Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y242

TCF19, Transcription factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF19Q9Y242 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF19Q9Y242 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF19Q9Y242 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF19Q9Y242 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF19Q9Y242 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF19Q9Y242 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF19Q9Y242 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TCF19Q9Y242 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF19Q9Y242 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF19Q9Y242 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF19Q9Y242 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF19Q9Y242 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF19Q9Y242 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF19Q9Y242 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF19Q9Y242 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF19Q9Y242 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF19Q9Y242 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF19Q9Y242 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TCF19Q9Y242 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF19Q9Y242 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF19Q9Y242 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF19Q9Y242 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF19Q9Y242 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF19Q9Y242 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF19Q9Y242 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF19Q9Y242 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF19Q9Y242 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF19Q9Y242 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF19Q9Y242 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF19Q9Y242 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF19Q9Y242 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF19Q9Y242 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF19Q9Y242 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF19Q9Y242 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF19Q9Y242 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF19Q9Y242 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF19Q9Y242 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF19Q9Y242 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF19Q9Y242 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF19Q9Y242 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF19Q9Y242 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF19Q9Y242 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF19Q9Y242 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF19Q9Y242 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF19Q9Y242 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF19Q9Y242 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF19Q9Y242 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF19Q9Y242 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF19Q9Y242 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF19Q9Y242 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF19Q9Y242 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF19Q9Y242 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF19Q9Y242 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF19Q9Y242 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF19Q9Y242 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF19Q9Y242 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF19Q9Y242 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF19Q9Y242 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF19Q9Y242 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF19Q9Y242 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF19Q9Y242 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF19Q9Y242 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF19Q9Y242 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF19Q9Y242 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF19Q9Y242 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF19Q9Y242 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF19Q9Y242 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF19Q9Y242 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF19Q9Y242 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF19Q9Y242 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF19Q9Y242 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF19Q9Y242 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF19Q9Y242 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF19Q9Y242 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF19Q9Y242 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF19Q9Y242 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF19Q9Y242 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF19Q9Y242 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF19Q9Y242 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF19Q9Y242 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF19Q9Y242 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF19Q9Y242 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF19Q9Y242 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF19Q9Y242 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF19Q9Y242 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF19Q9Y242 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF19Q9Y242 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF19Q9Y242 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF19Q9Y242 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF19Q9Y242 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF19Q9Y242 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF19Q9Y242 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF19Q9Y242 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF19Q9Y242 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF19Q9Y242 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF19Q9Y242 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF19Q9Y242 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCF19Q9Y242 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCF19Q9Y242 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCF19Q9Y242 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms