Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
NRXN1Q9ULB1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
NRXN1Q9ULB1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
NRXN1Q9ULB1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
NRXN1Q9ULB1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
NRXN1Q9ULB1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NRXN1Q9ULB1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
NRXN1Q9ULB1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
NRXN1Q9ULB1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
NRXN1Q9ULB1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
NRXN1Q9ULB1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
NRXN1Q9ULB1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
NRXN1Q9ULB1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
NRXN1Q9ULB1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
NRXN1Q9ULB1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
NRXN1Q9ULB1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
NRXN1Q9ULB1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
NRXN1Q9ULB1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
NRXN1Q9ULB1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
NRXN1Q9ULB1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
NRXN1Q9ULB1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
NRXN1Q9ULB1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
NRXN1Q9ULB1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NRXN1Q9ULB1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
NRXN1Q9ULB1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
NRXN1Q9ULB1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NRXN1Q9ULB1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
NRXN1Q9ULB1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
NRXN1Q9ULB1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
NRXN1Q9ULB1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NRXN1Q9ULB1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NRXN1Q9ULB1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NRXN1Q9ULB1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NRXN1Q9ULB1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NRXN1Q9ULB1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
NRXN1Q9ULB1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
NRXN1Q9ULB1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
NRXN1Q9ULB1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NRXN1Q9ULB1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
NRXN1Q9ULB1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
NRXN1Q9ULB1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
NRXN1Q9ULB1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NRXN1Q9ULB1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
NRXN1Q9ULB1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
NRXN1Q9ULB1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NRXN1Q9ULB1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
NRXN1Q9ULB1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NRXN1Q9ULB1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
NRXN1Q9ULB1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
NRXN1Q9ULB1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NRXN1Q9ULB1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NRXN1Q9ULB1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
NRXN1Q9ULB1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
NRXN1Q9ULB1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
NRXN1Q9ULB1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
NRXN1Q9ULB1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
NRXN1Q9ULB1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
NRXN1Q9ULB1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
NRXN1Q9ULB1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
NRXN1Q9ULB1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
NRXN1Q9ULB1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
NRXN1Q9ULB1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
NRXN1Q9ULB1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NRXN1Q9ULB1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NRXN1Q9ULB1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.64■■■■□ 3.78
NRXN1Q9ULB1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
NRXN1Q9ULB1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
NRXN1Q9ULB1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
NRXN1Q9ULB1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
NRXN1Q9ULB1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
NRXN1Q9ULB1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NRXN1Q9ULB1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
NRXN1Q9ULB1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NRXN1Q9ULB1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NRXN1Q9ULB1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NRXN1Q9ULB1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
NRXN1Q9ULB1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
NRXN1Q9ULB1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
NRXN1Q9ULB1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NRXN1Q9ULB1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
NRXN1Q9ULB1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
NRXN1Q9ULB1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
NRXN1Q9ULB1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
NRXN1Q9ULB1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NRXN1Q9ULB1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
NRXN1Q9ULB1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
NRXN1Q9ULB1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
NRXN1Q9ULB1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
NRXN1Q9ULB1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
NRXN1Q9ULB1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
NRXN1Q9ULB1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
NRXN1Q9ULB1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
NRXN1Q9ULB1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NRXN1Q9ULB1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NRXN1Q9ULB1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC38.47■■■■□ 3.75
NRXN1Q9ULB1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NRXN1Q9ULB1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NRXN1Q9ULB1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NRXN1Q9ULB1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NRXN1Q9ULB1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms