Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 GRN-208ENST00000587387 614 ntTSL 414.48□□□□□ -0.093e-8■■■■■ 29.9
RPS3P23396 GRN-206ENST00000586782 843 ntTSL 513.33□□□□□ -0.283e-8■■■■■ 29.9
RPS3P23396 GRN-213ENST00000588237 558 ntTSL 512.82□□□□□ -0.363e-8■■■■■ 29.9
RPS3P23396 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 29.9
RPS3P23396 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 29.9
RPS3P23396 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 29.9
RPS3P23396 COPG1-205ENST00000509889 599 ntTSL 510.11□□□□□ -0.798e-7■■■■■ 29.9
RPS3P23396 MDH2-207ENST00000490105 569 ntTSL 321.42■■□□□ 1.028e-18■■■■■ 29.9
RPS3P23396 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.44e-8■■■■■ 29.8
RPS3P23396 UPF1-203ENST00000594504 559 ntTSL 312.04□□□□□ -0.483e-7■■■■■ 29.8
RPS3P23396 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.962e-8■■■■■ 29.8
RPS3P23396 CALM1-206ENST00000553630 1420 ntTSL 517.88■□□□□ 0.452e-8■■■■■ 29.8
RPS3P23396 CALM1-213ENST00000556757 588 ntTSL 215.99■□□□□ 0.152e-8■■■■■ 29.8
RPS3P23396 CALM1-208ENST00000553995 583 ntTSL 215.99■□□□□ 0.152e-8■■■■■ 29.8
RPS3P23396 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.152e-8■■■■■ 29.8
RPS3P23396 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 29.8
RPS3P23396 CALM1-214ENST00000557020 557 ntTSL 412.55□□□□□ -0.42e-8■■■■■ 29.8
RPS3P23396 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.52e-8■■■■■ 29.8
RPS3P23396 HP-217ENST00000576168 1067 ntTSL 212.07□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 29.8
RPS3P23396 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 29.8
RPS3P23396 SCARB2-203ENST00000502908 2552 ntTSL 218.09■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 29.8
RPS3P23396 SCARB2-213ENST00000638680 5817 ntTSL 517.95■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 29.8
RPS3P23396 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 29.8
RPS3P23396 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 29.8
RPS3P23396 SCARB2-210ENST00000638567 4415 ntTSL 215.98■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 29.8
RPS3P23396 SCARB2-221ENST00000640341 3403 ntTSL 514.14□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 29.8
RPS3P23396 SCARB2-216ENST00000639300 4554 ntTSL 513.83□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 29.8
RPS3P23396 SCARB2-208ENST00000638372 4811 ntTSL 513.76□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 29.8
RPS3P23396 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 29.8
RPS3P23396 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 29.8
RPS3P23396 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 29.8
RPS3P23396 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.497e-8■■■■■ 29.8
RPS3P23396 EIF4A1-217ENST00000581384 642 ntTSL 59.96□□□□□ -0.823e-12■■■■■ 29.8
RPS3P23396 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.022e-15■■■■■ 29.8
RPS3P23396 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.746e-8■■■■■ 29.8
RPS3P23396 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.546e-8■■■■■ 29.8
RPS3P23396 CAPNS1-209ENST00000590049 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.2□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 29.8
RPS3P23396 CAPNS1-202ENST00000586851 616 ntTSL 37.61□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 29.8
RPS3P23396 CAPNS1-210ENST00000590211 403 ntTSL 53.85□□□□□ -1.791e-6■■■■■ 29.8
RPS3P23396 NDUFB8-204ENST00000464651 390 ntTSL 210.53□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 29.7
RPS3P23396 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.566e-16■■■■■ 29.7
RPS3P23396 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.26e-16■■■■■ 29.7
RPS3P23396 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.386e-16■■■■■ 29.7
RPS3P23396 IDH1-202ENST00000415282 942 ntTSL 216.72■□□□□ 0.279e-13■■■■■ 29.7
RPS3P23396 ZWINT-205ENST00000460654 830 ntTSL 314.67□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 29.7
RPS3P23396 ZWINT-201ENST00000318387 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 29.7
RPS3P23396 ZWINT-207ENST00000478181 793 ntTSL 37.93□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 29.7
RPS3P23396 SERBP1-208ENST00000493607 615 ntTSL 222.64■■□□□ 1.214e-8■■■■■ 29.7
RPS3P23396 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.974e-8■■■■■ 29.7
