Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 SMYD3-205ENST00000453676 562 ntTSL 43.53□□□□□ -1.844e-9■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 WDR45B-203ENST00000571817 889 ntTSL 320.31■□□□□ 0.844e-8■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 WDR45B-208ENST00000574828 765 ntTSL 315.77■□□□□ 0.124e-8■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -04e-8■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 WDR45B-205ENST00000572583 2322 ntTSL 1 (best)14.87□□□□□ -0.034e-8■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 WDR45B-206ENST00000573616 896 ntTSL 514.2□□□□□ -0.144e-8■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 SPTBN1-203ENST00000389980 2164 ntTSL 1 (best)11.75□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 SKA2-209ENST00000583976 570 ntTSL 215.58■□□□□ 0.082e-15■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.082e-15■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.162e-15■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 SKA2-206ENST00000581068 595 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.692e-15■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 SKA2-204ENST00000578519 894 ntTSL 310.68□□□□□ -0.72e-15■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 SKA2-208ENST00000583927 533 ntTSL 29.84□□□□□ -0.832e-15■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 SKA2-207ENST00000583380 583 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.952e-15■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.162e-15■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 SKA2-203ENST00000578105 689 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.162e-15■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 SKA2-210ENST00000584089 229 ntTSL 43.84□□□□□ -1.792e-15■■■■□ 22.5
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ILF3Q12906 FLJ46284-202ENST00000521148 496 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.216e-11■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 PIP5K1C-208ENST00000637724 435 ntTSL 320.12■□□□□ 0.811e-6■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 PIP5K1C-204ENST00000587482 1311 ntTSL 516.14■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 HEPH-204ENST00000425114 2459 ntTSL 510.92□□□□□ -0.662e-10■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.771e-6■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.385e-6■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.345e-6■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 ARHGAP35-202ENST00000595822 2977 ntTSL 211.43□□□□□ -0.585e-6■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.112e-6■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 RNF4-210ENST00000508235 603 ntTSL 314.87□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.066e-8■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.24e-7■■■■□ 22.4
ILF3Q12906 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.394e-7■■■■□ 22.4
ILF3Q12906 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.762e-7■■■■□ 22.4
ILF3Q12906 PIK3CA-204ENST00000477735 245 ntTSL 418.55■□□□□ 0.561e-6■■■■□ 22.4
ILF3Q12906 PIK3CA-203ENST00000468036 620 ntTSL 34.67□□□□□ -1.661e-6■■■■□ 22.4
ILF3Q12906 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.981e-6■■■■□ 22.4
ILF3Q12906 AGPS-203ENST00000460342 576 ntTSL 44.77□□□□□ -1.651e-6■■■■□ 22.4
ILF3Q12906 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.391e-9■■■■□ 22.4
ILF3Q12906 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 22.4
ILF3Q12906 ZNF100-203ENST00000594401 548 ntTSL 46.36□□□□□ -1.392e-6■■■■□ 22.4
ILF3Q12906 PIP5K1A-206ENST00000424999 567 ntTSL 421.11■□□□□ 0.971e-7■■■■□ 22.4
ILF3Q12906 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.472e-6■■■■□ 22.4
ILF3Q12906 FANCA-230ENST00000568369 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.762e-6■■■■□ 22.4
ILF3Q12906 NAP1L1-222ENST00000551992 1074 ntTSL 524.05■■□□□ 1.443e-23■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.981e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 NCOR1-207ENST00000430577 1204 ntTSL 520.77■□□□□ 0.921e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 CARD10-210ENST00000494166 560 ntTSL 520.27■□□□□ 0.841e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.791e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 ARID4A-208ENST00000445108 965 ntTSL 319.78■□□□□ 0.761e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 ALCAM-204ENST00000470756 1770 ntTSL 1 (best)18.85■□□□□ 0.611e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.591e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 UBE3D-207ENST00000509102 1246 ntTSL 1 (best)18.62■□□□□ 0.571e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.561e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.541e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.541e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PSPC1-202ENST00000427943 866 ntTSL 518.33■□□□□ 0.521e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.521e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.491e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 NCOR1-226ENST00000585296 983 ntTSL 1 (best)18.03■□□□□ 0.481e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.481e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.441e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.431e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 TBL1XR1-225ENST00000636187 171 ntTSL 517.62■□□□□ 0.411e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.371e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 DCTN5-202ENST00000563188 547 ntTSL 517.28■□□□□ 0.361e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 UBE3D-204ENST00000430071 1352 ntTSL 516.78■□□□□ 0.281e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.261e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 POFUT1-205ENST00000486717 959 ntTSL 216.67■□□□□ 0.261e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.251e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PDXK-204ENST00000398078 1069 ntTSL 216.61■□□□□ 0.251e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.241e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.221e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.181e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.151e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.113e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.111e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 AMDHD1-204ENST00000553023 566 ntTSL 515.71■□□□□ 0.111e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 ARHGEF10L-207ENST00000482359 604 ntTSL 515.26■□□□□ 0.031e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RNF216P1-201ENST00000403969 1360 ntTSL 1 (best)15.19■□□□□ 0.021e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.021e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.011e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 UBE3D-201ENST00000237186 1879 ntTSL 1 (best)15.12■□□□□ 0.011e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.031e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.041e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 DOT1L-203ENST00000452696 624 ntTSL 314.76□□□□□ -0.051e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PDXK-217ENST00000490666 577 ntTSL 514.63□□□□□ -0.071e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.083e-23■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 LMNB1-203ENST00000460265 3475 ntTSL 1 (best)14.49□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RNGTT-204ENST00000627296 2017 ntTSL 214.48□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.141e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.141e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PDXK-203ENST00000343528 1101 ntTSL 1 (best)14.15□□□□□ -0.141e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PGPEP1-205ENST00000596962 1237 ntTSL 1 (best)14.13□□□□□ -0.151e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.161e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RNF216P1-211ENST00000477090 566 ntTSL 413.98□□□□□ -0.171e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.181e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.181e-6■■■■□ 22.3
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