Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A8Q9Y2E8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9A8Q9Y2E8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9A8Q9Y2E8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9A8Q9Y2E8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A8Q9Y2E8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A8Q9Y2E8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A8Q9Y2E8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A8Q9Y2E8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A8Q9Y2E8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A8Q9Y2E8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A8Q9Y2E8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A8Q9Y2E8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A8Q9Y2E8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A8Q9Y2E8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC9A8Q9Y2E8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A8Q9Y2E8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A8Q9Y2E8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A8Q9Y2E8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A8Q9Y2E8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A8Q9Y2E8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A8Q9Y2E8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A8Q9Y2E8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A8Q9Y2E8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A8Q9Y2E8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A8Q9Y2E8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A8Q9Y2E8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A8Q9Y2E8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A8Q9Y2E8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A8Q9Y2E8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A8Q9Y2E8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A8Q9Y2E8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A8Q9Y2E8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A8Q9Y2E8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A8Q9Y2E8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A8Q9Y2E8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A8Q9Y2E8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A8Q9Y2E8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A8Q9Y2E8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A8Q9Y2E8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A8Q9Y2E8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A8Q9Y2E8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A8Q9Y2E8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A8Q9Y2E8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A8Q9Y2E8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A8Q9Y2E8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A8Q9Y2E8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A8Q9Y2E8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A8Q9Y2E8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A8Q9Y2E8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9A8Q9Y2E8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC9A8Q9Y2E8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC9A8Q9Y2E8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A8Q9Y2E8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A8Q9Y2E8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A8Q9Y2E8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A8Q9Y2E8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A8Q9Y2E8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A8Q9Y2E8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A8Q9Y2E8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A8Q9Y2E8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A8Q9Y2E8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A8Q9Y2E8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A8Q9Y2E8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A8Q9Y2E8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A8Q9Y2E8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A8Q9Y2E8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A8Q9Y2E8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A8Q9Y2E8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A8Q9Y2E8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A8Q9Y2E8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC9A8Q9Y2E8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A8Q9Y2E8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A8Q9Y2E8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A8Q9Y2E8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A8Q9Y2E8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A8Q9Y2E8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A8Q9Y2E8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A8Q9Y2E8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A8Q9Y2E8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A8Q9Y2E8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A8Q9Y2E8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A8Q9Y2E8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A8Q9Y2E8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A8Q9Y2E8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A8Q9Y2E8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A8Q9Y2E8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A8Q9Y2E8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A8Q9Y2E8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A8Q9Y2E8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A8Q9Y2E8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A8Q9Y2E8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A8Q9Y2E8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A8Q9Y2E8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms