Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAPRE3Q9UPY8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAPRE3Q9UPY8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAPRE3Q9UPY8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAPRE3Q9UPY8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAPRE3Q9UPY8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAPRE3Q9UPY8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAPRE3Q9UPY8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAPRE3Q9UPY8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAPRE3Q9UPY8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAPRE3Q9UPY8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAPRE3Q9UPY8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MAPRE3Q9UPY8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MAPRE3Q9UPY8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MAPRE3Q9UPY8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MAPRE3Q9UPY8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MAPRE3Q9UPY8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MAPRE3Q9UPY8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MAPRE3Q9UPY8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAPRE3Q9UPY8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAPRE3Q9UPY8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAPRE3Q9UPY8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAPRE3Q9UPY8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAPRE3Q9UPY8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAPRE3Q9UPY8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAPRE3Q9UPY8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAPRE3Q9UPY8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAPRE3Q9UPY8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAPRE3Q9UPY8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAPRE3Q9UPY8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAPRE3Q9UPY8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAPRE3Q9UPY8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAPRE3Q9UPY8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAPRE3Q9UPY8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAPRE3Q9UPY8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAPRE3Q9UPY8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAPRE3Q9UPY8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAPRE3Q9UPY8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MAPRE3Q9UPY8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAPRE3Q9UPY8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAPRE3Q9UPY8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAPRE3Q9UPY8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAPRE3Q9UPY8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAPRE3Q9UPY8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAPRE3Q9UPY8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAPRE3Q9UPY8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAPRE3Q9UPY8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAPRE3Q9UPY8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAPRE3Q9UPY8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAPRE3Q9UPY8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MAPRE3Q9UPY8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAPRE3Q9UPY8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAPRE3Q9UPY8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAPRE3Q9UPY8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAPRE3Q9UPY8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAPRE3Q9UPY8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAPRE3Q9UPY8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAPRE3Q9UPY8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAPRE3Q9UPY8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MAPRE3Q9UPY8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAPRE3Q9UPY8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAPRE3Q9UPY8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAPRE3Q9UPY8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAPRE3Q9UPY8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAPRE3Q9UPY8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAPRE3Q9UPY8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAPRE3Q9UPY8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAPRE3Q9UPY8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAPRE3Q9UPY8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAPRE3Q9UPY8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAPRE3Q9UPY8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAPRE3Q9UPY8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAPRE3Q9UPY8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAPRE3Q9UPY8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAPRE3Q9UPY8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MAPRE3Q9UPY8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAPRE3Q9UPY8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAPRE3Q9UPY8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAPRE3Q9UPY8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAPRE3Q9UPY8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAPRE3Q9UPY8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAPRE3Q9UPY8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAPRE3Q9UPY8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAPRE3Q9UPY8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAPRE3Q9UPY8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAPRE3Q9UPY8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAPRE3Q9UPY8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAPRE3Q9UPY8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MAPRE3Q9UPY8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAPRE3Q9UPY8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAPRE3Q9UPY8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAPRE3Q9UPY8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAPRE3Q9UPY8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAPRE3Q9UPY8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MAPRE3Q9UPY8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAPRE3Q9UPY8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAPRE3Q9UPY8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAPRE3Q9UPY8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAPRE3Q9UPY8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MAPRE3Q9UPY8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms