Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ1

PILRA, Paired immunoglobulin-like type 2 receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PILRAQ9UKJ1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PILRAQ9UKJ1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PILRAQ9UKJ1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PILRAQ9UKJ1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PILRAQ9UKJ1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PILRAQ9UKJ1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PILRAQ9UKJ1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PILRAQ9UKJ1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PILRAQ9UKJ1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PILRAQ9UKJ1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PILRAQ9UKJ1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PILRAQ9UKJ1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PILRAQ9UKJ1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PILRAQ9UKJ1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PILRAQ9UKJ1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PILRAQ9UKJ1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PILRAQ9UKJ1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PILRAQ9UKJ1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PILRAQ9UKJ1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PILRAQ9UKJ1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PILRAQ9UKJ1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PILRAQ9UKJ1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PILRAQ9UKJ1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PILRAQ9UKJ1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PILRAQ9UKJ1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PILRAQ9UKJ1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PILRAQ9UKJ1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PILRAQ9UKJ1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PILRAQ9UKJ1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PILRAQ9UKJ1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PILRAQ9UKJ1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PILRAQ9UKJ1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PILRAQ9UKJ1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PILRAQ9UKJ1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PILRAQ9UKJ1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PILRAQ9UKJ1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PILRAQ9UKJ1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PILRAQ9UKJ1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PILRAQ9UKJ1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PILRAQ9UKJ1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PILRAQ9UKJ1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PILRAQ9UKJ1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PILRAQ9UKJ1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PILRAQ9UKJ1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PILRAQ9UKJ1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PILRAQ9UKJ1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PILRAQ9UKJ1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PILRAQ9UKJ1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PILRAQ9UKJ1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PILRAQ9UKJ1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PILRAQ9UKJ1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PILRAQ9UKJ1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PILRAQ9UKJ1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PILRAQ9UKJ1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PILRAQ9UKJ1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PILRAQ9UKJ1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PILRAQ9UKJ1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PILRAQ9UKJ1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PILRAQ9UKJ1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PILRAQ9UKJ1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PILRAQ9UKJ1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PILRAQ9UKJ1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PILRAQ9UKJ1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PILRAQ9UKJ1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PILRAQ9UKJ1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PILRAQ9UKJ1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PILRAQ9UKJ1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PILRAQ9UKJ1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PILRAQ9UKJ1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PILRAQ9UKJ1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PILRAQ9UKJ1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PILRAQ9UKJ1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PILRAQ9UKJ1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PILRAQ9UKJ1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PILRAQ9UKJ1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PILRAQ9UKJ1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PILRAQ9UKJ1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PILRAQ9UKJ1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PILRAQ9UKJ1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PILRAQ9UKJ1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PILRAQ9UKJ1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PILRAQ9UKJ1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PILRAQ9UKJ1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PILRAQ9UKJ1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PILRAQ9UKJ1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PILRAQ9UKJ1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PILRAQ9UKJ1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PILRAQ9UKJ1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PILRAQ9UKJ1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PILRAQ9UKJ1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PILRAQ9UKJ1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PILRAQ9UKJ1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PILRAQ9UKJ1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PILRAQ9UKJ1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PILRAQ9UKJ1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PILRAQ9UKJ1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PILRAQ9UKJ1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PILRAQ9UKJ1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PILRAQ9UKJ1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PILRAQ9UKJ1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms