RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445108.5

ARID4A-208, Transcript of AT-rich interaction domain 4A, humanhuman

TSL 3

Gene ARID4A, Length 965 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4A-208ENST00000445108 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.68■■■■■ 5.38
ARID4A-208ENST00000445108 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.27■■■■■ 4.52
ARID4A-208ENST00000445108 ABCC9O60706 1549 aa42.46■■■■■ 4.39
ARID4A-208ENST00000445108 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.78■■■■■ 4.12
ARID4A-208ENST00000445108 NACADO15069 1562 aa40.71■■■■■ 4.11
ARID4A-208ENST00000445108 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.71■■■■■ 4.11
ARID4A-208ENST00000445108 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
ARID4A-208ENST00000445108 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.46■■■■■ 4.07
ARID4A-208ENST00000445108 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.26■■■■■ 4.03
ARID4A-208ENST00000445108 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.87■■■■□ 3.97
ARID4A-208ENST00000445108 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.67■■■■□ 3.94
ARID4A-208ENST00000445108 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.65■■■■□ 3.94
ARID4A-208ENST00000445108 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.58■■■■□ 3.93
ARID4A-208ENST00000445108 SCRIBQ14160 1630 aa39.49■■■■□ 3.91
ARID4A-208ENST00000445108 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.1■■■■□ 3.85
ARID4A-208ENST00000445108 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.53■■■■□ 3.76
ARID4A-208ENST00000445108 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.39■■■■□ 3.74
ARID4A-208ENST00000445108 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.22■■■■□ 3.71
ARID4A-208ENST00000445108 SMARCA4P51532 1647 aa37.77■■■■□ 3.64
ARID4A-208ENST00000445108 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
ARID4A-208ENST00000445108 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.6■■■■□ 3.61
ARID4A-208ENST00000445108 NCAPD3P42695 1498 aa37.59■■■■□ 3.61
ARID4A-208ENST00000445108 SMARCA2P51531 1590 aa37.52■■■■□ 3.6
ARID4A-208ENST00000445108 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.52■■■■□ 3.6
ARID4A-208ENST00000445108 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.42■■■■□ 3.58
ARID4A-208ENST00000445108 HMGXB3Q12766 1538 aa37.37■■■■□ 3.57
ARID4A-208ENST00000445108 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.56
ARID4A-208ENST00000445108 WIZO95785 1651 aa37.11■■■■□ 3.53
ARID4A-208ENST00000445108 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
ARID4A-208ENST00000445108 NESP48681 1621 aa36.72■■■■□ 3.47
ARID4A-208ENST00000445108 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
ARID4A-208ENST00000445108 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.6■■■■□ 3.45
ARID4A-208ENST00000445108 ERCC6Q03468 1493 aa36.59■■■■□ 3.45
ARID4A-208ENST00000445108 CUX2O14529 1486 aa36.57■■■■□ 3.45
ARID4A-208ENST00000445108 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.49■■■■□ 3.43
ARID4A-208ENST00000445108 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.35■■■■□ 3.41
ARID4A-208ENST00000445108 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.34■■■■□ 3.41
ARID4A-208ENST00000445108 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.29■■■■□ 3.4
ARID4A-208ENST00000445108 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.26■■■■□ 3.4
ARID4A-208ENST00000445108 CFTRP13569 1480 aa36.26■■■■□ 3.4
ARID4A-208ENST00000445108 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
ARID4A-208ENST00000445108 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.06■■■■□ 3.36
ARID4A-208ENST00000445108 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
ARID4A-208ENST00000445108 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.01■■■■□ 3.36
ARID4A-208ENST00000445108 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.98■■■■□ 3.35
ARID4A-208ENST00000445108 PRDM2Q13029 1718 aa35.94■■■■□ 3.34
ARID4A-208ENST00000445108 WDR62O43379 1518 aa35.87■■■■□ 3.33
ARID4A-208ENST00000445108 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
ARID4A-208ENST00000445108 TOPBP1Q92547 1522 aa35.48■■■■□ 3.27
ARID4A-208ENST00000445108 ABCC8Q09428 1581 aa35.46■■■■□ 3.27
ARID4A-208ENST00000445108 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.42■■■■□ 3.26
ARID4A-208ENST00000445108 IFT140Q96RY7 1462 aa35.27■■■■□ 3.24
ARID4A-208ENST00000445108 CUX1P39880 1505 aa35.19■■■■□ 3.22
ARID4A-208ENST00000445108 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
ARID4A-208ENST00000445108 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
ARID4A-208ENST00000445108 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
ARID4A-208ENST00000445108 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.08■■■■□ 3.21
ARID4A-208ENST00000445108 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.04■■■■□ 3.2
ARID4A-208ENST00000445108 SOGA1O94964 1423 aa35.04■■■■□ 3.2
ARID4A-208ENST00000445108 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
ARID4A-208ENST00000445108 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.93■■■■□ 3.184e-6■□□□□ 10.8
ARID4A-208ENST00000445108 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.93■■■■□ 3.18
ARID4A-208ENST00000445108 OSCARQ8IYS5 282 aa34.89■■■■□ 3.18
ARID4A-208ENST00000445108 TOP2BQ02880 1626 aa34.86■■■■□ 3.17
ARID4A-208ENST00000445108 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.86■■■■□ 3.17
ARID4A-208ENST00000445108 SYNJ1O43426 1573 aa34.86■■■■□ 3.17
ARID4A-208ENST00000445108 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
ARID4A-208ENST00000445108 WDR97A6NE52 1622 aa34.79■■■■□ 3.16
ARID4A-208ENST00000445108 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.74■■■■□ 3.15
ARID4A-208ENST00000445108 TRIM41Q8WV44 630 aa34.68■■■■□ 3.14
ARID4A-208ENST00000445108 GRIN2BQ13224 1484 aa34.62■■■■□ 3.13
ARID4A-208ENST00000445108 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.62■■■■□ 3.13
ARID4A-208ENST00000445108 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.6■■■■□ 3.13
ARID4A-208ENST00000445108 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.58■■■■□ 3.13
ARID4A-208ENST00000445108 CHD1O14646 1710 aa34.55■■■■□ 3.12
ARID4A-208ENST00000445108 PBRM1Q86U86 1689 aa34.54■■■■□ 3.12
ARID4A-208ENST00000445108 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
ARID4A-208ENST00000445108 FBLN2P98095 1184 aa34.51■■■■□ 3.12
ARID4A-208ENST00000445108 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
ARID4A-208ENST00000445108 SYNJ2O15056 1496 aa34.4■■■■□ 3.1
ARID4A-208ENST00000445108 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.39■■■■□ 3.1
ARID4A-208ENST00000445108 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.39■■■■□ 3.1
ARID4A-208ENST00000445108 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.39■■■■□ 3.1
ARID4A-208ENST00000445108 ARHGEF11O15085 1522 aa34.32■■■■□ 3.08
ARID4A-208ENST00000445108 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.31■■■■□ 3.08
ARID4A-208ENST00000445108 ADAMTS12P58397 1594 aa34.27■■■■□ 3.08
ARID4A-208ENST00000445108 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.21■■■■□ 3.07
ARID4A-208ENST00000445108 KIF27Q86VH2 1401 aa34.2■■■■□ 3.06
ARID4A-208ENST00000445108 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.19■■■■□ 3.06
ARID4A-208ENST00000445108 GRIN2AQ12879 1464 aa34.18■■■■□ 3.06
ARID4A-208ENST00000445108 IGF1RP08069 1367 aa34.11■■■■□ 3.05
ARID4A-208ENST00000445108 NUP160Q12769 1436 aa34.04■■■■□ 3.04
ARID4A-208ENST00000445108 CEP170Q5SW79 1584 aa34.02■■■■□ 3.04
ARID4A-208ENST00000445108 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.01■■■■□ 3.03
ARID4A-208ENST00000445108 ARAP1Q96P48 1450 aa33.99■■■■□ 3.03
ARID4A-208ENST00000445108 CUL7Q14999 1698 aa33.97■■■■□ 3.03
ARID4A-208ENST00000445108 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.92■■■■□ 3.02
ARID4A-208ENST00000445108 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.88■■■■□ 3.01
ARID4A-208ENST00000445108 SHROOM2Q13796 1616 aa33.79■■■■□ 3
ARID4A-208ENST00000445108 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.73■■■□□ 2.99
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