Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW78

UQCC3, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCC3Q6UW78 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UQCC3Q6UW78 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UQCC3Q6UW78 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UQCC3Q6UW78 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UQCC3Q6UW78 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UQCC3Q6UW78 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UQCC3Q6UW78 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UQCC3Q6UW78 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UQCC3Q6UW78 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UQCC3Q6UW78 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UQCC3Q6UW78 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UQCC3Q6UW78 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UQCC3Q6UW78 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UQCC3Q6UW78 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UQCC3Q6UW78 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UQCC3Q6UW78 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UQCC3Q6UW78 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UQCC3Q6UW78 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UQCC3Q6UW78 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UQCC3Q6UW78 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UQCC3Q6UW78 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms