Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.911e-9■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.34e-6■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.164e-6■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 BRCC3-204ENST00000369462 2846 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.74e-6■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 BRCC3-207ENST00000411985 688 ntTSL 59.14□□□□□ -0.954e-6■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 BRCC3-210ENST00000630295 954 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -14e-6■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 BRCC3-206ENST00000399042 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -14e-6■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.254e-6■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 BRCC3-208ENST00000453705 2694 ntTSL 57.14□□□□□ -1.274e-6■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.384e-6■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.382e-6■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 AP001107.9-203ENST00000580881 762 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.742e-6■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.113e-6■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 PTK2-218ENST00000519993 4388 ntTSL 1 (best)16.89■□□□□ 0.32e-8■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.312e-8■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.292e-8■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.372e-8■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.382e-8■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 UBE3A-222ENST00000630907 889 ntTSL 525.66■■□□□ 1.77e-11■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 UBE3A-213ENST00000626793 733 ntTSL 522.56■■□□□ 1.27e-11■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 UBE3A-218ENST00000629252 1112 ntTSL 520.41■□□□□ 0.867e-11■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 UBE3A-215ENST00000628267 779 ntTSL 520.12■□□□□ 0.817e-11■■■■□ 22.7
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ILF3Q12906 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.047e-11■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.027e-11■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.137e-11■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.187e-11■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.27e-11■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.287e-11■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.337e-11■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.397e-11■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.437e-11■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.617e-11■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 UBE3A-219ENST00000629886 436 ntTSL 34.46□□□□□ -1.77e-11■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.827e-11■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 UBE3A-216ENST00000628733 706 ntTSL 52.83□□□□□ -1.967e-11■■■■□ 22.7
ILF3Q12906 EXOC6-204ENST00000443748 3310 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.072e-6■■■■□ 22.6
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ILF3Q12906 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.942e-6■■■■□ 22.6
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ILF3Q12906 PHF3-205ENST00000494284 2854 ntTSL 211.52□□□□□ -0.573e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 PHF3-201ENST00000262043 8233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.83e-7■■■■□ 22.6
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ILF3Q12906 PHF3-210ENST00000509876 7124 ntTSL 1 (best)5.19□□□□□ -1.583e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.873e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.331e-11■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.821e-11■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 DCAKD-207ENST00000593094 1000 ntTSL 227.44■■□□□ 1.981e-7■■■■□ 22.6
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ILF3Q12906 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.251e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.741e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 DCAKD-204ENST00000588295 727 ntTSL 219.66■□□□□ 0.741e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.681e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.241e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.011e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.161e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 DCAKD-202ENST00000342350 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.421e-7■■■■□ 22.6
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ILF3Q12906 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.081e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.22e-6■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.852e-6■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 TSPAN14-208ENST00000469149 959 ntTSL 217.67■□□□□ 0.421e-6■■■■□ 22.6
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ILF3Q12906 PDIA6-203ENST00000404371 2682 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.862e-6■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 PDIA6-202ENST00000381611 2534 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.862e-6■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.195e-6■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 CDK5RAP2-212ENST00000480112 5826 ntTSL 1 (best)12.47□□□□□ -0.415e-6■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.575e-6■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 CDK5RAP2-203ENST00000360822 5551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.915e-6■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 CDK5RAP2-209ENST00000473282 5956 ntTSL 1 (best)8.56□□□□□ -1.045e-6■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 EP400NL-203ENST00000392352 2172 ntTSL 222.66■■□□□ 1.228e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 EP400NL-205ENST00000443539 1756 ntTSL 221.93■■□□□ 1.18e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 EP400NL-202ENST00000389560 1726 ntTSL 1 (best)21.36■■□□□ 1.018e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 EP400NL-204ENST00000407361 945 ntTSL 321.32■■□□□ 18e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 EP400NL-211ENST00000539205 583 ntTSL 319.4■□□□□ 0.78e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 EP400NL-207ENST00000454179 781 ntTSL 219.02■□□□□ 0.648e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 EP400NL-201ENST00000332441 2741 ntTSL 217.71■□□□□ 0.438e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 EP400NL-209ENST00000488030 1366 ntTSL 217.49■□□□□ 0.398e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.368e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 ABL1-202ENST00000372348 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.581e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 ABL1-203ENST00000393293 532 ntTSL 55.23□□□□□ -1.571e-7■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.812e-6■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.182e-6■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 ZNF670-201ENST00000366503 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.493e-6■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 ZNF670-ZNF695-201ENST00000465049 1042 ntAPPRIS P5 TSL 510.54□□□□□ -0.723e-6■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 ZNF670-ZNF695-202ENST00000474541 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.183e-6■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.022e-6■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.292e-6■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 CRCP-202ENST00000360415 3139 ntTSL 1 (best)12.84□□□□□ -0.352e-6■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 AC068533.4-201ENST00000450043 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 22.6
ILF3Q12906 ING5-203ENST00000433036 415 ntTSL 315.96■□□□□ 0.154e-8■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.024e-9■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 SMYD3-207ENST00000462422 971 ntTSL 512.81□□□□□ -0.364e-9■■■■□ 22.5
ILF3Q12906 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.184e-9■■■■□ 22.5
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