Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2J1Q9Y385 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2J1Q9Y385 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2J1Q9Y385 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2J1Q9Y385 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2J1Q9Y385 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2J1Q9Y385 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2J1Q9Y385 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2J1Q9Y385 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2J1Q9Y385 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2J1Q9Y385 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2J1Q9Y385 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2J1Q9Y385 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2J1Q9Y385 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2J1Q9Y385 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2J1Q9Y385 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2J1Q9Y385 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2J1Q9Y385 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2J1Q9Y385 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2J1Q9Y385 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2J1Q9Y385 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2J1Q9Y385 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2J1Q9Y385 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2J1Q9Y385 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2J1Q9Y385 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2J1Q9Y385 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2J1Q9Y385 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2J1Q9Y385 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2J1Q9Y385 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2J1Q9Y385 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2J1Q9Y385 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2J1Q9Y385 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2J1Q9Y385 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2J1Q9Y385 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2J1Q9Y385 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2J1Q9Y385 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2J1Q9Y385 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2J1Q9Y385 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2J1Q9Y385 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2J1Q9Y385 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2J1Q9Y385 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2J1Q9Y385 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2J1Q9Y385 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2J1Q9Y385 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2J1Q9Y385 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2J1Q9Y385 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2J1Q9Y385 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2J1Q9Y385 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2J1Q9Y385 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2J1Q9Y385 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2J1Q9Y385 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2J1Q9Y385 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2J1Q9Y385 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2J1Q9Y385 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2J1Q9Y385 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2J1Q9Y385 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2J1Q9Y385 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2J1Q9Y385 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2J1Q9Y385 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2J1Q9Y385 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2J1Q9Y385 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2J1Q9Y385 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2J1Q9Y385 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2J1Q9Y385 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2J1Q9Y385 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2J1Q9Y385 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2J1Q9Y385 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2J1Q9Y385 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2J1Q9Y385 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2J1Q9Y385 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2J1Q9Y385 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2J1Q9Y385 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2J1Q9Y385 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2J1Q9Y385 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2J1Q9Y385 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2J1Q9Y385 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2J1Q9Y385 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2J1Q9Y385 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2J1Q9Y385 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2J1Q9Y385 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2J1Q9Y385 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2J1Q9Y385 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2J1Q9Y385 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2J1Q9Y385 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2J1Q9Y385 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2J1Q9Y385 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2J1Q9Y385 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2J1Q9Y385 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2J1Q9Y385 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2J1Q9Y385 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2J1Q9Y385 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2J1Q9Y385 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2J1Q9Y385 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2J1Q9Y385 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2J1Q9Y385 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2J1Q9Y385 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2J1Q9Y385 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2J1Q9Y385 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2J1Q9Y385 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2J1Q9Y385 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms