RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574828.1

WDR45B-208, Transcript of WD repeat domain 45B, humanhuman

TSL 3

Gene WDR45B, Length 765 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR45B-208ENST00000574828 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.17■■■■□ 3.86
WDR45B-208ENST00000574828 ABCC9O60706 1549 aa35.62■■■■□ 3.29
WDR45B-208ENST00000574828 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.32■■■■□ 3.25
WDR45B-208ENST00000574828 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.79■■■■□ 3
WDR45B-208ENST00000574828 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.76■■■□□ 2.99
WDR45B-208ENST00000574828 NACADO15069 1562 aa33.43■■■□□ 2.94
WDR45B-208ENST00000574828 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.16■■■□□ 2.9
WDR45B-208ENST00000574828 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.09■■■□□ 2.89
WDR45B-208ENST00000574828 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.08■■■□□ 2.89
WDR45B-208ENST00000574828 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.86■■■□□ 2.85
WDR45B-208ENST00000574828 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.85■■■□□ 2.85
WDR45B-208ENST00000574828 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
WDR45B-208ENST00000574828 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.34■■■□□ 2.77
WDR45B-208ENST00000574828 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.28■■■□□ 2.76
WDR45B-208ENST00000574828 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.22■■■□□ 2.75
WDR45B-208ENST00000574828 SCRIBQ14160 1630 aa32.13■■■□□ 2.73
WDR45B-208ENST00000574828 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.11■■■□□ 2.73
WDR45B-208ENST00000574828 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
WDR45B-208ENST00000574828 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.27■■■□□ 2.6
WDR45B-208ENST00000574828 NCAPD3P42695 1498 aa30.86■■■□□ 2.53
WDR45B-208ENST00000574828 CUX2O14529 1486 aa30.84■■■□□ 2.53
WDR45B-208ENST00000574828 ERCC6Q03468 1493 aa30.73■■■□□ 2.51
WDR45B-208ENST00000574828 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.71■■■□□ 2.51
WDR45B-208ENST00000574828 SMARCA4P51532 1647 aa30.63■■■□□ 2.49
WDR45B-208ENST00000574828 HMGXB3Q12766 1538 aa30.61■■■□□ 2.49
WDR45B-208ENST00000574828 SMARCA2P51531 1590 aa30.59■■■□□ 2.49
WDR45B-208ENST00000574828 NESP48681 1621 aa30.53■■■□□ 2.48
WDR45B-208ENST00000574828 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
WDR45B-208ENST00000574828 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
WDR45B-208ENST00000574828 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.34■■■□□ 2.45
WDR45B-208ENST00000574828 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
WDR45B-208ENST00000574828 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.25■■■□□ 2.43
WDR45B-208ENST00000574828 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.21■■■□□ 2.43
WDR45B-208ENST00000574828 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.2■■■□□ 2.42
WDR45B-208ENST00000574828 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.02■■■□□ 2.4
WDR45B-208ENST00000574828 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.88■■■□□ 2.37
WDR45B-208ENST00000574828 WIZO95785 1651 aa29.82■■■□□ 2.36
WDR45B-208ENST00000574828 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.8■■■□□ 2.36
WDR45B-208ENST00000574828 WDR62O43379 1518 aa29.79■■■□□ 2.36
WDR45B-208ENST00000574828 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
WDR45B-208ENST00000574828 TRIM41Q8WV44 630 aa29.69■■■□□ 2.34
WDR45B-208ENST00000574828 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.61■■■□□ 2.33
WDR45B-208ENST00000574828 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.55■■■□□ 2.32
WDR45B-208ENST00000574828 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
WDR45B-208ENST00000574828 CFTRP13569 1480 aa29.48■■■□□ 2.31
WDR45B-208ENST00000574828 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
WDR45B-208ENST00000574828 OSCARQ8IYS5 282 aa29.34■■■□□ 2.29
WDR45B-208ENST00000574828 PRDM2Q13029 1718 aa29.29■■■□□ 2.28
WDR45B-208ENST00000574828 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.18■■■□□ 2.26
WDR45B-208ENST00000574828 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.11■■■□□ 2.25
WDR45B-208ENST00000574828 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.11■■■□□ 2.25
WDR45B-208ENST00000574828 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.11■■■□□ 2.25
WDR45B-208ENST00000574828 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
WDR45B-208ENST00000574828 IFT140Q96RY7 1462 aa29.03■■■□□ 2.24
WDR45B-208ENST00000574828 TOPBP1Q92547 1522 aa28.97■■■□□ 2.23
WDR45B-208ENST00000574828 ARHGEF11O15085 1522 aa28.93■■■□□ 2.22
WDR45B-208ENST00000574828 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
WDR45B-208ENST00000574828 ABCC8Q09428 1581 aa28.85■■■□□ 2.21
WDR45B-208ENST00000574828 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.84■■■□□ 2.21
WDR45B-208ENST00000574828 CHD1O14646 1710 aa28.83■■■□□ 2.21
WDR45B-208ENST00000574828 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
WDR45B-208ENST00000574828 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.72■■■□□ 2.191e-6■■■■□ 25.6
WDR45B-208ENST00000574828 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
WDR45B-208ENST00000574828 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.69■■■□□ 2.18
WDR45B-208ENST00000574828 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.17
WDR45B-208ENST00000574828 ARAP1Q96P48 1450 aa28.62■■■□□ 2.17
WDR45B-208ENST00000574828 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.55■■■□□ 2.16
WDR45B-208ENST00000574828 FBLN2P98095 1184 aa28.55■■■□□ 2.16
WDR45B-208ENST00000574828 SOGA1O94964 1423 aa28.48■■■□□ 2.15
WDR45B-208ENST00000574828 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
WDR45B-208ENST00000574828 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
WDR45B-208ENST00000574828 WDR97A6NE52 1622 aa28.43■■■□□ 2.14
WDR45B-208ENST00000574828 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.43■■■□□ 2.14
WDR45B-208ENST00000574828 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.42■■■□□ 2.14
WDR45B-208ENST00000574828 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.41■■■□□ 2.14
WDR45B-208ENST00000574828 CUX1P39880 1505 aa28.36■■■□□ 2.13
WDR45B-208ENST00000574828 SYNJ1O43426 1573 aa28.34■■■□□ 2.13
WDR45B-208ENST00000574828 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
WDR45B-208ENST00000574828 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
WDR45B-208ENST00000574828 GRIN2BQ13224 1484 aa28.27■■■□□ 2.12
WDR45B-208ENST00000574828 PBRM1Q86U86 1689 aa28.26■■■□□ 2.12
WDR45B-208ENST00000574828 SYNJ2O15056 1496 aa28.23■■■□□ 2.11
WDR45B-208ENST00000574828 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.14■■■□□ 2.09
WDR45B-208ENST00000574828 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.1■■■□□ 2.09
WDR45B-208ENST00000574828 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.07■■■□□ 2.08
WDR45B-208ENST00000574828 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.01■■■□□ 2.08
WDR45B-208ENST00000574828 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.98■■■□□ 2.07
WDR45B-208ENST00000574828 TOP2BQ02880 1626 aa27.94■■■□□ 2.06
WDR45B-208ENST00000574828 GRIN2AQ12879 1464 aa27.93■■■□□ 2.06
WDR45B-208ENST00000574828 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.91■■■□□ 2.06
WDR45B-208ENST00000574828 ADAMTS12P58397 1594 aa27.9■■■□□ 2.06
WDR45B-208ENST00000574828 CEP170Q5SW79 1584 aa27.9■■■□□ 2.06
WDR45B-208ENST00000574828 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
WDR45B-208ENST00000574828 NUP160Q12769 1436 aa27.85■■■□□ 2.05
WDR45B-208ENST00000574828 SHROOM2Q13796 1616 aa27.85■■■□□ 2.05
WDR45B-208ENST00000574828 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.75■■■□□ 2.03
WDR45B-208ENST00000574828 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.74■■■□□ 2.03
WDR45B-208ENST00000574828 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.71■■■□□ 2.03
WDR45B-208ENST00000574828 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
WDR45B-208ENST00000574828 JPH4Q96JJ6 628 aa27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms