Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK85

DKKL1, Dickkopf-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKKL1Q9UK85 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DKKL1Q9UK85 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DKKL1Q9UK85 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DKKL1Q9UK85 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DKKL1Q9UK85 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DKKL1Q9UK85 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DKKL1Q9UK85 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DKKL1Q9UK85 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DKKL1Q9UK85 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DKKL1Q9UK85 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DKKL1Q9UK85 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DKKL1Q9UK85 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DKKL1Q9UK85 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DKKL1Q9UK85 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DKKL1Q9UK85 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DKKL1Q9UK85 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DKKL1Q9UK85 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DKKL1Q9UK85 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DKKL1Q9UK85 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DKKL1Q9UK85 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DKKL1Q9UK85 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DKKL1Q9UK85 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DKKL1Q9UK85 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DKKL1Q9UK85 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DKKL1Q9UK85 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DKKL1Q9UK85 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DKKL1Q9UK85 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DKKL1Q9UK85 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DKKL1Q9UK85 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DKKL1Q9UK85 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DKKL1Q9UK85 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DKKL1Q9UK85 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DKKL1Q9UK85 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DKKL1Q9UK85 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DKKL1Q9UK85 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DKKL1Q9UK85 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DKKL1Q9UK85 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DKKL1Q9UK85 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DKKL1Q9UK85 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DKKL1Q9UK85 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DKKL1Q9UK85 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DKKL1Q9UK85 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DKKL1Q9UK85 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DKKL1Q9UK85 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DKKL1Q9UK85 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DKKL1Q9UK85 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DKKL1Q9UK85 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DKKL1Q9UK85 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DKKL1Q9UK85 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DKKL1Q9UK85 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DKKL1Q9UK85 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DKKL1Q9UK85 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DKKL1Q9UK85 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DKKL1Q9UK85 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DKKL1Q9UK85 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DKKL1Q9UK85 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DKKL1Q9UK85 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKKL1Q9UK85 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DKKL1Q9UK85 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DKKL1Q9UK85 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKKL1Q9UK85 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKKL1Q9UK85 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKKL1Q9UK85 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKKL1Q9UK85 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DKKL1Q9UK85 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DKKL1Q9UK85 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DKKL1Q9UK85 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DKKL1Q9UK85 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DKKL1Q9UK85 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DKKL1Q9UK85 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DKKL1Q9UK85 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DKKL1Q9UK85 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DKKL1Q9UK85 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DKKL1Q9UK85 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DKKL1Q9UK85 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DKKL1Q9UK85 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DKKL1Q9UK85 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DKKL1Q9UK85 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DKKL1Q9UK85 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms