RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535215.5

TSPAN11-202, Transcript of tetraspanin 11, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN11, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11-202ENST00000535215 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.31■■■■■ 5.64
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TSPAN11-202ENST00000535215 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.74■■■■■ 4.27
TSPAN11-202ENST00000535215 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.71■■■■■ 4.27
TSPAN11-202ENST00000535215 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.66■■■■■ 4.26
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TSPAN11-202ENST00000535215 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.06■■■■□ 3.84
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TSPAN11-202ENST00000535215 SMARCA2P51531 1590 aa38.62■■■■□ 3.77
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TSPAN11-202ENST00000535215 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.27■■■■□ 3.56
TSPAN11-202ENST00000535215 ERCC6Q03468 1493 aa37.2■■■■□ 3.55
TSPAN11-202ENST00000535215 PRDM2Q13029 1718 aa37.03■■■■□ 3.52
TSPAN11-202ENST00000535215 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.01■■■■□ 3.52
TSPAN11-202ENST00000535215 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37■■■■□ 3.51
TSPAN11-202ENST00000535215 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.92■■■■□ 3.5
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TSPAN11-202ENST00000535215 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
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TSPAN11-202ENST00000535215 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
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TSPAN11-202ENST00000535215 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.3■■■■□ 3.4
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TSPAN11-202ENST00000535215 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.13■■■■□ 3.37
TSPAN11-202ENST00000535215 SOGA1O94964 1423 aa36.13■■■■□ 3.37
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TSPAN11-202ENST00000535215 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.84■■■■□ 3.33
TSPAN11-202ENST00000535215 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
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TSPAN11-202ENST00000535215 WDR97A6NE52 1622 aa35.79■■■■□ 3.32
TSPAN11-202ENST00000535215 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
TSPAN11-202ENST00000535215 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.67■■■■□ 3.3
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TSPAN11-202ENST00000535215 GRIN2BQ13224 1484 aa35.6■■■■□ 3.29
TSPAN11-202ENST00000535215 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.58■■■■□ 3.29
TSPAN11-202ENST00000535215 KIF27Q86VH2 1401 aa35.55■■■■□ 3.28
TSPAN11-202ENST00000535215 PBRM1Q86U86 1689 aa35.48■■■■□ 3.27
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TSPAN11-202ENST00000535215 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.42■■■■□ 3.26
TSPAN11-202ENST00000535215 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.42■■■■□ 3.26
TSPAN11-202ENST00000535215 FBLN2P98095 1184 aa35.39■■■■□ 3.26
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TSPAN11-202ENST00000535215 SYNJ2O15056 1496 aa35.31■■■■□ 3.24
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TSPAN11-202ENST00000535215 NUP160Q12769 1436 aa34.94■■■■□ 3.18
TSPAN11-202ENST00000535215 PRXQ9BXM0 1461 aa34.91■■■■□ 3.18
TSPAN11-202ENST00000535215 CEP170Q5SW79 1584 aa34.87■■■■□ 3.17
TSPAN11-202ENST00000535215 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.86■■■■□ 3.17
TSPAN11-202ENST00000535215 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.77■■■■□ 3.16
TSPAN11-202ENST00000535215 JPH4Q96JJ6 628 aa34.74■■■■□ 3.15
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