Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYCNP04198 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYCNP04198 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYCNP04198 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYCNP04198 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MYCNP04198 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYCNP04198 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYCNP04198 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYCNP04198 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYCNP04198 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYCNP04198 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYCNP04198 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYCNP04198 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYCNP04198 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYCNP04198 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYCNP04198 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYCNP04198 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYCNP04198 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYCNP04198 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MYCNP04198 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYCNP04198 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYCNP04198 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYCNP04198 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYCNP04198 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYCNP04198 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYCNP04198 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYCNP04198 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYCNP04198 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MYCNP04198 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYCNP04198 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYCNP04198 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYCNP04198 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MYCNP04198 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYCNP04198 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYCNP04198 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYCNP04198 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYCNP04198 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYCNP04198 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYCNP04198 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYCNP04198 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYCNP04198 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYCNP04198 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYCNP04198 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYCNP04198 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYCNP04198 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYCNP04198 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYCNP04198 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYCNP04198 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYCNP04198 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYCNP04198 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYCNP04198 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYCNP04198 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYCNP04198 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYCNP04198 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYCNP04198 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYCNP04198 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYCNP04198 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYCNP04198 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYCNP04198 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYCNP04198 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYCNP04198 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYCNP04198 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYCNP04198 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYCNP04198 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYCNP04198 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYCNP04198 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYCNP04198 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYCNP04198 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYCNP04198 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYCNP04198 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYCNP04198 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYCNP04198 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYCNP04198 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYCNP04198 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYCNP04198 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYCNP04198 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYCNP04198 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYCNP04198 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYCNP04198 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYCNP04198 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MYCNP04198 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYCNP04198 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYCNP04198 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYCNP04198 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYCNP04198 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYCNP04198 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYCNP04198 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYCNP04198 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYCNP04198 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYCNP04198 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYCNP04198 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYCNP04198 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYCNP04198 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYCNP04198 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYCNP04198 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYCNP04198 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MYCNP04198 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYCNP04198 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYCNP04198 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYCNP04198 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms