Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB23Q9ULC3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB23Q9ULC3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB23Q9ULC3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB23Q9ULC3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB23Q9ULC3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB23Q9ULC3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB23Q9ULC3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB23Q9ULC3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB23Q9ULC3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB23Q9ULC3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB23Q9ULC3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RAB23Q9ULC3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RAB23Q9ULC3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RAB23Q9ULC3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB23Q9ULC3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB23Q9ULC3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB23Q9ULC3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB23Q9ULC3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB23Q9ULC3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAB23Q9ULC3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB23Q9ULC3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB23Q9ULC3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB23Q9ULC3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB23Q9ULC3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB23Q9ULC3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB23Q9ULC3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB23Q9ULC3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB23Q9ULC3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB23Q9ULC3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB23Q9ULC3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB23Q9ULC3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB23Q9ULC3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB23Q9ULC3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB23Q9ULC3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB23Q9ULC3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB23Q9ULC3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB23Q9ULC3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB23Q9ULC3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB23Q9ULC3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB23Q9ULC3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB23Q9ULC3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB23Q9ULC3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB23Q9ULC3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB23Q9ULC3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB23Q9ULC3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB23Q9ULC3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB23Q9ULC3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB23Q9ULC3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB23Q9ULC3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB23Q9ULC3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB23Q9ULC3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB23Q9ULC3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB23Q9ULC3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB23Q9ULC3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB23Q9ULC3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB23Q9ULC3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB23Q9ULC3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB23Q9ULC3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB23Q9ULC3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB23Q9ULC3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB23Q9ULC3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB23Q9ULC3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB23Q9ULC3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB23Q9ULC3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB23Q9ULC3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB23Q9ULC3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB23Q9ULC3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RAB23Q9ULC3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB23Q9ULC3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB23Q9ULC3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB23Q9ULC3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB23Q9ULC3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB23Q9ULC3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB23Q9ULC3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB23Q9ULC3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB23Q9ULC3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB23Q9ULC3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB23Q9ULC3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB23Q9ULC3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB23Q9ULC3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB23Q9ULC3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB23Q9ULC3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB23Q9ULC3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB23Q9ULC3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB23Q9ULC3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB23Q9ULC3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB23Q9ULC3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB23Q9ULC3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB23Q9ULC3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB23Q9ULC3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB23Q9ULC3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB23Q9ULC3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB23Q9ULC3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB23Q9ULC3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB23Q9ULC3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB23Q9ULC3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB23Q9ULC3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB23Q9ULC3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB23Q9ULC3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms