Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms