Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC4AQ9UMR7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC4AQ9UMR7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC4AQ9UMR7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC4AQ9UMR7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC4AQ9UMR7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC4AQ9UMR7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC4AQ9UMR7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC4AQ9UMR7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC4AQ9UMR7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC4AQ9UMR7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC4AQ9UMR7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC4AQ9UMR7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC4AQ9UMR7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4AQ9UMR7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4AQ9UMR7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4AQ9UMR7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4AQ9UMR7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLEC4AQ9UMR7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLEC4AQ9UMR7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLEC4AQ9UMR7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLEC4AQ9UMR7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLEC4AQ9UMR7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLEC4AQ9UMR7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLEC4AQ9UMR7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLEC4AQ9UMR7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLEC4AQ9UMR7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLEC4AQ9UMR7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC4AQ9UMR7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC4AQ9UMR7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLEC4AQ9UMR7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLEC4AQ9UMR7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLEC4AQ9UMR7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLEC4AQ9UMR7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC4AQ9UMR7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC4AQ9UMR7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC4AQ9UMR7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC4AQ9UMR7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC4AQ9UMR7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC4AQ9UMR7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC4AQ9UMR7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLEC4AQ9UMR7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLEC4AQ9UMR7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC4AQ9UMR7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC4AQ9UMR7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLEC4AQ9UMR7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLEC4AQ9UMR7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLEC4AQ9UMR7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLEC4AQ9UMR7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLEC4AQ9UMR7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLEC4AQ9UMR7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLEC4AQ9UMR7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLEC4AQ9UMR7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLEC4AQ9UMR7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC4AQ9UMR7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC4AQ9UMR7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC4AQ9UMR7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC4AQ9UMR7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC4AQ9UMR7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC4AQ9UMR7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC4AQ9UMR7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC4AQ9UMR7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC4AQ9UMR7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC4AQ9UMR7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC4AQ9UMR7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC4AQ9UMR7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC4AQ9UMR7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC4AQ9UMR7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC4AQ9UMR7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC4AQ9UMR7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC4AQ9UMR7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC4AQ9UMR7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC4AQ9UMR7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC4AQ9UMR7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC4AQ9UMR7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC4AQ9UMR7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC4AQ9UMR7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC4AQ9UMR7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC4AQ9UMR7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms