Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLXNB3Q9ULL4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLXNB3Q9ULL4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PLXNB3Q9ULL4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PLXNB3Q9ULL4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLXNB3Q9ULL4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLXNB3Q9ULL4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLXNB3Q9ULL4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PLXNB3Q9ULL4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLXNB3Q9ULL4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLXNB3Q9ULL4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLXNB3Q9ULL4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLXNB3Q9ULL4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PLXNB3Q9ULL4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLXNB3Q9ULL4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLXNB3Q9ULL4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLXNB3Q9ULL4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLXNB3Q9ULL4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNB3Q9ULL4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNB3Q9ULL4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNB3Q9ULL4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNB3Q9ULL4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNB3Q9ULL4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNB3Q9ULL4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNB3Q9ULL4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNB3Q9ULL4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXNB3Q9ULL4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXNB3Q9ULL4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXNB3Q9ULL4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXNB3Q9ULL4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXNB3Q9ULL4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLXNB3Q9ULL4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLXNB3Q9ULL4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLXNB3Q9ULL4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXNB3Q9ULL4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXNB3Q9ULL4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXNB3Q9ULL4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNB3Q9ULL4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNB3Q9ULL4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNB3Q9ULL4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNB3Q9ULL4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNB3Q9ULL4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNB3Q9ULL4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNB3Q9ULL4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNB3Q9ULL4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNB3Q9ULL4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNB3Q9ULL4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNB3Q9ULL4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNB3Q9ULL4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLXNB3Q9ULL4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLXNB3Q9ULL4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLXNB3Q9ULL4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXNB3Q9ULL4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXNB3Q9ULL4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXNB3Q9ULL4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PLXNB3Q9ULL4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLXNB3Q9ULL4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PLXNB3Q9ULL4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLXNB3Q9ULL4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNB3Q9ULL4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNB3Q9ULL4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNB3Q9ULL4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNB3Q9ULL4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNB3Q9ULL4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNB3Q9ULL4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNB3Q9ULL4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNB3Q9ULL4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PLXNB3Q9ULL4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNB3Q9ULL4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNB3Q9ULL4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLXNB3Q9ULL4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLXNB3Q9ULL4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLXNB3Q9ULL4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLXNB3Q9ULL4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PLXNB3Q9ULL4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLXNB3Q9ULL4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLXNB3Q9ULL4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLXNB3Q9ULL4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLXNB3Q9ULL4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLXNB3Q9ULL4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLXNB3Q9ULL4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLXNB3Q9ULL4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLXNB3Q9ULL4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLXNB3Q9ULL4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PLXNB3Q9ULL4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PLXNB3Q9ULL4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PLXNB3Q9ULL4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PLXNB3Q9ULL4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PLXNB3Q9ULL4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLXNB3Q9ULL4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLXNB3Q9ULL4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNB3Q9ULL4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNB3Q9ULL4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNB3Q9ULL4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNB3Q9ULL4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLXNB3Q9ULL4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLXNB3Q9ULL4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLXNB3Q9ULL4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLXNB3Q9ULL4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms