Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCG2Q9UNQ0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCG2Q9UNQ0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCG2Q9UNQ0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCG2Q9UNQ0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCG2Q9UNQ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCG2Q9UNQ0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCG2Q9UNQ0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCG2Q9UNQ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCG2Q9UNQ0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCG2Q9UNQ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCG2Q9UNQ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCG2Q9UNQ0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCG2Q9UNQ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCG2Q9UNQ0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCG2Q9UNQ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCG2Q9UNQ0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCG2Q9UNQ0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCG2Q9UNQ0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCG2Q9UNQ0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCG2Q9UNQ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCG2Q9UNQ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCG2Q9UNQ0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCG2Q9UNQ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCG2Q9UNQ0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCG2Q9UNQ0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCG2Q9UNQ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCG2Q9UNQ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCG2Q9UNQ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCG2Q9UNQ0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCG2Q9UNQ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCG2Q9UNQ0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCG2Q9UNQ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCG2Q9UNQ0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCG2Q9UNQ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCG2Q9UNQ0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCG2Q9UNQ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCG2Q9UNQ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCG2Q9UNQ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCG2Q9UNQ0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCG2Q9UNQ0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCG2Q9UNQ0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCG2Q9UNQ0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCG2Q9UNQ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCG2Q9UNQ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCG2Q9UNQ0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCG2Q9UNQ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCG2Q9UNQ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCG2Q9UNQ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCG2Q9UNQ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCG2Q9UNQ0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCG2Q9UNQ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCG2Q9UNQ0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ABCG2Q9UNQ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCG2Q9UNQ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCG2Q9UNQ0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCG2Q9UNQ0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCG2Q9UNQ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCG2Q9UNQ0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCG2Q9UNQ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCG2Q9UNQ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCG2Q9UNQ0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCG2Q9UNQ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCG2Q9UNQ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCG2Q9UNQ0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCG2Q9UNQ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCG2Q9UNQ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCG2Q9UNQ0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCG2Q9UNQ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCG2Q9UNQ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCG2Q9UNQ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCG2Q9UNQ0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCG2Q9UNQ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ABCG2Q9UNQ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCG2Q9UNQ0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG2Q9UNQ0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG2Q9UNQ0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG2Q9UNQ0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG2Q9UNQ0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG2Q9UNQ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG2Q9UNQ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCG2Q9UNQ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCG2Q9UNQ0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCG2Q9UNQ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCG2Q9UNQ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG2Q9UNQ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG2Q9UNQ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCG2Q9UNQ0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCG2Q9UNQ0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCG2Q9UNQ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCG2Q9UNQ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCG2Q9UNQ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCG2Q9UNQ0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCG2Q9UNQ0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCG2Q9UNQ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCG2Q9UNQ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCG2Q9UNQ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCG2Q9UNQ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCG2Q9UNQ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCG2Q9UNQ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms