Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 SENP2-202ENST00000413407 2383 ntTSL 212.5□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 SENP2-203ENST00000430355 878 ntTSL 510.85□□□□□ -0.673e-8■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 SENP2-210ENST00000473760 738 ntTSL 27.68□□□□□ -1.183e-8■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 SENP2-209ENST00000465201 589 ntTSL 34.96□□□□□ -1.623e-8■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 PTDSS1-201ENST00000337004 2366 ntTSL 1 (best)15.78■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 KATNBL1-211ENST00000560247 1708 ntTSL 1 (best)15.44■□□□□ 0.063e-7■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 KATNBL1-202ENST00000540594 1267 ntTSL 214.95□□□□□ -0.023e-7■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.514e-9■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.623e-7■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 STAG3L5P-206ENST00000488972 552 ntTSL 410.95□□□□□ -0.664e-13■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 ENAH-204ENST00000366844 13168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.024e-9■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.574e-9■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 KATNBL1-209ENST00000559760 733 ntTSL 52.26□□□□□ -2.053e-7■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 KATNBL1-216ENST00000561270 884 ntTSL 2-0.1□□□□□ -2.433e-7■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 NOP2-210ENST00000538697 569 ntTSL 416.06■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 NOP2-221ENST00000546053 508 ntTSL 312.89□□□□□ -0.351e-8■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 ASAP2-203ENST00000471687 611 ntTSL 47.74□□□□□ -1.171e-15■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 GAS5-204ENST00000421068 1060 ntTSL 24.62□□□□□ -1.679e-22■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 RPS3A-209ENST00000510993 762 ntTSL 511.29□□□□□ -0.65e-7■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.171e-10■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 NFKBID-208ENST00000590828 1552 ntTSL 1 (best)14.29□□□□□ -0.122e-11■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.644e-8■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.344e-8■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 TMEM2-210ENST00000542935 5372 ntTSL 1 (best)4.86□□□□□ -1.634e-8■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.472e-19■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.662e-19■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.722e-19■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 ALB-205ENST00000476441 1604 ntTSL 54.26□□□□□ -1.732e-19■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.732e-19■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.752e-19■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.792e-19■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.832e-19■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.017e-11■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.242e-13■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.432e-13■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 FAM83G-203ENST00000399096 4393 ntTSL 411.65□□□□□ -0.542e-13■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 PRMT7-218ENST00000566341 562 ntTSL 49.2□□□□□ -0.945e-8■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 PRMT7-210ENST00000563562 487 ntTSL 57.27□□□□□ -1.255e-8■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 PRMT7-204ENST00000561806 543 ntTSL 56.29□□□□□ -1.45e-8■■■■■ 44
PRPF8Q6P2Q9 CHEK2-213ENST00000433028 1349 ntTSL 511.65□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 43.9
PRPF8Q6P2Q9 CHEK2-216ENST00000439200 906 ntTSL 511.64□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 43.9
PRPF8Q6P2Q9 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 43.9
PRPF8Q6P2Q9 RAPGEF6-213ENST00000514179 2200 ntTSL 29.76□□□□□ -0.858e-13■■■■■ 43.9
PRPF8Q6P2Q9 CHEK2-205ENST00000398017 713 ntTSL 56.68□□□□□ -1.342e-7■■■■■ 43.9
PRPF8Q6P2Q9 ANKFY1-207ENST00000573250 588 ntTSL 56.11□□□□□ -1.432e-10■■■■■ 43.9
PRPF8Q6P2Q9 CHEK2-212ENST00000425190 752 ntTSL 53.49□□□□□ -1.852e-7■■■■■ 43.9
PRPF8Q6P2Q9 POLQ-202ENST00000474243 613 ntTSL 51.73□□□□□ -2.131e-9■■■■■ 43.9
PRPF8Q6P2Q9 GET4-204ENST00000426056 502 ntTSL 48.8□□□□□ -11e-7■■■■■ 43.9
PRPF8Q6P2Q9 SND1-204ENST00000465900 630 ntTSL 45.02□□□□□ -1.612e-9■■■■■ 43.9
PRPF8Q6P2Q9 VPS45-212ENST00000611412 2064 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 43.9
PRPF8Q6P2Q9 VPS45-211ENST00000535106 2695 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.951e-6■■■■■ 43.9
PRPF8Q6P2Q9 VPS45-202ENST00000369130 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 43.9
PRPF8Q6P2Q9 VPS45-201ENST00000369128 2224 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.241e-6■■■■■ 43.9
PRPF8Q6P2Q9 VPS45-205ENST00000462852 966 ntTSL 26.92□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 43.9
PRPF8Q6P2Q9 VPS45-203ENST00000419023 977 ntTSL 34.62□□□□□ -1.671e-6■■■■■ 43.9
PRPF8Q6P2Q9 PSMB1-201ENST00000262193 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 43.9
PRPF8Q6P2Q9 SOGA1-203ENST00000463491 802 ntTSL 212.17□□□□□ -0.466e-15■■■■■ 43.9
PRPF8Q6P2Q9 MTHFD1-204ENST00000553405 833 ntTSL 212.4□□□□□ -0.421e-8■■■■■ 43.9
PRPF8Q6P2Q9 VCPKMT-205ENST00000569518 1827 ntTSL 217.94■□□□□ 0.464e-7■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 VCPKMT-204ENST00000491402 1793 ntTSL 1 (best)17.86■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 VCPKMT-203ENST00000484763 1849 ntTSL 1 (best)16.64■□□□□ 0.254e-7■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.234e-7■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 RALGAPB-207ENST00000490114 928 ntTSL 37.79□□□□□ -1.164e-7■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 SLC35B1-217ENST00000513508 631 ntTSL 29.98□□□□□ -0.811e-11■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 MYO19-211ENST00000613551 556 ntTSL 48.79□□□□□ -17e-9■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 MYO19-216ENST00000616207 786 ntTSL 58.49□□□□□ -1.057e-9■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 CHP1-206ENST00000560633 594 ntTSL 34.79□□□□□ -1.641e-7■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 CHP1-208ENST00000560965 467 ntTSL 24.79□□□□□ -1.641e-7■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 DNAJA1-202ENST00000465677 505 ntTSL 23.33□□□□□ -1.881e-6■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 SND1-216ENST00000492840 472 ntTSL 53.66□□□□□ -1.821e-9■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.129e-7■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 SEC31A-223ENST00000507816 546 ntTSL 417.66■□□□□ 0.427e-12■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 SEC31A-221ENST00000507340 587 ntTSL 417.22■□□□□ 0.357e-12■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 SEC31A-225ENST00000507867 682 ntTSL 315.62■□□□□ 0.097e-12■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 SEC31A-233ENST00000511975 564 ntTSL 415.62■□□□□ 0.097e-12■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 SEC31A-238ENST00000514326 847 ntTSL 313.29□□□□□ -0.287e-12■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 EWSR1-221ENST00000610553 2300 ntTSL 212.57□□□□□ -0.49e-14■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 SEC31A-236ENST00000513323 822 ntTSL 311.51□□□□□ -0.577e-12■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 ATP5I-202ENST00000505852 300 ntTSL 28.57□□□□□ -1.047e-12■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 ATP5I-201ENST00000304312 365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.117e-12■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 ATP5I-205ENST00000515202 393 ntTSL 27.13□□□□□ -1.277e-12■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 SEC31A-219ENST00000506497 926 ntTSL 36.09□□□□□ -1.437e-12■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 SEC31A-210ENST00000503058 706 ntTSL 55.05□□□□□ -1.67e-12■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 CUL4B-207ENST00000497616 1011 ntTSL 21.31□□□□□ -2.27e-12■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 YWHAB-203ENST00000428262 648 ntTSL 313.74□□□□□ -0.212e-13■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.762e-7■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.912e-7■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 UQCRC2-204ENST00000563711 2008 ntTSL 26.18□□□□□ -1.424e-21■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 ADGRA3-201ENST00000282943 3534 ntTSL 1 (best)3.71□□□□□ -1.823e-6■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 AP5M1-204ENST00000554863 496 ntTSL 30.33□□□□□ -2.362e-8■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 CHKA-203ENST00000525155 1201 ntTSL 510.47□□□□□ -0.733e-7■■■■■ 43.8
PRPF8Q6P2Q9 HSPE1-207ENST00000495200 537 ntTSL 315.6■□□□□ 0.092e-84■■■■■ 43.7
PRPF8Q6P2Q9 ESCO1-202ENST00000383276 4773 ntTSL 210.18□□□□□ -0.783e-8■■■■■ 43.7
PRPF8Q6P2Q9 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.853e-8■■■■■ 43.7
PRPF8Q6P2Q9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.051e-11■■■■■ 43.7
PRPF8Q6P2Q9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.161e-11■■■■■ 43.7
PRPF8Q6P2Q9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.231e-11■■■■■ 43.7
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 573.3 ms