Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 ARRDC1-204ENST00000461627 882 ntTSL 222.88■■□□□ 1.255e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 ARRDC1-207ENST00000471125 612 ntTSL 322.88■■□□□ 1.255e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PSMA4-215ENST00000559934 2741 ntTSL 1 (best)22.62■■□□□ 1.215e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.195e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.115e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 ARRDC1-211ENST00000495220 747 ntTSL 221.81■■□□□ 1.085e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PSMA4-218ENST00000560099 2596 ntTSL 221.05■□□□□ 0.965e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.865e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.855e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.825e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-206ENST00000553529 562 ntTSL 419.95■□□□□ 0.785e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 ARRDC1-203ENST00000431925 555 ntTSL 319.89■□□□□ 0.775e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 ARRDC1-209ENST00000483563 704 ntTSL 319.87■□□□□ 0.775e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 RPL6-208ENST00000550566 1014 ntTSL 318.74■□□□□ 0.595e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 DDX11-226ENST00000543756 613 ntTSL 318.69■□□□□ 0.585e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.455e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.385e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 AP2A1-204ENST00000594838 611 ntTSL 316.86■□□□□ 0.295e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-204ENST00000553324 566 ntTSL 416.76■□□□□ 0.275e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-231ENST00000557433 1904 ntTSL 1 (best)16.76■□□□□ 0.275e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.275e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.225e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 DDX11-207ENST00000535317 879 ntTSL 316.16■□□□□ 0.185e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-235ENST00000557740 569 ntTSL 416.15■□□□□ 0.185e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-217ENST00000555116 1885 ntTSL 215.42■□□□□ 0.065e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PIBF1-204ENST00000489797 616 ntTSL 315.37■□□□□ 0.055e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-208ENST00000553868 941 ntTSL 215.23■□□□□ 0.035e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.015e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-219ENST00000555563 895 ntTSL 514.98□□□□□ -0.015e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-234ENST00000557703 542 ntTSL 414.84□□□□□ -0.035e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 ZNF318-202ENST00000605935 3836 ntTSL 1 (best)14.45□□□□□ -0.15e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-226ENST00000556825 2215 ntTSL 1 (best)14.3□□□□□ -0.125e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-211ENST00000554310 579 ntTSL 414.3□□□□□ -0.125e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-223ENST00000556689 768 ntTSL 314.05□□□□□ -0.165e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-222ENST00000555774 2311 ntTSL 1 (best)13.93□□□□□ -0.185e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-227ENST00000557269 576 ntTSL 513.78□□□□□ -0.25e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-230ENST00000557427 569 ntTSL 413.62□□□□□ -0.235e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-214ENST00000554604 879 ntTSL 513.56□□□□□ -0.245e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.245e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 TRMT2A-213ENST00000480339 762 ntTSL 213.51□□□□□ -0.255e-8■■■■■ 37.4
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SF3B1O75533 SHMT2-221ENST00000555773 600 ntTSL 213.38□□□□□ -0.275e-8■■■■■ 37.4
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SF3B1O75533 SHMT2-209ENST00000553949 552 ntTSL 313.16□□□□□ -0.35e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-229ENST00000557348 1659 ntTSL 213.13□□□□□ -0.315e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.325e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.355e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PSMA4-219ENST00000560217 944 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.375e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.385e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-207ENST00000553837 2152 ntTSL 512.49□□□□□ -0.415e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.455e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 RNF10-203ENST00000413266 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.465e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.475e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 MSH6-204ENST00000445503 4158 ntTSL 1 (best)12.02□□□□□ -0.485e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-220ENST00000555634 964 ntTSL 512.01□□□□□ -0.495e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 SHMT2-212ENST00000554467 3416 ntTSL 211.92□□□□□ -0.55e-8■■■■■ 37.4
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SF3B1O75533 PSMA4-207ENST00000558635 736 ntTSL 1 (best)11.2□□□□□ -0.625e-8■■■■■ 37.4
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SF3B1O75533 TANC2-201ENST00000389520 6404 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.945e-8■■■■■ 37.4
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SF3B1O75533 TANC2-209ENST00000583356 7841 ntTSL 1 (best)9.09□□□□□ -0.955e-8■■■■■ 37.4
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SF3B1O75533 PSMA4-213ENST00000559437 756 ntTSL 58.85□□□□□ -0.995e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PSMA4-210ENST00000559146 674 ntTSL 28.78□□□□□ -15e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 RNF10-223ENST00000545419 1336 ntTSL 58.55□□□□□ -1.045e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PSMA4-208ENST00000558639 733 ntTSL 38.17□□□□□ -1.15e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 TANC2-210ENST00000583545 3018 ntTSL 28.13□□□□□ -1.115e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.185e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 GOLT1B-209ENST00000545113 555 ntTSL 27.68□□□□□ -1.185e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PSMA4-217ENST00000560033 570 ntTSL 47.35□□□□□ -1.235e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 RNF10-206ENST00000535470 760 ntTSL 37.19□□□□□ -1.265e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PSMA4-203ENST00000557929 635 ntTSL 57.11□□□□□ -1.275e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.315e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.315e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 ZNF318-203ENST00000606599 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 26.83□□□□□ -1.325e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 RNF10-211ENST00000538254 661 ntTSL 36.61□□□□□ -1.355e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 RPL6-210ENST00000551291 700 ntTSL 36.61□□□□□ -1.355e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 RNF10-220ENST00000543757 315 ntTSL 55.74□□□□□ -1.495e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.555e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.615e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PSMA4-220ENST00000560737 815 ntTSL 54.32□□□□□ -1.725e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 NPM1-206ENST00000519955 571 ntTSL 23.73□□□□□ -1.815e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.855e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.955e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PSMA4-221ENST00000560842 574 ntTSL 1 (best)2.69□□□□□ -1.985e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.115e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 ERBIN-215ENST00000511671 589 ntTSL 30.89□□□□□ -2.275e-8■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 37.4
SF3B1O75533 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 37.4
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