Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 SCARB2-221ENST00000640341 3403 ntTSL 514.46□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 NUP62-219ENST00000599830 588 ntTSL 414.45□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATG4B-209ENST00000425239 807 ntTSL 214.44□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZEB1-218ENST00000560196 1014 ntTSL 1 (best)14.44□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 USP28-204ENST00000537642 732 ntTSL 314.43□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 PRKCZ-214ENST00000478770 1542 ntTSL 214.41□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SCAMP2-203ENST00000563663 1787 ntTSL 514.4□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.119e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLCO4A1-AS1-201ENST00000411824 809 ntTSL 214.32□□□□□ -0.129e-14■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 ATG4B-223ENST00000493618 899 ntTSL 514.18□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 COL16A1-214ENST00000488128 2854 ntTSL 514.08□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SPIDR-214ENST00000521550 1849 ntTSL 214.02□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 AC134772.2-201ENST00000635464 3943 ntTSL 513.96□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 APPL2-207ENST00000547809 1797 ntTSL 1 (best)13.38□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ELF3-208ENST00000490203 885 ntTSL 513.37□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.289e-14■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATG4B-222ENST00000491867 435 ntTSL 513.29□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GATB-202ENST00000503160 1860 ntTSL 513.25□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 LTB4R-204ENST00000553481 431 ntTSL 213.23□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 C19orf44-202ENST00000593380 3248 ntTSL 1 (best)13.2□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TMEM94-213ENST00000580416 430 ntTSL 413.18□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SP140L-209ENST00000496870 621 ntTSL 513.09□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MAGI1-204ENST00000463103 4193 ntTSL 513.09□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 62.8
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