Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MAPRE3Q9UPY8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
MAPRE3Q9UPY8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
MAPRE3Q9UPY8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
MAPRE3Q9UPY8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
MAPRE3Q9UPY8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MAPRE3Q9UPY8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MAPRE3Q9UPY8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
MAPRE3Q9UPY8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MAPRE3Q9UPY8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
MAPRE3Q9UPY8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
MAPRE3Q9UPY8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
MAPRE3Q9UPY8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MAPRE3Q9UPY8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MAPRE3Q9UPY8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MAPRE3Q9UPY8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MAPRE3Q9UPY8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
MAPRE3Q9UPY8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MAPRE3Q9UPY8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MAPRE3Q9UPY8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MAPRE3Q9UPY8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MAPRE3Q9UPY8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MAPRE3Q9UPY8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MAPRE3Q9UPY8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MAPRE3Q9UPY8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MAPRE3Q9UPY8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MAPRE3Q9UPY8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MAPRE3Q9UPY8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAPRE3Q9UPY8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAPRE3Q9UPY8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAPRE3Q9UPY8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAPRE3Q9UPY8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAPRE3Q9UPY8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MAPRE3Q9UPY8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MAPRE3Q9UPY8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MAPRE3Q9UPY8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MAPRE3Q9UPY8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MAPRE3Q9UPY8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MAPRE3Q9UPY8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MAPRE3Q9UPY8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MAPRE3Q9UPY8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MAPRE3Q9UPY8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MAPRE3Q9UPY8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MAPRE3Q9UPY8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAPRE3Q9UPY8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MAPRE3Q9UPY8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MAPRE3Q9UPY8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MAPRE3Q9UPY8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAPRE3Q9UPY8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MAPRE3Q9UPY8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAPRE3Q9UPY8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MAPRE3Q9UPY8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAPRE3Q9UPY8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MAPRE3Q9UPY8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MAPRE3Q9UPY8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MAPRE3Q9UPY8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAPRE3Q9UPY8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MAPRE3Q9UPY8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MAPRE3Q9UPY8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAPRE3Q9UPY8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAPRE3Q9UPY8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAPRE3Q9UPY8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAPRE3Q9UPY8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAPRE3Q9UPY8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAPRE3Q9UPY8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAPRE3Q9UPY8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAPRE3Q9UPY8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAPRE3Q9UPY8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MAPRE3Q9UPY8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAPRE3Q9UPY8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAPRE3Q9UPY8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAPRE3Q9UPY8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAPRE3Q9UPY8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAPRE3Q9UPY8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAPRE3Q9UPY8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAPRE3Q9UPY8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAPRE3Q9UPY8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MAPRE3Q9UPY8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAPRE3Q9UPY8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MAPRE3Q9UPY8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAPRE3Q9UPY8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MAPRE3Q9UPY8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAPRE3Q9UPY8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAPRE3Q9UPY8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MAPRE3Q9UPY8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAPRE3Q9UPY8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MAPRE3Q9UPY8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
MAPRE3Q9UPY8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAPRE3Q9UPY8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MAPRE3Q9UPY8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MAPRE3Q9UPY8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MAPRE3Q9UPY8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAPRE3Q9UPY8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAPRE3Q9UPY8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAPRE3Q9UPY8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAPRE3Q9UPY8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAPRE3Q9UPY8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAPRE3Q9UPY8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAPRE3Q9UPY8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAPRE3Q9UPY8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms