Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms