RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572936.5

MPDU1-211, Transcript of mannose-P-dolichol utilization defect 1, humanhuman

TSL 5

Gene MPDU1, Length 1,102 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPDU1-211ENST00000572936 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.59■■■■■ 4.73
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MPDU1-211ENST00000572936 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.81■■■■□ 3.96
MPDU1-211ENST00000572936 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.94■■■■□ 3.66
MPDU1-211ENST00000572936 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.74■■■■□ 3.63
MPDU1-211ENST00000572936 NACADO15069 1562 aa37.69■■■■□ 3.62
MPDU1-211ENST00000572936 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.31■■■■□ 3.56
MPDU1-211ENST00000572936 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.19■■■■□ 3.54
MPDU1-211ENST00000572936 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.18■■■■□ 3.54
MPDU1-211ENST00000572936 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
MPDU1-211ENST00000572936 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.91■■■■□ 3.5
MPDU1-211ENST00000572936 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.87■■■■□ 3.49
MPDU1-211ENST00000572936 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.74■■■■□ 3.47
MPDU1-211ENST00000572936 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.35■■■■□ 3.41
MPDU1-211ENST00000572936 SCRIBQ14160 1630 aa36.34■■■■□ 3.41
MPDU1-211ENST00000572936 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.94■■■■□ 3.34
MPDU1-211ENST00000572936 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.92■■■■□ 3.34
MPDU1-211ENST00000572936 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
MPDU1-211ENST00000572936 NCAPD3P42695 1498 aa34.82■■■■□ 3.16
MPDU1-211ENST00000572936 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.71■■■■□ 3.15
MPDU1-211ENST00000572936 SMARCA4P51532 1647 aa34.67■■■■□ 3.14
MPDU1-211ENST00000572936 SMARCA2P51531 1590 aa34.63■■■■□ 3.13
MPDU1-211ENST00000572936 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
MPDU1-211ENST00000572936 HMGXB3Q12766 1538 aa34.52■■■■□ 3.12
MPDU1-211ENST00000572936 ERCC6Q03468 1493 aa34.48■■■■□ 3.11
MPDU1-211ENST00000572936 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
MPDU1-211ENST00000572936 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.35■■■■□ 3.09
MPDU1-211ENST00000572936 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.33■■■■□ 3.09
MPDU1-211ENST00000572936 CUX2O14529 1486 aa34.32■■■■□ 3.08
MPDU1-211ENST00000572936 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.28■■■■□ 3.08
MPDU1-211ENST00000572936 NESP48681 1621 aa34.22■■■■□ 3.07
MPDU1-211ENST00000572936 WIZO95785 1651 aa34.01■■■■□ 3.04
MPDU1-211ENST00000572936 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34■■■■□ 3.03
MPDU1-211ENST00000572936 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.9■■■■□ 3.02
MPDU1-211ENST00000572936 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.87■■■■□ 3.01
MPDU1-211ENST00000572936 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.81■■■■□ 3
MPDU1-211ENST00000572936 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.78■■■■□ 3
MPDU1-211ENST00000572936 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.69■■■□□ 2.98
MPDU1-211ENST00000572936 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
MPDU1-211ENST00000572936 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.54■■■□□ 2.96
MPDU1-211ENST00000572936 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.44■■■□□ 2.94
MPDU1-211ENST00000572936 WDR62O43379 1518 aa33.4■■■□□ 2.94
MPDU1-211ENST00000572936 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.4■■■□□ 2.94
MPDU1-211ENST00000572936 CFTRP13569 1480 aa33.39■■■□□ 2.94
MPDU1-211ENST00000572936 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.19■■■□□ 2.9
MPDU1-211ENST00000572936 PRDM2Q13029 1718 aa33.13■■■□□ 2.89
MPDU1-211ENST00000572936 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
MPDU1-211ENST00000572936 OSCARQ8IYS5 282 aa32.88■■■□□ 2.85
MPDU1-211ENST00000572936 TRIM41Q8WV44 630 aa32.88■■■□□ 2.85
MPDU1-211ENST00000572936 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.84■■■□□ 2.85
MPDU1-211ENST00000572936 IFT140Q96RY7 1462 aa32.77■■■□□ 2.84
MPDU1-211ENST00000572936 ABCC8Q09428 1581 aa32.75■■■□□ 2.83
MPDU1-211ENST00000572936 TOPBP1Q92547 1522 aa32.74■■■□□ 2.83
MPDU1-211ENST00000572936 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
MPDU1-211ENST00000572936 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.62■■■□□ 2.81
MPDU1-211ENST00000572936 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.78
MPDU1-211ENST00000572936 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.42■■■□□ 2.782e-6■■■■■ 43
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MPDU1-211ENST00000572936 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
MPDU1-211ENST00000572936 SOGA1O94964 1423 aa32.34■■■□□ 2.77
MPDU1-211ENST00000572936 FBLN2P98095 1184 aa32.34■■■□□ 2.77
MPDU1-211ENST00000572936 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.31■■■□□ 2.76
MPDU1-211ENST00000572936 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
MPDU1-211ENST00000572936 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.26■■■□□ 2.76
MPDU1-211ENST00000572936 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.26■■■□□ 2.76
MPDU1-211ENST00000572936 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.26■■■□□ 2.76
MPDU1-211ENST00000572936 CUX1P39880 1505 aa32.24■■■□□ 2.75
MPDU1-211ENST00000572936 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.23■■■□□ 2.75
MPDU1-211ENST00000572936 ARHGEF11O15085 1522 aa32.21■■■□□ 2.75
MPDU1-211ENST00000572936 CHD1O14646 1710 aa32.13■■■□□ 2.73
MPDU1-211ENST00000572936 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.11■■■□□ 2.73
MPDU1-211ENST00000572936 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
MPDU1-211ENST00000572936 WDR97A6NE52 1622 aa32.1■■■□□ 2.73
MPDU1-211ENST00000572936 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.08■■■□□ 2.73
MPDU1-211ENST00000572936 GRIN2BQ13224 1484 aa32.03■■■□□ 2.72
MPDU1-211ENST00000572936 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
MPDU1-211ENST00000572936 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.99■■■□□ 2.71
MPDU1-211ENST00000572936 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.96■■■□□ 2.71
MPDU1-211ENST00000572936 TOP2BQ02880 1626 aa31.96■■■□□ 2.71
MPDU1-211ENST00000572936 SYNJ1O43426 1573 aa31.93■■■□□ 2.7
MPDU1-211ENST00000572936 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.92■■■□□ 2.7
MPDU1-211ENST00000572936 SYNJ2O15056 1496 aa31.91■■■□□ 2.7
MPDU1-211ENST00000572936 ARAP1Q96P48 1450 aa31.89■■■□□ 2.7
MPDU1-211ENST00000572936 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.86■■■□□ 2.69
MPDU1-211ENST00000572936 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.82■■■□□ 2.68
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MPDU1-211ENST00000572936 PBRM1Q86U86 1689 aa31.79■■■□□ 2.68
MPDU1-211ENST00000572936 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.78■■■□□ 2.68
MPDU1-211ENST00000572936 GRIN2AQ12879 1464 aa31.59■■■□□ 2.65
MPDU1-211ENST00000572936 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.54■■■□□ 2.64
MPDU1-211ENST00000572936 ADAMTS12P58397 1594 aa31.51■■■□□ 2.64
MPDU1-211ENST00000572936 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.48■■■□□ 2.63
MPDU1-211ENST00000572936 NUP160Q12769 1436 aa31.46■■■□□ 2.63
MPDU1-211ENST00000572936 CEP170Q5SW79 1584 aa31.42■■■□□ 2.62
MPDU1-211ENST00000572936 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.32■■■□□ 2.6
MPDU1-211ENST00000572936 KIF27Q86VH2 1401 aa31.3■■■□□ 2.6
MPDU1-211ENST00000572936 JPH4Q96JJ6 628 aa31.26■■■□□ 2.59
MPDU1-211ENST00000572936 SHROOM2Q13796 1616 aa31.24■■■□□ 2.59
MPDU1-211ENST00000572936 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
MPDU1-211ENST00000572936 CUL7Q14999 1698 aa31.2■■■□□ 2.59
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