RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521644.5

ERLIN2-208, Transcript of ER lipid raft associated 2, human

TSL 5

Gene ERLIN2, Length 1,602 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERLIN2-208	ENST00000521644	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		44.54	■■■■■ 4.72
ERLIN2-208	ENST00000521644	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		38.9	■■■■□ 3.82
ERLIN2-208	ENST00000521644	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	37.45	■■■■□ 3.59
ERLIN2-208	ENST00000521644	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		36.91	■■■■□ 3.5
ERLIN2-208	ENST00000521644	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		36.67	■■■■□ 3.46
ERLIN2-208	ENST00000521644	ABCC9	O60706	1549 aa		36.49	■■■■□ 3.43
ERLIN2-208	ENST00000521644	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		36.43	■■■■□ 3.42
ERLIN2-208	ENST00000521644	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.31	■■■■□ 3.4
ERLIN2-208	ENST00000521644	NACAD	O15069	1562 aa		36.16	■■■■□ 3.38
ERLIN2-208	ENST00000521644	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		35.82	■■■■□ 3.33
ERLIN2-208	ENST00000521644	SCRIB	Q14160	1630 aa		35.67	■■■■□ 3.3
ERLIN2-208	ENST00000521644	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		35.06	■■■■□ 3.2
ERLIN2-208	ENST00000521644	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	35.04	■■■■□ 3.2
ERLIN2-208	ENST00000521644	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		34.62	■■■■□ 3.13
ERLIN2-208	ENST00000521644	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	34.55	■■■■□ 3.12
ERLIN2-208	ENST00000521644	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		34.5	■■■■□ 3.11
ERLIN2-208	ENST00000521644	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	34.45	■■■■□ 3.1
ERLIN2-208	ENST00000521644	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	34.38	■■■■□ 3.09
ERLIN2-208	ENST00000521644	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		34.36	■■■■□ 3.09
ERLIN2-208	ENST00000521644	SMARCA4	P51532	1647 aa		34.24	■■■■□ 3.07
ERLIN2-208	ENST00000521644	WIZ	O95785	1651 aa		34.12	■■■■□ 3.05
ERLIN2-208	ENST00000521644	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		33.84	■■■■□ 3.01
ERLIN2-208	ENST00000521644	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	33.83	■■■■□ 3.01
ERLIN2-208	ENST00000521644	SMARCA2	P51531	1590 aa		33.68	■■■□□ 2.98
ERLIN2-208	ENST00000521644	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		33.62	■■■□□ 2.97
ERLIN2-208	ENST00000521644	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	33.62	■■■□□ 2.97
ERLIN2-208	ENST00000521644	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		33.6	■■■□□ 2.97
ERLIN2-208	ENST00000521644	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
ERLIN2-208	ENST00000521644	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		33.42	■■■□□ 2.94
ERLIN2-208	ENST00000521644	HMGXB3	Q12766	1538 aa		33.33	■■■□□ 2.93
ERLIN2-208	ENST00000521644	NCAPD3	P42695	1498 aa		33.31	■■■□□ 2.92
ERLIN2-208	ENST00000521644	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		33.08	■■■□□ 2.89
ERLIN2-208	ENST00000521644	TRIM41	Q8WV44	630 aa		33.02	■■■□□ 2.88
ERLIN2-208	ENST00000521644	ABCC8	Q09428	1581 aa		32.74	■■■□□ 2.83
ERLIN2-208	ENST00000521644	CFTR	P13569	1480 aa		32.6	■■■□□ 2.81
ERLIN2-208	ENST00000521644	PRDM2	Q13029	1718 aa		32.59	■■■□□ 2.81
ERLIN2-208	ENST00000521644	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	32.58	■■■□□ 2.81
ERLIN2-208	ENST00000521644	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		32.46	■■■□□ 2.79
ERLIN2-208	ENST00000521644	SYNJ1	O43426	1573 aa		32.4	■■■□□ 2.78
ERLIN2-208	ENST00000521644	TOP2B	Q02880	1626 aa		32.33	■■■□□ 2.77
ERLIN2-208	ENST00000521644	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
ERLIN2-208	ENST00000521644	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		32.31	■■■□□ 2.76
ERLIN2-208	ENST00000521644	EEA1	Q15075	1411 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ERLIN2-208	ENST00000521644	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.26	■■■□□ 2.76
ERLIN2-208	ENST00000521644	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ERLIN2-208	ENST00000521644	CUX1	P39880	1505 aa		32.14	■■■□□ 2.74
ERLIN2-208	ENST00000521644	SOGA1	O94964	1423 aa		32.13	■■■□□ 2.73
ERLIN2-208	ENST00000521644	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		32.11	■■■□□ 2.73
ERLIN2-208	ENST00000521644	NES	P48681	1621 aa		32.04	■■■□□ 2.72
ERLIN2-208	ENST00000521644	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		31.98	■■■□□ 2.71
ERLIN2-208	ENST00000521644	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		31.97	■■■□□ 2.71
ERLIN2-208	ENST00000521644	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		31.96	■■■□□ 2.71
ERLIN2-208	ENST00000521644	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		31.95	■■■□□ 2.71
ERLIN2-208	ENST00000521644	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		31.93	■■■□□ 2.7
ERLIN2-208	ENST00000521644	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		31.89	■■■□□ 2.7
ERLIN2-208	ENST00000521644	KIF21B	O75037	1637 aa		31.82	■■■□□ 2.68
ERLIN2-208	ENST00000521644	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		31.8	■■■□□ 2.68
ERLIN2-208	ENST00000521644	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		31.8	■■■□□ 2.68
ERLIN2-208	ENST00000521644	GOLGA3	Q08378	1498 aa		31.79	■■■□□ 2.68
ERLIN2-208	ENST00000521644	KIF27	Q86VH2	1401 aa		31.78	■■■□□ 2.68
ERLIN2-208	ENST00000521644	TOPBP1	Q92547	1522 aa		31.78	■■■□□ 2.68
ERLIN2-208	ENST00000521644	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		31.77	■■■□□ 2.68
ERLIN2-208	ENST00000521644	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		31.68	■■■□□ 2.66
ERLIN2-208	ENST00000521644	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	31.65	■■■□□ 2.66
ERLIN2-208	ENST00000521644	CUX2	O14529	1486 aa		31.62	■■■□□ 2.65
ERLIN2-208	ENST00000521644	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
ERLIN2-208	ENST00000521644	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	31.6	■■■□□ 2.65
ERLIN2-208	ENST00000521644	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		31.59	■■■□□ 2.65
ERLIN2-208	ENST00000521644	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		31.55	■■■□□ 2.64
ERLIN2-208	ENST00000521644	PRX	Q9BXM0	1461 aa		31.54	■■■□□ 2.64
ERLIN2-208	ENST00000521644	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		31.51	■■■□□ 2.63
ERLIN2-208	ENST00000521644	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		31.5	■■■□□ 2.63
ERLIN2-208	ENST00000521644	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.5	■■■□□ 2.63
ERLIN2-208	ENST00000521644	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		31.46	■■■□□ 2.63
ERLIN2-208	ENST00000521644	WDR97	A6NE52	1622 aa		31.45	■■■□□ 2.63
ERLIN2-208	ENST00000521644	IGF1R	P08069	1367 aa		31.39	■■■□□ 2.62
ERLIN2-208	ENST00000521644	ERCC6	Q03468	1493 aa		31.36	■■■□□ 2.61
ERLIN2-208	ENST00000521644	WDR62	O43379	1518 aa		31.34	■■■□□ 2.61
ERLIN2-208	ENST00000521644	CUL7	Q14999	1698 aa		31.3	■■■□□ 2.6
ERLIN2-208	ENST00000521644	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
ERLIN2-208	ENST00000521644	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		31.28	■■■□□ 2.6
ERLIN2-208	ENST00000521644	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		31.28	■■■□□ 2.6
ERLIN2-208	ENST00000521644	CLIP1	P30622	1438 aa		31.25	■■■□□ 2.59
ERLIN2-208	ENST00000521644	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	31.2	■■■□□ 2.59
ERLIN2-208	ENST00000521644	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		31.2	■■■□□ 2.58
ERLIN2-208	ENST00000521644	IFT140	Q96RY7	1462 aa		31.16	■■■□□ 2.58
ERLIN2-208	ENST00000521644	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
ERLIN2-208	ENST00000521644	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.07	■■■□□ 2.57
ERLIN2-208	ENST00000521644	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
ERLIN2-208	ENST00000521644	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.01	■■■□□ 2.55
ERLIN2-208	ENST00000521644	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		31	■■■□□ 2.55
ERLIN2-208	ENST00000521644	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		30.96	■■■□□ 2.55
ERLIN2-208	ENST00000521644	GRIN2B	Q13224	1484 aa		30.95	■■■□□ 2.55
ERLIN2-208	ENST00000521644	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	30.94	■■■□□ 2.54
ERLIN2-208	ENST00000521644	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	30.93	■■■□□ 2.54	8e-8	■■■■■ 27.2
ERLIN2-208	ENST00000521644	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		30.88	■■■□□ 2.53
ERLIN2-208	ENST00000521644	ARAP1	Q96P48	1450 aa		30.88	■■■□□ 2.53
ERLIN2-208	ENST00000521644	ADAMTS12	P58397	1594 aa		30.87	■■■□□ 2.53
ERLIN2-208	ENST00000521644	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	30.86	■■■□□ 2.53
ERLIN2-208	ENST00000521644	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	30.86	■■■□□ 2.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms