Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PRPF8Q6P2Q9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.048e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.038e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.038e-12■■■■■ 44.3
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PRPF8Q6P2Q9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.15e-9■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.115e-9■■■■■ 44.3
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