RPS3P23396 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.784e-8■■■■■ 29.7
RPS3P23396 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.354e-8■■■■■ 29.7
RPS3P23396 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.14e-8■■■■■ 29.7
RPS3P23396 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.871e-11■■■■■ 29.7
RPS3P23396 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 29.6
RPS3P23396 RUVBL2-209ENST00000596837 682 ntTSL 221.26■□□□□ 0.994e-7■■■■■ 29.6
RPS3P23396 F11R-205ENST00000602966 558 ntTSL 414.72□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 29.6
RPS3P23396 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.122e-9■■■■■ 29.6
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RPS3P23396 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.185e-8■■■■■ 29.6
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RPS3P23396 UROD-205ENST00000460906 820 ntTSL 513.64□□□□□ -0.236e-10■■■■■ 29.6
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RPS3P23396 UROD-204ENST00000460334 663 ntTSL 58.8□□□□□ -16e-10■■■■■ 29.6
RPS3P23396 TMEM14C-204ENST00000495549 479 ntTSL 211.5□□□□□ -0.579e-8■■■■■ 29.6
RPS3P23396 PPT1-214ENST00000641381 618 nt5.41□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 29.6
RPS3P23396 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.43e-9■■■■■ 29.6
RPS3P23396 CNPY2-210ENST00000551720 586 ntTSL 318.93■□□□□ 0.624e-7■■■■■ 29.6
RPS3P23396 AC073896.1-203ENST00000548360 512 ntTSL 418.93■□□□□ 0.624e-7■■■■■ 29.6
RPS3P23396 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 29.6
RPS3P23396 CNPY2-206ENST00000548013 817 ntTSL 1 (best)17.25■□□□□ 0.354e-7■■■■■ 29.6
RPS3P23396 AC073896.1-202ENST00000547423 566 ntTSL 417.13■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 29.6
RPS3P23396 CNPY2-211ENST00000553164 666 ntTSL 516.05■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 29.6
RPS3P23396 CNPY2-209ENST00000551475 674 ntTSL 511.37□□□□□ -0.594e-7■■■■■ 29.6
RPS3P23396 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.683e-7■■■■■ 29.6
RPS3P23396 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 29.6
RPS3P23396 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.043e-7■■■■■ 29.6
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RPS3P23396 G6PC-204ENST00000592383 987 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -13e-8■■■■■ 29.6
RPS3P23396 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.343e-8■■■■■ 29.6
RPS3P23396 PRDX2-205ENST00000478908 413 ntTSL 210.91□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 29.5
RPS3P23396 MPDU1-211ENST00000572936 1102 ntTSL 517.72■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 29.5
RPS3P23396 MPDU1-202ENST00000359822 840 ntTSL 312.29□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 29.5
RPS3P23396 MPDU1-222ENST00000581886 924 ntTSL 310.47□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 29.5
RPS3P23396 MPDU1-207ENST00000571822 1020 ntTSL 210.06□□□□□ -0.81e-6■■■■■ 29.5
RPS3P23396 MPDU1-215ENST00000576272 809 ntTSL 27.76□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 29.5
RPS3P23396 MPDU1-209ENST00000572719 917 ntTSL 57.63□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 29.5
RPS3P23396 BUD23-217ENST00000487006 631 ntTSL 320.97■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 29.5
RPS3P23396 BUD23-210ENST00000441822 632 ntTSL 318.37■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 29.5
RPS3P23396 BUD23-216ENST00000478670 572 ntTSL 418.27■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 29.5
RPS3P23396 TXNRD1-206ENST00000524698 1933 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 29.5
RPS3P23396 TXNRD1-215ENST00000526950 1847 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 29.5
RPS3P23396 TXNRD1-217ENST00000527688 3858 ntTSL 210.1□□□□□ -0.794e-7■■■■■ 29.5
RPS3P23396 TPP1-206ENST00000524903 556 ntTSL 415.3■□□□□ 0.049e-11■■■■■ 29.5
RPS3P23396 TPP1-213ENST00000531754 610 ntTSL 213.84□□□□□ -0.199e-11■■■■■ 29.5
RPS3P23396 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.289e-11■■■■■ 29.5
RPS3P23396 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.453e-7■■■■■ 29.5
RPS3P23396 BANF1-207ENST00000530204 586 ntTSL 59.11□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 29.5
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