Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.462e-7■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.572e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 SAFB-209ENST00000591666 632 ntTSL 331.1■■■□□ 2.572e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 SAFB-204ENST00000586934 995 ntTSL 529.68■■■□□ 2.342e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 ZFPM2-202ENST00000511341 1582 ntTSL 1 (best)29.56■■■□□ 2.322e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.732e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 DENND6A-202ENST00000464875 420 ntTSL 224.82■■□□□ 1.562e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 TERT-203ENST00000460137 2992 ntTSL 1 (best)24.79■■□□□ 1.562e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 SAFB-207ENST00000589863 2708 ntTSL 223.07■■□□□ 1.282e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.172e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.922e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.912e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.92e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.842e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.692e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.662e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.632e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.442e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.392e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 AP005328.1-203ENST00000579835 508 ntTSL 515.99■□□□□ 0.152e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 AP005328.1-202ENST00000580781 776 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.072e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 LINC01572-206ENST00000624829 1666 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.132e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 AP005328.1-201ENST00000577719 681 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.222e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 LINC01572-201ENST00000561611 2194 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.372e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 LINC01572-204ENST00000570035 831 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.622e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.752e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.262e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 SAFB-208ENST00000590485 548 ntTSL 36.13□□□□□ -1.432e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.472e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.744e-7■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.684e-7■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.054e-7■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 GSR-203ENST00000523295 913 ntTSL 322.75■■□□□ 1.234e-7■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.074e-7■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 GSR-202ENST00000521479 582 ntTSL 316.02■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 ZNF644-211ENST00000498303 514 ntTSL 1 (best)22.33■■□□□ 1.178e-7■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 ZNF680-203ENST00000470847 564 ntTSL 46.32□□□□□ -1.48e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 CD46-214ENST00000480003 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.059e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 CD46-202ENST00000322918 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.299e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.599e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.689e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.79e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.829e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.839e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.859e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.859e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.869e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 CD46-212ENST00000469535 7826 ntTSL 1 (best)8.96□□□□□ -0.979e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 TMBIM6-205ENST00000546885 578 ntTSL 429.09■■■□□ 2.255e-9■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.423e-6■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 TACC3-204ENST00000466077 583 ntTSL 226.18■■□□□ 1.783e-6■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 TACC3-210ENST00000485989 726 ntTSL 320.24■□□□□ 0.833e-6■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 TACC3-209ENST00000484651 2715 ntTSL 216.83■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 TACC3-206ENST00000470136 650 ntTSL 316.24■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 RPRD1B-208ENST00000618318 567 ntTSL 411.5□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 RPRD1B-207ENST00000614670 659 ntTSL 36.15□□□□□ -1.426e-7■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 SMAD5-207ENST00000511116 847 ntTSL 1 (best)37.07■■■■□ 3.523e-6■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 SMAD5-202ENST00000507118 669 ntTSL 1 (best)37.07■■■■□ 3.523e-6■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 SMAD5-205ENST00000509297 854 ntTSL 1 (best)24.77■■□□□ 1.563e-6■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 SMAD5-206ENST00000509962 547 ntTSL 423.97■■□□□ 1.433e-6■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 SMAD5-209ENST00000514777 588 ntTSL 321.56■■□□□ 1.043e-6■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 SMAD5-210ENST00000515005 368 ntTSL 1 (best)19.9■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 SMAD5-201ENST00000506223 548 ntTSL 410.08□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 CLMN-202ENST00000553733 565 ntTSL 429.24■■■□□ 2.276e-7■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 CLMN-204ENST00000555615 685 ntTSL 513.45□□□□□ -0.266e-7■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.236e-7■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 LRP12-202ENST00000424843 4092 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.436e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 LRP12-205ENST00000520770 853 ntTSL 1 (best)16.36■□□□□ 0.216e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 LRP12-201ENST00000276654 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.426e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 LRP12-204ENST00000519675 5008 ntTSL 210.3□□□□□ -0.766e-8■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 RAG1-203ENST00000534663 3707 ntTSL 1 (best)9.04□□□□□ -0.964e-7■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 ZNF780B-206ENST00000598845 401 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.116e-7■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 ZNF780B-201ENST00000221355 3538 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.356e-7■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 ZNF780B-205ENST00000595995 393 ntTSL 510.59□□□□□ -0.716e-7■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.686e-7■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.686e-7■■■■■ 28.4
HNRNPMP52272 IGF2BP2-205ENST00000461957 509 ntTSL 521.48■■□□□ 1.031e-7■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.911e-7■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 IGF2BP2-208ENST00000466476 469 ntTSL 219.75■□□□□ 0.751e-7■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 IGF2BP2-203ENST00000421047 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 IGF2BP2-209ENST00000493302 358 ntTSL 58.65□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 CTDSPL2-203ENST00000558791 591 ntTSL 417.11■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 CTDSPL2-205ENST00000558968 583 ntTSL 516.63■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 CTDSPL2-208ENST00000559793 575 ntTSL 513.13□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 CTDSPL2-210ENST00000560834 571 ntTSL 410.79□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.843e-7■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 HSD17B4-203ENST00000442060 2686 ntTSL 520.09■□□□□ 0.813e-7■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.653e-7■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.463e-7■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 HSD17B4-221ENST00000515235 5540 ntTSL 211.7□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.823e-7■■■■■ 28.3
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 285.6 ms