RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460291.1

ATG7-216, Transcript of autophagy related 7, humanhuman

TSL 3

Gene ATG7, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7-216ENST00000460291 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.27■■■■□ 3.24
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ATG7-216ENST00000460291 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.04■■■□□ 2.4
ATG7-216ENST00000460291 NACADO15069 1562 aa29.86■■■□□ 2.37
ATG7-216ENST00000460291 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.75■■■□□ 2.35
ATG7-216ENST00000460291 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.48■■■□□ 2.31
ATG7-216ENST00000460291 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.44■■■□□ 2.3
ATG7-216ENST00000460291 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.39■■■□□ 2.3
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ATG7-216ENST00000460291 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.14■■■□□ 2.26
ATG7-216ENST00000460291 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.14■■■□□ 2.25
ATG7-216ENST00000460291 SCRIBQ14160 1630 aa28.81■■■□□ 2.2
ATG7-216ENST00000460291 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.77■■■□□ 2.2
ATG7-216ENST00000460291 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.46■■■□□ 2.15
ATG7-216ENST00000460291 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
ATG7-216ENST00000460291 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.36■■■□□ 2.13
ATG7-216ENST00000460291 NCAPD3P42695 1498 aa27.56■■■□□ 2
ATG7-216ENST00000460291 SMARCA4P51532 1647 aa27.49■■□□□ 1.99
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ATG7-216ENST00000460291 SMARCA2P51531 1590 aa27.43■■□□□ 1.98
ATG7-216ENST00000460291 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
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ATG7-216ENST00000460291 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.22■■□□□ 1.95
ATG7-216ENST00000460291 ERCC6Q03468 1493 aa27.19■■□□□ 1.94
ATG7-216ENST00000460291 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.18■■□□□ 1.94
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ATG7-216ENST00000460291 NESP48681 1621 aa27.08■■□□□ 1.93
ATG7-216ENST00000460291 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.97■■□□□ 1.91
ATG7-216ENST00000460291 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.93■■□□□ 1.9
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ATG7-216ENST00000460291 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
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ATG7-216ENST00000460291 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.76■■□□□ 1.87
ATG7-216ENST00000460291 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.72■■□□□ 1.87
ATG7-216ENST00000460291 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
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ATG7-216ENST00000460291 WDR62O43379 1518 aa26.45■■□□□ 1.83
ATG7-216ENST00000460291 CFTRP13569 1480 aa26.44■■□□□ 1.82
ATG7-216ENST00000460291 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.44■■□□□ 1.82
ATG7-216ENST00000460291 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.42■■□□□ 1.82
ATG7-216ENST00000460291 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.23■■□□□ 1.79
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ATG7-216ENST00000460291 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
ATG7-216ENST00000460291 TOPBP1Q92547 1522 aa25.93■■□□□ 1.74
ATG7-216ENST00000460291 IFT140Q96RY7 1462 aa25.91■■□□□ 1.74
ATG7-216ENST00000460291 ABCC8Q09428 1581 aa25.9■■□□□ 1.74
ATG7-216ENST00000460291 OSCARQ8IYS5 282 aa25.9■■□□□ 1.74
ATG7-216ENST00000460291 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.86■■□□□ 1.73
ATG7-216ENST00000460291 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
ATG7-216ENST00000460291 TRIM41Q8WV44 630 aa25.84■■□□□ 1.73
ATG7-216ENST00000460291 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
ATG7-216ENST00000460291 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
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ATG7-216ENST00000460291 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.54■■□□□ 1.68
ATG7-216ENST00000460291 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.54■■□□□ 1.68
ATG7-216ENST00000460291 CHD1O14646 1710 aa25.54■■□□□ 1.68
ATG7-216ENST00000460291 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.53■■□□□ 1.68
ATG7-216ENST00000460291 CUX1P39880 1505 aa25.53■■□□□ 1.68
ATG7-216ENST00000460291 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
ATG7-216ENST00000460291 FBLN2P98095 1184 aa25.47■■□□□ 1.67
ATG7-216ENST00000460291 ARHGEF11O15085 1522 aa25.47■■□□□ 1.67
ATG7-216ENST00000460291 WDR97A6NE52 1622 aa25.45■■□□□ 1.67
ATG7-216ENST00000460291 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.37■■□□□ 1.65
ATG7-216ENST00000460291 GRIN2BQ13224 1484 aa25.34■■□□□ 1.65
ATG7-216ENST00000460291 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
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ATG7-216ENST00000460291 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.28■■□□□ 1.64
ATG7-216ENST00000460291 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.27■■□□□ 1.64
ATG7-216ENST00000460291 PBRM1Q86U86 1689 aa25.26■■□□□ 1.63
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ATG7-216ENST00000460291 SYNJ2O15056 1496 aa25.24■■□□□ 1.63
ATG7-216ENST00000460291 SYNJ1O43426 1573 aa25.23■■□□□ 1.63
ATG7-216ENST00000460291 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.22■■□□□ 1.63
ATG7-216ENST00000460291 ARAP1Q96P48 1450 aa25.21■■□□□ 1.63
ATG7-216ENST00000460291 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.2■■□□□ 1.62
ATG7-216ENST00000460291 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
ATG7-216ENST00000460291 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.16■■□□□ 1.62
ATG7-216ENST00000460291 TOP2BQ02880 1626 aa25.15■■□□□ 1.62
ATG7-216ENST00000460291 GRIN2AQ12879 1464 aa25.01■■□□□ 1.59
ATG7-216ENST00000460291 ADAMTS12P58397 1594 aa25.01■■□□□ 1.59
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ATG7-216ENST00000460291 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.95■■□□□ 1.58
ATG7-216ENST00000460291 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.94■■□□□ 1.58
ATG7-216ENST00000460291 NUP160Q12769 1436 aa24.91■■□□□ 1.58
ATG7-216ENST00000460291 CEP170Q5SW79 1584 aa24.91■■□□□ 1.58
ATG7-216ENST00000460291 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.83■■□□□ 1.57
ATG7-216ENST00000460291 SHROOM2Q13796 1616 aa24.8■■□□□ 1.56
ATG7-216ENST00000460291 KIF27Q86VH2 1401 aa24.68■■□□□ 1.54
ATG7-216ENST00000460291 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
ATG7-216ENST00000460291 JPH4Q96JJ6 628 aa24.67■■□□□ 1.54
ATG7-216ENST00000460291 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.65■■□□□ 1.54
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