Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
APOBEC3BQ9UH17 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC3BQ9UH17 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC3BQ9UH17 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC3BQ9UH17 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3BQ9UH17 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3BQ9UH17 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC3BQ9UH17 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC3BQ9UH17 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBEC3BQ9UH17 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBEC3BQ9UH17 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBEC3BQ9UH17 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBEC3BQ9UH17 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC3BQ9UH17 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC3BQ9UH17 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3BQ9UH17 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3BQ9UH17 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3BQ9UH17 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3BQ9UH17 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3BQ9UH17 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3BQ9UH17 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC3BQ9UH17 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3BQ9UH17 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3BQ9UH17 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3BQ9UH17 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
APOBEC3BQ9UH17 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
APOBEC3BQ9UH17 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBEC3BQ9UH17 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBEC3BQ9UH17 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3BQ9UH17 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3BQ9UH17 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3BQ9UH17 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3BQ9UH17 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3BQ9UH17 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3BQ9UH17 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3BQ9UH17 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3BQ9UH17 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3BQ9UH17 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBEC3BQ9UH17 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBEC3BQ9UH17 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC3BQ9UH17 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC3BQ9UH17 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3BQ9UH17 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3BQ9UH17 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC3BQ9UH17 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3BQ9UH17 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3BQ9UH17 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3BQ9UH17 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3BQ9UH17 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3BQ9UH17 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3BQ9UH17 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3BQ9UH17 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3BQ9UH17 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
APOBEC3BQ9UH17 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3BQ9UH17 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3BQ9UH17 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3BQ9UH17 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3BQ9UH17 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3BQ9UH17 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3BQ9UH17 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3BQ9UH17 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3BQ9UH17 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3BQ9UH17 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC3BQ9UH17 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC3BQ9UH17 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3BQ9UH17 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBEC3BQ9UH17 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBEC3BQ9UH17 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3BQ9UH17 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBEC3BQ9UH17 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBEC3BQ9UH17 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC3BQ9UH17 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBEC3BQ9UH17 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBEC3BQ9UH17 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3BQ9UH17 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3BQ9UH17 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3BQ9UH17 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBEC3BQ9UH17 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBEC3BQ9UH17 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBEC3BQ9UH17 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBEC3BQ9UH17 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
APOBEC3BQ9UH17 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBEC3BQ9UH17 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBEC3BQ9UH17 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBEC3BQ9UH17 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOBEC3BQ9UH17 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOBEC3BQ9UH17 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBEC3BQ9UH17 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBEC3BQ9UH17 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBEC3BQ9UH17 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBEC3BQ9UH17 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBEC3BQ9UH17 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBEC3BQ9UH17 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBEC3BQ9UH17 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBEC3BQ9UH17 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBEC3BQ9UH17 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBEC3BQ9UH17 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBEC3BQ9UH17 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBEC3BQ9UH17 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBEC3BQ9UH17 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms