ENST00000520348 IGF1RP08069 1367 aa25.96■■□□□ 1.75
SNHG6-201ENST00000520348 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.96■■□□□ 1.75
SNHG6-201ENST00000520348 IFT140Q96RY7 1462 aa25.91■■□□□ 1.74
SNHG6-201ENST00000520348 CUL7Q14999 1698 aa25.87■■□□□ 1.73
SNHG6-201ENST00000520348 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.84■■□□□ 1.73
SNHG6-201ENST00000520348 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.8■■□□□ 1.72
SNHG6-201ENST00000520348 CEP162Q5TB80 1403 aa25.8■■□□□ 1.72
SNHG6-201ENST00000520348 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.78■■□□□ 1.72
SNHG6-201ENST00000520348 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
SNHG6-201ENST00000520348 PBRM1Q86U86 1689 aa25.74■■□□□ 1.71
SNHG6-201ENST00000520348 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
SNHG6-201ENST00000520348 GRIN2BQ13224 1484 aa25.68■■□□□ 1.7
SNHG6-201ENST00000520348 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
SNHG6-201ENST00000520348 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.66■■□□□ 1.75e-12■■■■□ 23.1
SNHG6-201ENST00000520348 ADAMTS12P58397 1594 aa25.65■■□□□ 1.7
SNHG6-201ENST00000520348 CLIP1P30622 1438 aa25.62■■□□□ 1.69
SNHG6-201ENST00000520348 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.6■■□□□ 1.69
SNHG6-201ENST00000520348 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.53■■□□□ 1.68
SNHG6-201ENST00000520348 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
SNHG6-201ENST00000520348 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.48■■□□□ 1.67
SNHG6-201ENST00000520348 ARAP1Q96P48 1450 aa25.45■■□□□ 1.66
SNHG6-201ENST00000520348 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.45■■□□□ 1.66
SNHG6-201ENST00000520348 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms