Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TUBE1Q9UJT0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
TUBE1Q9UJT0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TUBE1Q9UJT0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TUBE1Q9UJT0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TUBE1Q9UJT0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TUBE1Q9UJT0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TUBE1Q9UJT0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TUBE1Q9UJT0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TUBE1Q9UJT0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TUBE1Q9UJT0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TUBE1Q9UJT0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TUBE1Q9UJT0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TUBE1Q9UJT0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TUBE1Q9UJT0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TUBE1Q9UJT0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TUBE1Q9UJT0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TUBE1Q9UJT0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TUBE1Q9UJT0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TUBE1Q9UJT0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TUBE1Q9UJT0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TUBE1Q9UJT0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TUBE1Q9UJT0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
TUBE1Q9UJT0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TUBE1Q9UJT0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TUBE1Q9UJT0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TUBE1Q9UJT0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TUBE1Q9UJT0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TUBE1Q9UJT0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
TUBE1Q9UJT0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
TUBE1Q9UJT0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TUBE1Q9UJT0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TUBE1Q9UJT0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TUBE1Q9UJT0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TUBE1Q9UJT0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TUBE1Q9UJT0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
TUBE1Q9UJT0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TUBE1Q9UJT0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TUBE1Q9UJT0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TUBE1Q9UJT0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TUBE1Q9UJT0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TUBE1Q9UJT0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TUBE1Q9UJT0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
TUBE1Q9UJT0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
TUBE1Q9UJT0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TUBE1Q9UJT0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TUBE1Q9UJT0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TUBE1Q9UJT0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TUBE1Q9UJT0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TUBE1Q9UJT0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TUBE1Q9UJT0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
TUBE1Q9UJT0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TUBE1Q9UJT0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TUBE1Q9UJT0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TUBE1Q9UJT0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TUBE1Q9UJT0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TUBE1Q9UJT0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TUBE1Q9UJT0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TUBE1Q9UJT0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TUBE1Q9UJT0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TUBE1Q9UJT0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TUBE1Q9UJT0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TUBE1Q9UJT0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TUBE1Q9UJT0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TUBE1Q9UJT0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TUBE1Q9UJT0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TUBE1Q9UJT0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TUBE1Q9UJT0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TUBE1Q9UJT0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TUBE1Q9UJT0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TUBE1Q9UJT0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TUBE1Q9UJT0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TUBE1Q9UJT0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TUBE1Q9UJT0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TUBE1Q9UJT0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TUBE1Q9UJT0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
TUBE1Q9UJT0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
TUBE1Q9UJT0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
TUBE1Q9UJT0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TUBE1Q9UJT0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TUBE1Q9UJT0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TUBE1Q9UJT0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TUBE1Q9UJT0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
TUBE1Q9UJT0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TUBE1Q9UJT0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TUBE1Q9UJT0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TUBE1Q9UJT0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TUBE1Q9UJT0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TUBE1Q9UJT0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TUBE1Q9UJT0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TUBE1Q9UJT0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TUBE1Q9UJT0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TUBE1Q9UJT0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TUBE1Q9UJT0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TUBE1Q9UJT0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TUBE1Q9UJT0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TUBE1Q9UJT0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TUBE1Q9UJT0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TUBE1Q9UJT0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TUBE1Q9UJT0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms